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基于患者报告结局的慢性阻塞性肺疾病潜在风险分层分析 被引量:1
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作者 张垚烨 李莉芳 +4 位作者 何航帜 姬祎姗 胡象文 张岩波 赵卉 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2024年第3期313-319,共7页
目的:探讨基于患者报告结局的慢性阻塞性肺疾病(COPD)的潜在风险分层。方法:采用便利抽样法在太原市13家医院抽取474例COPD患者进行问卷调查,以COPD患者报告结局调查问卷中的生理、心理和社会领域部分各维度得分作为外显变量,进行潜在... 目的:探讨基于患者报告结局的慢性阻塞性肺疾病(COPD)的潜在风险分层。方法:采用便利抽样法在太原市13家医院抽取474例COPD患者进行问卷调查,以COPD患者报告结局调查问卷中的生理、心理和社会领域部分各维度得分作为外显变量,进行潜在剖面分析(LPA),识别COPD患者潜在风险分层。以生理、心理和社会领域的潜在风险为因变量,以经过单因素筛选的特征为自变量进行Logistic回归分析。结果:经LPA,生理领域有3种潜在风险,474例COPD患者中低特异性(SPE)低独立性(IND)高全身症状(GEN)占比40%,中SPE中IND中GEN占比43%,高SPE高IND低GEN占比17%;已戒烟、职业为工人的患者中SPE中IND中GEN的可能性大于低SPE低IND高GEN,OR(95%CI)为2.909(1.025~8.255)、1.968(1.119~3.460);心理领域支持2种潜在风险,474例中低心理素质占比53%,高心理素质占比47%;无COPD家族史患者心理素质更高,OR(95%CI)为1.871(1.117~3.135)。社会领域支持3种潜在风险,474例中低疾病认知(COG)高疾病对社会活动的影响(INF)高社会支持(SUP)占比44%,中COG中INF中SUP占比26%,高COG低INF低SUP占比30%;知识分子中COG中INF中SUP和高COG低INF低SUP的可能性更大,OR(95%CI)为2.816(1.084~7.316)和3.185(1.131~8.972);农民、工人、管理人员高COG低INF低SUP的可能性更大,OR(95%CI)为2.300(1.156~4.579)、4.092(2.058~8.136)、3.387(1.395~8.220)。结论:本研究分别在生理、心理、社会领域对COPD患者实现了风险分层,为疾病分级管理提供了新依据。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 患者报告结局 潜在剖面分析 风险分层
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加权随机森林和代价敏感支持向量机与心衰患者死亡风险评估 被引量:4
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作者 杨弘 田晶 +6 位作者 孟冰霞 张瑜 罗艳虹 王可 郑楚 韩清华 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2022年第3期381-384,388,共5页
目的 探讨加权随机森林和代价敏感支持向量机模型在慢性心衰死亡风险评估中的应用。方法 利用AUC-RF自变量筛选方法选出与心衰死亡的相关因素,将选出的变量作为输入变量,预后有无死亡作为结局变量构建传统随机森林、支持向量机、logisti... 目的 探讨加权随机森林和代价敏感支持向量机模型在慢性心衰死亡风险评估中的应用。方法 利用AUC-RF自变量筛选方法选出与心衰死亡的相关因素,将选出的变量作为输入变量,预后有无死亡作为结局变量构建传统随机森林、支持向量机、logistic回归、加权随机森林和代价敏感支持向量机分类预测模型。结果 AUC-RF筛选出的变量中有中枢系统疾病史、肾功能不全史、心包积液、BMI、中性粒细胞比值、肾小球滤过率、N端前脑钠肽等指标重要度较高,提示这些指标或有临床意义。评价指标有灵敏度、特异度、准确度、G-means、F-measure和AUC值,logistic模型评价指标的中位数分别为:78.46%、63.19%、81.4%、0.6933、0.467和0.7003;加权随机森林评价指标分别为:78.08%、82.74%、85.96%、0.8086、0.4853和0.8109;代价敏感支持向量机评价指标分别为:75.38%、72.49%、88.8%、0.7402、0.4749和0.7940。结论 加权随机森林模型对心衰患者预后死亡预测性能较高,该模型有助于临床医生识别心衰死亡危险因素,具有较高应用价值。 展开更多
关键词 慢性心衰 疾病预后 加权随机森林 代价敏感支持向量机
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复杂网络社区发现视角下慢性阻塞性肺疾病患者的共病特征分析
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作者 杨青青 何航帜 +4 位作者 李莉芳 王莹 李少凡 赵卉 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第2期181-184,189,共5页
目的探讨不同性别慢性阻塞性肺疾病患者的共病模式,为慢性阻塞性肺疾病患者分层管理提供理论依据。方法选取山西医科大学第二医院2011年12月至2020年5月慢性阻塞性肺疾病患者作为研究对象,横断面收集患者诊断信息建立共病网络,采用Louv... 目的探讨不同性别慢性阻塞性肺疾病患者的共病模式,为慢性阻塞性肺疾病患者分层管理提供理论依据。方法选取山西医科大学第二医院2011年12月至2020年5月慢性阻塞性肺疾病患者作为研究对象,横断面收集患者诊断信息建立共病网络,采用Louvain法对共病网络进行社区划分,并分析比较不同性别患者共病类型、组合及患病率。结果研究表明不同性别患者单个慢性病和共病对的患病率存在差异;各患者群体对应的共病网络和社区结构也不同。结论男性患者共病网络较女性患者共病网络更聚集和复杂,男性患者的共病模式比女性患者更复杂多样,疾病间联系更为紧密,在慢性阻塞性肺疾病患者中更应多关注男性患者,以期减少共病的发生。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 共病 复杂网络 社区发现
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冠心病合并心力衰竭患者死亡风险Cox回归模型分析 被引量:10
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作者 田晶 杨弘 +3 位作者 陈鑫龙 张青 张岩波 韩清华 《中国循证心血管医学杂志》 2020年第6期683-686,共4页
目的 分析冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)合并心力衰竭患者死亡风险及影响因素.方法 连续入选2014年1月至2017年12月冠心病合并心力衰竭患者1484例,随访5年,以死亡为随访终点事件.采用Cox回归方法分析冠心病合并心力衰竭患者死亡的... 目的 分析冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)合并心力衰竭患者死亡风险及影响因素.方法 连续入选2014年1月至2017年12月冠心病合并心力衰竭患者1484例,随访5年,以死亡为随访终点事件.采用Cox回归方法分析冠心病合并心力衰竭患者死亡的影响因素.结果 中位随访时间23个月,死亡170例.单因素Cox回归分析显示,年龄≥60岁、吸烟、饮酒、高脂血症、水肿、收缩压、硝酸酯类药物和PCI治疗是冠心病合并心力衰竭患者死亡的影响因素.多因素Cox回归显示,年龄≥70岁、水肿、陈旧性心肌梗死和PCI治疗是冠心病合并心力衰竭患者死亡的独立预测因子.结论 与以往心力衰竭研究得出一致结论的基础上,证实了PCI治疗和陈旧性心肌梗死为冠心病合并心力衰竭患者死亡的特异性影响因素,为患者的个体化干预和治疗提供依据. 展开更多
关键词 冠心病 心力衰竭 死亡 影响因素
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基于概率校准的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者死亡风险预测 被引量:4
5
作者 范双龙 赵志强 +7 位作者 余红梅 王蕾 郑楚楚 黄雪倩 阳桢寰 邢蒙 吕庆 罗艳虹 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2021年第5期670-674,共5页
目的基于概率校准,预测弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者两年内的死亡风险,为医生决策和临床治疗提供参考。方法使用Cox回归筛选DLBCL患者两年内死亡的影响因素。选择logistic回归(logistic regression, ... 目的基于概率校准,预测弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者两年内的死亡风险,为医生决策和临床治疗提供参考。方法使用Cox回归筛选DLBCL患者两年内死亡的影响因素。选择logistic回归(logistic regression, logit)、随机森林(random forest, RF)、支持向量机(support vector machines, SVM)、前馈神经网络(feedforward neural network, FNN)构建风险预测模型。同时,使用三种概率校准方法对上述模型进行校准:platt scaling(Platt)、isotonic regression(IsoReg)、shape-restricted polynomial regression(RPR)。使用ROC曲线下的面积(AUC)评价模型的区分性能,使用Hosmer-Lemeshow(H-L)goodness-of-fit test、expected calibration error(ECE)、maximum calibration error(MCE)评价模型的校准性能。结果 logit和FNN能够提供准确的概率估计,校准后其预测性能无提升;RF和SVM的预测概率与真实概率的差异具有统计学意义。除SVM-IsoReg外,三种概率校准方法都能对有偏预测进行良好的校准,且RPR校准效果最好。结论 logit和FNN具有良好的校准性能,而RF和SVM校准性能较差,概率校准能够有效降低它们的预测误差。基于概率校准所构建的风险预测模型达到预期效果。 展开更多
关键词 弥漫性大B细胞淋巴瘤 风险预测 概率校准 区分度 校准度
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肝硬化患者并发自发性细菌性腹膜炎的高危特征与潜在风险分析 被引量:6
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作者 李浩 程璠 +2 位作者 郭东星 刘近春 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2020年第5期664-666,671,共4页
目的探索肝硬化并发自发性腹膜炎的高危特征,对具有不同危险特征的肝硬化患者进行潜在聚类,发现高危患者。方法选取高胆红素血症、凝血酶原活动度降低、其他部位感染、腹胀、肝硬化分级为C级、肝性脑病6个自发性腹膜炎危险因素作为显变... 目的探索肝硬化并发自发性腹膜炎的高危特征,对具有不同危险特征的肝硬化患者进行潜在聚类,发现高危患者。方法选取高胆红素血症、凝血酶原活动度降低、其他部位感染、腹胀、肝硬化分级为C级、肝性脑病6个自发性腹膜炎危险因素作为显变量,进行潜在类别分析。结果通过潜在类别分析将6个危险因素分为三个潜在类别,分别为一般组、中危组及高危组。个体聚类后,三组肝硬化患者自发性腹膜炎发生率分别为9.68%、15.91%及27.34%,且差异有统计学意义(χ^2=25.550,P<0.001)。结论本研究构建的潜在类别模型可对具有不同危险因素的肝硬化患者进行聚类,并比较不同类别患者自发性腹膜炎的发病风险,为制定不同类别患者的针对性干预措施提供依据。 展开更多
关键词 自发性腹膜炎 肝硬化 潜在类别分析
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基于层次分类法的弥漫大B细胞淋巴瘤的疾病进展阶段多分类预测研究 被引量:1
7
作者 黄雪倩 张岩波 +7 位作者 王蕾 郑楚楚 余红梅 范双龙 阳桢寰 邢蒙 赵志强 罗艳虹 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2021年第2期167-170,176,共5页
目的对山西省某医院2011-2017年确诊为弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者进行疾病进展阶段多分类预测,为患者是否需要及时转为二线挽救治疗或放疗等治疗手段的选择提供参考。方法用层次分类法将三分类的疾... 目的对山西省某医院2011-2017年确诊为弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma, DLBCL)患者进行疾病进展阶段多分类预测,为患者是否需要及时转为二线挽救治疗或放疗等治疗手段的选择提供参考。方法用层次分类法将三分类的疾病进展阶段进行两层二分类,分别进行变量筛选后,用SMOTE过采样处理数据中的类别不平衡问题,然后使用SVM、BP神经网络、随机森林等单分类器模型与AdaBoost同型集成和Stacking异型集成方法分别构建两层疾病进展阶段的二分类预测模型,最后分别选择两层中分类性能最优的模型并结合在一起。结果使用经SMOTE平衡后的数据构建的两层分类模型中的SVMboost集成模型,准确率分别为0.951和0.972,模型性能均为最优,因此两层二分类的基分类器均选择SVMboost。结论本研究构建弥漫大B细胞淋巴瘤患者疾病进展阶段的层次多分类预测模型,其中两层分类模型中的SVMboost集成模型性能均为最优,将两层二分类的基分类器结合后,准确率为0.924,高于作为对比的直接多分类模型,为临床工作者的诊断与治疗方案选择提供一定参考。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 层次分类法 多分类 不平衡数据
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射血分数恢复型心力衰竭的预测因素和预后评估 被引量:1
8
作者 韩琳艾 田晶 +3 位作者 丁凤琴 王茜 张岩波 韩清华 《中国循证心血管医学杂志》 2022年第11期1316-1319,1324,共5页
目的探讨心力衰竭(心衰)患者射血分数恢复的影响因素,并评估射血分数恢复型心力衰竭(HFrecEF)患者的预后。方法本课题为多中心前瞻性研究,入选2015年1月至2018年12月就诊于山西省3所三甲医院,至少包含2次超声心动图检查结果的射血分数... 目的探讨心力衰竭(心衰)患者射血分数恢复的影响因素,并评估射血分数恢复型心力衰竭(HFrecEF)患者的预后。方法本课题为多中心前瞻性研究,入选2015年1月至2018年12月就诊于山西省3所三甲医院,至少包含2次超声心动图检查结果的射血分数降低型心力衰竭(HFrEF)住院患者。根据心脏超声结果,将患者分为HFrecEF组和持续性射血分数降低的心力衰竭(pHFrEF)组。收集患者一般情况、生物学指标以及院内治疗情况;在患者出院后每隔半年随访1次,最后一次随访时间为2020年12月。随访的终点事件为全因死亡。在单因素分析基础上,采用多因素Logistic回归分析射血分数恢复的影响因素,应用Kaplan-Meier生存曲线评估HFrecEF患者的预后情况。结果Logistic回归分析显示,心衰患者年龄<65岁(OR=0.595,95%CI:0.363~0.976,P<0.05)、未合并冠心病(OR=0.518,95%CI:0.303~0.885,P<0.05)、左心室舒张末期内径(LVEDD)较低(OR=0.418,95%CI:0.248~0.705,P<0.05)与射血分数的恢复有关。Kaplan-Meier曲线显示,HFrecEF组的累计生存率高于pHFrEF组。结论年龄<65岁、未合并冠心病、LVEDD较低的患者射血分数恢复的可能性大;HFrecEF患者的预后较pHFrEF患者明显改善。因此在临床中要早期识别目标人群并尽早干预,以改善心衰患者预后。 展开更多
关键词 射血分数恢复型心力衰竭 影响因素 预后
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基于metaPRS与APOEε4优化轻度认知障碍遗传风险统计建模策略的应用研究 被引量:1
9
作者 李梓盟 王荣 +4 位作者 陈帅 赵彩丽 王晓聪 温雅璐 刘龙 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2023年第25期3104-3111,共8页
背景轻度认知障碍(MCI)是干预和延缓痴呆进展的重要阶段,既往研究发现MCI与遗传因素存在紧密关联,且载脂蛋白E(APOE)ε4是医学界公认的MCI重要风险等位基因。由于缺少MCI的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,当前普遍以阿尔茨海默病(AD)的... 背景轻度认知障碍(MCI)是干预和延缓痴呆进展的重要阶段,既往研究发现MCI与遗传因素存在紧密关联,且载脂蛋白E(APOE)ε4是医学界公认的MCI重要风险等位基因。由于缺少MCI的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,当前普遍以阿尔茨海默病(AD)的GWAS汇总数据作为Base数据集来计算MCI的多基因风险评分(PRS),致使MCI的PRS遗传风险预测效果并不理想。目的本研究以多基因遗传风险综合评分(metaPRS)与APOEε4作为重要预测因子,从广义线性模型与机器学习角度,探索并优化MCI的遗传风险统计建模策略。方法计算MCI的12个亚表型PRS,并利用弹性网状Logistic回归模型将其整合为MCI的metaPRS。利用年龄矫正的APOEε4效应量计算APOEε4加权总和(SCORE_(APOE))。以metaPRS、SCORE_(APOE)及基本人口学信息(年龄、性别、受教育程度)构建不同的预测因子纳入策略,以XGBoost、GBM、Logistic回归及Lasso回归作为统计建模方法,采用AUC及F-measure评价MCI遗传风险统计建模的预测效果。结果metaPRS与SCORE_(APOE)对于MCI的遗传风险有较高的预测价值,纳入metaPRS、SCORE_(APOE)及基本人口学信息(年龄、性别、受教育程度)后,各个统计建模方法的预测效果为:XGBoost(AUC=0.69,F-measure=0.88),GBM(AUC=0.76,F-measure=0.87),Logistic回归(AUC=0.77,F-measure=0.89),Lasso回归(AUC=0.76,F-measure=0.92)。结论在样本量为325(<500)的情况下,以metaPRS、SCOR_(EAPOE)与基本人口学信息为预测因子,以Lasso回归为统计建模方法的MCI遗传风险预测效果最好。本研究为MCI等复杂疾病的遗传风险统计建模提供了新的思路与视角。 展开更多
关键词 轻度认知障碍 多基因风险评分 多基因遗传风险综合评分 载脂蛋白Eε4 遗传风险预测 统计建模优化
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ADASYN与类别逆比例加权法在阿尔茨海默病不平衡数据中的应用
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作者 杨慧 易付良 +7 位作者 陈杜荣 秦瑶 韩红娟 崔靖 白文琳 马艺菲 张荣 余红梅 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第2期175-180,共6页
目的利用自适应合成抽样(adaptive synthetic sampling,ADASYN)与类别逆比例加权法处理类别不平衡数据,结合分类器构建模型对阿尔茨海默病(alzheimer′s disease,AD)患者疾病进程进行分类预测。方法数据源自阿尔茨海默病神经影像学计划(... 目的利用自适应合成抽样(adaptive synthetic sampling,ADASYN)与类别逆比例加权法处理类别不平衡数据,结合分类器构建模型对阿尔茨海默病(alzheimer′s disease,AD)患者疾病进程进行分类预测。方法数据源自阿尔茨海默病神经影像学计划(Alzheimer′s disease neuroimaging initiative,ADNI),经随机森林填补缺失值,弹性网络筛选特征子集后,利用ADASYN与类别逆比例加权法处理类别不平衡数据。分别结合随机森林(random forest,RF)、支持向量机(support vector machine,SVM)构建四种模型:ADASYN-RF、ADASYN-SVM、加权随机森林(weighted random forest,WRF)、加权支持向量机(weighted support vector machine,WSVM),与RF、SVM比较分类性能。模型评价指标为宏观平均精确率(macro-average of precision,macro-P)、宏观平均召回率(macro-average of recall,macro-R)、宏观平均F1值(macro-average of F1-score,macro-F1)、准确率(accuracy,ACC)、Kappa值和AUC(area under the ROC curve)。结果ADASYN-RF的分类性能最优(Kappa值为0.938,AUC为0.980),ADASYN-SVM次之。利用ADASYN-RF预测得到的重要分类特征分别为CDRSB、LDELTOTAL、MMSE,在临床上均可得到证实。结论ADASYN与类别逆比例加权法都能辅助提升分类器性能,但ADASYN算法更优。 展开更多
关键词 类别不平衡 ADASYN 加权法 阿尔茨海默病 分类
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结合环论的粒子群优化算法进行冠心病合并慢性心衰预后分析
11
作者 张瑜 田晶 +3 位作者 杨弘 韩港飞 韩清华 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第1期53-57,共5页
目的 采用结合环论的粒子群优化算法(hybridization of ring theory-based evolutionary algorithm and particle swarm optimization, RTPSO)对数据进行均衡化处理,以构建高性能冠心病合并慢性心衰预后模型。方法 分别用SMOTE算法、RT... 目的 采用结合环论的粒子群优化算法(hybridization of ring theory-based evolutionary algorithm and particle swarm optimization, RTPSO)对数据进行均衡化处理,以构建高性能冠心病合并慢性心衰预后模型。方法 分别用SMOTE算法、RTPSO算法对数据进行均衡化处理,在均衡化数据集上构建logistic回归、随机森林、支持向量机模型。结果 本研究共纳入2229例冠心病合并慢性心衰患者,依据筛选出的BMI、射血分数、N端前脑钠肽等22个变量构建模型。用灵敏度、特异度、准确率、F-measure和AUC值评价模型性能,其中RF、SVM、logistic回归、RF-RTPSO、SVM-RTPSO、Logistic-RTPSO灵敏度的中位数分别为0.0172、0.0773、0.0776、0.7568、0.7640、0.7838;F-measure的中位数分别为0.0338、0.1143、0.1283、0.3412、0.3505、0.4545;AUC的中位数分别为0.5086、0.5264、0.5313、0.8016、0.7785、0.7985。结论 RTPSO算法可以从多数类样本中选择有代表性的少数样本,从而达到数据均衡化,使分类模型具备更高的预测性能,指导临床医生发现高危患者,尽早预防不良事件的发生。 展开更多
关键词 慢性心衰 类不平衡 粒子群优化 随机森林 支持向量机
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XGBoost-SHAP机器学习可解释框架用于轻度认知障碍分类研究
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作者 易付良 陈杜荣 +7 位作者 杨慧 秦瑶 韩红娟 崔靖 白文琳 马艺菲 张荣 余红梅 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第3期423-429,共7页
目的利用机器学习算法对轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)亚型分类有利于患者的个性化治疗,而复杂模型常因分类过程的内部机制不可洞察而饱受诟病,本研究借助可解释技术梳理模型的输出结果,以期为相关领域研究者的决策提供... 目的利用机器学习算法对轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)亚型分类有利于患者的个性化治疗,而复杂模型常因分类过程的内部机制不可洞察而饱受诟病,本研究借助可解释技术梳理模型的输出结果,以期为相关领域研究者的决策提供统计支持。方法本研究联合极限梯度提升(eXtreme Gradient Boosting,XGBoost)与沙普利可加性(SHapley Additive exPlanations,SHAP)构建可解释性框架,用于遗忘型MCI(amnestic MCI,aMCI)和非遗忘型MCI(non-amnestic naMCI)的分类,并根据联合框架输出结果进行解读。结果联合框架输出aMCI和naMCI的最佳分界值为0.51,XGBoost分类准确率、灵敏度、特异度、F1值、AUC分别为92.81%、94.94%、90.54%、0.93、0.96。SHAP个性化预测结果,7号和31号示例个体被预测为aMCI的概率分别为0.27和0.91;全局性解释结果,不同个体随着CEREALL、ORIENT、CDRSUM、LCMF、RSUPMAR、RMEDORBF、LPOSCENM等指标的shapley值增大,患aMCI的风险越大,上述指标可以解释为aMCI发生的危险因素,而RENT、MMSEORDA、CRAFTVRS等则相反,可以解释为aMCI发生的保护因素。结论XGBoost-SHAP联合框架用于MCI亚型分类效果较为理想,实现了特定个体不同特征预测效果的比较、不同个体给定特征预测能力的判断,为相关研究者打开了洞察复杂模型内在机制的大门。 展开更多
关键词 机器学习 可解释性 极限梯度提升-沙普利可加性 轻度认知障碍 分类
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网络增强核融合方法的改进及其在乳头状肾细胞癌多组学数据整合分子分型中的应用
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作者 师国京 李灵梅 +6 位作者 魏亿芳 赵鑫 房瑞玲 杨海涛 余红梅 张岩波 曹红艳 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第3期376-381,共6页
目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fus... 目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fusion,improved ne-SNF)方法,并探讨其在乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)分子分型中的应用,识别PRCC高危患者,筛选重要通路及免疫浸润细胞。方法通过模拟研究评估improved ne-SNF分型性能,并将其用于PRCC多组学数据的整合分型,利用Cox回归模型分析不同分型患者的预后风险;筛选不同分型的差异表达mRNA(DEmRNAs)、miRNA(DEmiRNAs)及差异甲基化基因(DMGs),并对其重合基因进行KEGG通路分析;最后对不同分型患者进行免疫细胞浸润分析。结果模拟研究结果表明improved ne-SNF在不同信号比例和噪声强度下的分型准确性均优于SNF和ne-SNF。improved ne-SNF方法将PRCC患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的7.727倍;筛选出3511个DEmRNAs,96个DEmiRNAs及3426个DMGs,其联合分析的649个重合基因得到42条有统计学差异的KEGG通路。此外,筛选出3种在不同分型中存在统计学差异的免疫浸润细胞。结论improved ne-SNF分型性能优于SNF和ne-SNF,且能够有效识别PRCC预后高风险患者,并筛选出PRCC重要通路及相关免疫浸润细胞,为PRCC的治疗及预后提供新的思路和参考依据。 展开更多
关键词 改进的网络增强融合 乳头状肾细胞癌 多组学数据整合 分子亚型
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基于生存结局加权多组学数据整合的胶质瘤分子分型
14
作者 贾聪聪 杜港 +5 位作者 赵鑫 师国京 房瑞玲 李治 张岩波 曹红艳 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第5期644-649,共6页
目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多... 目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多组学数据进行结局加权整合分型,并拟合Cox比例风险模型评估不同分型患者预后。对不同分型间的差异表达基因(DEmiRNAs,DEmRNAs,DMGs)进行筛选,对DEmiRNAs靶基因、DEmRNAs、DMGs的重合基因进行GO功能注释;最后对不同分型患者进行免疫浸润分析。结果survClust将胶质瘤患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的2.931倍。不同分型差异基因的分布存在差异,共筛选出194个DEmiRNAs,3396个DEmRNAs,1230个DMGs。将189个重合基因进行GO功能注释,得到52条差异具有统计学意义的GO生物项。此外,不同分型在B淋巴细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和髓样树突状细胞的免疫浸润水平存在统计学差异。结论结局加权整合算法survClust能够有效识别兼具分子异质性和显著预后差异的胶质瘤亚型,同时基于分型结果筛选出的潜在生物标志物将为胶质瘤的个性化治疗提供科学理论依据。 展开更多
关键词 生存结局加权聚类 分子亚型 多组学数据整合 胶质瘤
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深度神经网络在不规则弥漫大B细胞淋巴瘤时间序列数据分类预测中的应用
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作者 李琼 张岩波 +8 位作者 余红梅 周洁 赵艳琳 李雪玲 王俊霞 张高源 乔宇 赵志强 罗艳虹 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第2期190-193,199,共5页
目的探讨深度神经网络在不规则时间序列数据中的分类效果,并对山西某医院2014-2020年362例弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)患者进行复发预测。方法回顾性地收集了确诊且治疗后达到完全缓解的362例DLBCL患者的... 目的探讨深度神经网络在不规则时间序列数据中的分类效果,并对山西某医院2014-2020年362例弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)患者进行复发预测。方法回顾性地收集了确诊且治疗后达到完全缓解的362例DLBCL患者的病例资料,并预测其两年内的复发。先利用LASSO回归进行变量的筛选,再构建基于GRU-ODE-Bayes(gated recurrent unirt-ordinary differential equation-Bayes)的不规则时间序列深度神经网络模型,并与传统模型及其他深度神经网络模型进行比较。结果在本文的所有模型中,传统模型的分类性能不及深度神经网络模型。其中GRU-ODE-Bayes模型最优,其AUC为0.85,灵敏度为0.84,特异度为0.71,G-means为0.77。结论关于不规则DLBCL时间序列数据,与本文其他模型相比,GRU-ODE-Bayes模型可以更精准地预测DLBCL患者的复发情况,可为患者个性化治疗和医生决策提供参考。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 不规则时间序列数据 复发预测 深度神经网络
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基于多随机经验核的弥漫大B细胞淋巴瘤复发预测
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作者 李雪玲 赵艳琳 +8 位作者 张岩波 余红梅 周洁 李琼 王俊霞 乔宇 张高源 赵志强 罗艳虹 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第3期339-343,共5页
目的基于多随机经验核分类器构建弥漫大B细胞淋巴瘤完全缓解后两年内复发情况的预测模型,为患者的治疗提供决策依据。方法利用山西省某三甲医院2010-2020年电子病历库中符合本研究要求的445名患者信息,基于五种常见类别不平衡处理方法... 目的基于多随机经验核分类器构建弥漫大B细胞淋巴瘤完全缓解后两年内复发情况的预测模型,为患者的治疗提供决策依据。方法利用山西省某三甲医院2010-2020年电子病历库中符合本研究要求的445名患者信息,基于五种常见类别不平衡处理方法以及多随机经验核分类器构建复发预测模型,并与五种分类器进行比较。结果基于SMOTE Tomek Links+多随机经验核分类器的复发预测模型取得了最优的分类性能(accuracy=0.89,precision=0.87,recall=0.92,f1-Score=0.89,brier score=0.11)。结论对DLBCL实际数据集,本文使用SMOTE Tomek links处理不平衡数据并构建多随机经验核模型,模型性能达到最优的同时计算复杂度也不高,可为DLBCL复发预测提供有力参考。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 复发预测 经验核映射 类别不平衡
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慢性心衰患者报告结局恶化与最小显著差异之TUDD纵向分析
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作者 赵一瑾 田晶 +6 位作者 闫晶晶 韩琳艾 冯佳雨 韩港飞 丁凤琴 韩清华 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第2期239-243,共5页
目的依据最小临床重要差异值,估计慢性心衰患者报告结局恶化事件的预警阈值及与死亡无关的病情恶化时间,预判患者发生不良事件的关键时点,提前干预,以减少不良事件发生。方法使用慢性心力衰竭患者报告结局量表,将患者报告结局评分从基线... 目的依据最小临床重要差异值,估计慢性心衰患者报告结局恶化事件的预警阈值及与死亡无关的病情恶化时间,预判患者发生不良事件的关键时点,提前干预,以减少不良事件发生。方法使用慢性心力衰竭患者报告结局量表,将患者报告结局评分从基线到18个月的变化按性别分组,进行Cox分析,并设置评分的降低值超过最小临床重要差异值为结局事件,观察各组患者分别出现生命质量下降的时间。本文主要关注量表的社会及治疗领域。结果共纳入173例患者,其中男性98例,女性75例。社会领域中男性病情恶化时间的中位数为18个月(P=0.043);治疗领域中,男性病情恶化时间的中位数为18个月(P<0.001),女性为12个月(95%CI:9.898~14.011,P<0.001)。对治疗领域做Cox回归分析,结果显示支持利用度维度是患者生命质量下降的危险因素(HR=1.018,95%CI:1.010~1.026,P<0.001)。结论慢性心衰患者生命质量的下降存在性别差异,需更早关注女性患者的生命质量,同时应鼓励患者主动向外界倾诉及寻求帮助。 展开更多
关键词 心力衰竭 患者报告结局 最小临床重要差异 确定病情恶化时间
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基准剂量估计R软件包bmd的改进与应用
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作者 袁苗 彭雯洁 +4 位作者 王青青 崔靖 张婷 周小林 余红梅 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第5期766-768,774,共4页
目的本研究旨在构建一个更加便捷的R扩展包简化基准剂量估计(benchmark dose,BMD)的计算和操作过程。方法使用R 4.1.3对原有R软件包bmd进行修改和整合,构建一个R扩展包。采用研究中封装完成的R扩展包将微囊藻毒素LR(microcystin-LR,MCLR... 目的本研究旨在构建一个更加便捷的R扩展包简化基准剂量估计(benchmark dose,BMD)的计算和操作过程。方法使用R 4.1.3对原有R软件包bmd进行修改和整合,构建一个R扩展包。采用研究中封装完成的R扩展包将微囊藻毒素LR(microcystin-LR,MCLR)的数据与18种剂量-反应模型拟合,根据Akaike信息标准(Akaike information criterion,AIC)最小原则,得到最佳拟合模型下MCLR的BMD和基准剂量下限(benchmark dose lower confidence limit,BMDL)。结果封装后的R扩展包将原有bmd包的运算过程进行简化。MCLR的基准剂量估计中2个参数的Weibull type 2模型AIC值最小,在该模型下,MCLR的BMD和BMDL分别为1.39 mg/kg和0.49 mg/kg。结论封装后的R扩展包简化了BMD的计算和操作过程,可以同时得到18种剂量-反应模型的AIC、BMD和BMDL,直观选择AIC最小的模型相对应的BMD及BMDL。 展开更多
关键词 基准剂量估计 剂量-反应 微囊藻毒素
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结构方程模型局部估计在脑卒中患者报告结局评价中的应用
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作者 张耀 杨婕 +2 位作者 闫娟娟 杨洁 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第5期658-661,共4页
目的结合脑卒中患者报告结局调查数据,比较结构方程模型全局估计、局部估计方法的差异,探讨脑卒中患者的心理成因。方法借助Stroke-PRO(patient reported outcome)量表随机调查475例脑卒中患者,分别使用两种方法对实际数据进行分析,并... 目的结合脑卒中患者报告结局调查数据,比较结构方程模型全局估计、局部估计方法的差异,探讨脑卒中患者的心理成因。方法借助Stroke-PRO(patient reported outcome)量表随机调查475例脑卒中患者,分别使用两种方法对实际数据进行分析,并通过纳入不同随机效应进行敏感性分析。结果降维过程中,数据信息损失量均低于5%。敏感性分析发现本研究不存在分类变量随机效应,结构方程模型全局估计与结构模型结合局部估计两种方法结果有一定差异,后者反映的路径系数略大于前者。结合本研究实际数据,发现社会交往可降低抑郁与回避情绪,言语交流一定程度上可缓解焦虑情绪。结论结构模型结合局部估计方法可有效分析既存在潜变量,同时潜变量模型包含有随机效应项的数据,脑卒中患者心理问题成因复杂。 展开更多
关键词 潜变量 pSEM PRO 量表
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基于鞅残差的多重填补法介绍与R语言实现
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作者 杨晓敏 韩嫱 +3 位作者 田晶 闫晶晶 韩港飞 张岩波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第1期152-155,共4页
目的 简要介绍基于鞅残差的多重填补法的基本原理,通过模拟研究证明其效能及实现方式,为未测量混杂因素的填补提供方法学参考与思路。方法 基于模拟研究使用基于鞅残差的多重填补法填补未测量混杂因素,包括非时依性变量和时依性变量,并... 目的 简要介绍基于鞅残差的多重填补法的基本原理,通过模拟研究证明其效能及实现方式,为未测量混杂因素的填补提供方法学参考与思路。方法 基于模拟研究使用基于鞅残差的多重填补法填补未测量混杂因素,包括非时依性变量和时依性变量,并与传统的Cox模型、基于倾向性评分校准法的填补、基于对数生存时间的填补三种方法进行了比较。结果 模拟研究显示,无论未测量混杂为非时依性变量或时依性变量,基于鞅残差的多重填补法在大多数模拟情景中都可以产生更精确的估计和更小的偏倚。结论 在生存分析中,相比于其他方法,基于鞅残差的方法在计算生存时间的较复杂分布时比较灵活,能够有效减小填补后模型分析的偏倚。 展开更多
关键词 鞅残差 未测量混杂 非时依性变量 时依性变量
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