CRISPR/Cas9全基因组筛选技术在疾病治疗中的应用及在眼科应用中的展望

CRISPR/Cas9全基因组筛选技术可在全基因组范围内快速筛选具有特定生物学功能的DNA片段,不仅能反映疾病发生、发展过程中目的基因表达的变化,还能为药物进一步开发与应用提供重要依据。目前,该技术已经在肿瘤治疗、耐药性研究及病毒感染等方面得到广泛的应用。在眼科疾病研究中,CRISPR/Cas9基因编辑技术能够对目的基因进行快速精准的编辑,但目前大量编码或非编码序列的功能及疾病耐药机制仍有待进一步探究,全基因组筛选技术的应用将为其发展开辟新的道路。

低氧诱导小胶质细胞代谢进程紊乱的转录组测序分析

目的利用转录组测序技术和生物信息学分析方法研究低氧对小胶质细胞系BV_(2)细胞基因表达水平的影响,探讨低氧诱导BV_(2)细胞代谢紊乱的分子机制。方法分别对1%(体积分数)低氧和21%(体积分数)常氧处理12 h和24 h的BV_(2)细胞进行转录组测序,采用生物信息学分析方法筛选显著差异表达基因(DEGs),并对显著DEGs进行聚类分析、基因本体(GO)功能注释分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及蛋白质相互作用网络(PPI)分析。使用Cytoscape软件筛选与代谢相关的排名前10位的关键基因。利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对关键基因进行验证。结果低氧处理12 h共筛选860个显著DEGs(|log_(2)FC|≥1,Q≤0.05),其中672个上调基因,188个下调基因。KEGG和GO分析发现低氧处理后显著DEGs显著富集在细胞周期、HIF-1信号通路、Rap1信号通路、碳代谢、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、淀粉和蔗糖代谢及氨基酸等代谢进程。低氧组处理24 h共有587个显著DEGs(|log_(2)FC|≥1,Q≤0.05),其中498个上调基因,89个下调基因。KEGG和GO分析显示低氧处理后显著DEGs显著富集在HIF-1信号通路、TGF-β信号通路、IL-17信号通路、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、淀粉和蔗糖代谢和氨基酸等代谢进程。低氧分别处理12 h和24 h,显著DEGs中有410个相同基因,410个相同基因中与代谢相关的前10个关键基因是PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、ALDOART1、HK2、GPI1、ALDOA、ALDOC、GAPDH。RT-qPCR结果显示,低氧能够促进PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、GPI1、ALDOC等代谢相关基因的表达。结论低氧可诱导BV_(2)细胞代谢发生紊乱,这可能主要和PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、GPI1、ALDOC等基因表达异常相关。

真性晶状体囊膜剥脱伴年龄相关性黄斑变性一例

一例77岁男性,双眼视力下降3年。散瞳后双眼前房可见剥脱的、透明的前膜,随眼球转动而飘动,诊断为真性晶状体囊膜剥脱合并有年龄相关性黄斑变性。