利用生物信息学鉴定影响卵巢癌预后的TGF-β信号通路相关基因

目的探讨转化生长因子(TGF-β)信号通路相关基因在卵巢癌中的预后价值。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达集锦(GEO)数据库中的卵巢癌患者转录组测序数据,利用TGF-β信号通路相关基因的表达将卵巢癌患者分组。通过差异表达分析和单因素Cox回归分析鉴定影响卵巢癌预后的TGF-β信号通路相关基因。计算预后基因评分,比较高、低评分组中卵巢癌患者的生存情况,利用多因素Cox回归分析卵巢癌的独立预后因素。结果一致性聚类分析结果表明,根据TGF-β信号通路相关基因可将卵巢癌患者分为两组,两组患者的免疫微环境有差异。差异表达分析和单因素Cox回归分析结果表明GMPR、PIEZO1、EMP1、CXCL13、GADD45B、SORCS2、FOSL2、PODN、LYNX1和SLC38A5是卵巢癌的预后基因,且预后评分是卵巢癌的独立预后因素。结论TGF-β信号通路相关基因可将卵巢癌患者划分为不同的免疫亚型,并可作为卵巢癌的预后标志物。