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酪酸梭菌通过调节长链非编码RNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480的凋亡
被引量:
3
1
作者
杨晓容
张德纯
+3 位作者
杨金梅
李世超
刘胜男
郭亚楠
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第21期2126-2130,共5页
目的人结肠癌细胞SW480与酪酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)共培养后,检测SW480细胞lncRNAs和mRNAs的应答变化及诱导凋亡的机制。方法 1.5×107CFU/m L酪酸梭菌处理结肠癌细胞48 h后,提取总RNA,对其逆转录RNA并作荧光标记,与安捷...
目的人结肠癌细胞SW480与酪酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)共培养后,检测SW480细胞lncRNAs和mRNAs的应答变化及诱导凋亡的机制。方法 1.5×107CFU/m L酪酸梭菌处理结肠癌细胞48 h后,提取总RNA,对其逆转录RNA并作荧光标记,与安捷伦人lncRNAs/mRNAs芯片杂交。生物信息学预测表达差异的lncRNAs靶基因,并利用DAVID6.7对其进行信号通路富集度分析。双苯并咪唑Hoechst 33258(bisbenzimlde)和Annexin V-FITC/PI染色检测细胞凋亡。结果与SW480对照组相比,共培养酪酸梭菌的结肠癌细胞SW480中的lncRNAs有50个表达上调和152个表达下调的基因,mRNAs中有738个表达上调和1 088个表达下调的基因。对差异表达的基因进行信号通路富集度分析,显示参与肿瘤相关的信号传导途径有MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子、JAK-STAT信号、NF-κB的激活、VEGF信号通路和p53信号通路。酪酸梭菌能显著促进结肠癌细胞凋亡。结论酪酸梭菌通过调节lncRNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480凋亡。
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关键词
酪酸梭菌
结肠癌
SW480细胞
长链非编码RNA
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职称材料
题名
酪酸梭菌通过调节长链非编码RNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480的凋亡
被引量:
3
1
作者
杨晓容
张德纯
杨金梅
李世超
刘胜男
郭亚楠
机构
重庆医科大学基础医学部分子医学与肿瘤研究中心
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第21期2126-2130,共5页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(31000075)~~
文摘
目的人结肠癌细胞SW480与酪酸梭菌(Clostridium butyricum,CB)共培养后,检测SW480细胞lncRNAs和mRNAs的应答变化及诱导凋亡的机制。方法 1.5×107CFU/m L酪酸梭菌处理结肠癌细胞48 h后,提取总RNA,对其逆转录RNA并作荧光标记,与安捷伦人lncRNAs/mRNAs芯片杂交。生物信息学预测表达差异的lncRNAs靶基因,并利用DAVID6.7对其进行信号通路富集度分析。双苯并咪唑Hoechst 33258(bisbenzimlde)和Annexin V-FITC/PI染色检测细胞凋亡。结果与SW480对照组相比,共培养酪酸梭菌的结肠癌细胞SW480中的lncRNAs有50个表达上调和152个表达下调的基因,mRNAs中有738个表达上调和1 088个表达下调的基因。对差异表达的基因进行信号通路富集度分析,显示参与肿瘤相关的信号传导途径有MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子、JAK-STAT信号、NF-κB的激活、VEGF信号通路和p53信号通路。酪酸梭菌能显著促进结肠癌细胞凋亡。结论酪酸梭菌通过调节lncRNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480凋亡。
关键词
酪酸梭菌
结肠癌
SW480细胞
长链非编码RNA
Keywords
Clostridium butyricum
colon cancer
SW480 cells
long non-coding RNA
分类号
R378.8 [医药卫生—病原生物学]
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
酪酸梭菌通过调节长链非编码RNAs的表达变化促进结肠癌细胞SW480的凋亡
杨晓容
张德纯
杨金梅
李世超
刘胜男
郭亚楠
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
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