铜死亡相关长链非编码RNA可用于预测前列腺癌患者的生化复发

目的:构建一种铜死亡相关的长链非编码RNA(lncRNA)模型,为预测前列腺癌(PCa)患者的生化复发(BCR)提供新的思路和方法。方法:在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载PCa患者的基因表达数据、突变负荷数据和临床资料数据,将临床数据随机分为训练组和验证组。筛选出铜死亡相关lncRNA,并构建由铜死亡相关lncRNA构成的预后风险评分模型。通过无生化复发(BCR-free)生存分析、Logistic回归分析以及独立预后分析等验证模型的有效性,并采用受试者工作特征曲线(ROC)分析、Kaplan-Meier生存曲线、相关性热图等对结果进行可视化。对肿瘤突变负荷(TMB)进行差异性分析和生存分析。最后,评估模型和TMB对PCa患者BCR的预测价值。结果:在训练组中筛选出6种铜死亡相关lncRNA用以构建预后风险评分模型,根据中位值将患者分为高低风险两组。在各组中随着风险评分的增加,发生BCR的患者数目也随之增加,且高风险组的BCR-free时间明显较短(P<0.05);在不同的年龄阶段该模型也表现出良好的鉴别效力(P<0.05);独立预后分析显示该模型是预测PCa患者BCR的可靠且独立的指标,优于其他临床病理学特征。TMB在高低风险组之间存在差异性表达(P<0.01)且与BCR显著相关。低风险评分、低TMB患者具有最高的BCR-free生存率(P<0.01)。结论:成功构建了一个铜死亡相关lncRNA模型,其可较为准确地预测PCa患者的BCR风险,预后风险评分越高患者出现BCR的可能性越大。TMB在高风险组患者中较高,TMB水平对于BCR有一定的提示意义。