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hsa_circ_0004123绝对定量PCR方法的建立及验证
被引量:
2
1
作者
付立芳
张航
+2 位作者
吕文琼
韩星
邹琳
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期906-911,共6页
目的建立能精确定量hsa_circ_0004123的绝对反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)方法,并在白血病细胞系中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。方法提取B淋巴母细胞系HMy2.CIR总RNA,反转录合成cDNA。以cDNA为模板,扩增包含hsa_circ_0004123反向剪接...
目的建立能精确定量hsa_circ_0004123的绝对反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)方法,并在白血病细胞系中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。方法提取B淋巴母细胞系HMy2.CIR总RNA,反转录合成cDNA。以cDNA为模板,扩增包含hsa_circ_0004123反向剪接位点的236 bp特征片段,克隆到pGM-T载体中,并对重组质粒进行测序鉴定。以梯度稀释的重组质粒为标准品,采用SYBR荧光染料法进行RT-qPCR并建立标准曲线,在4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。结果建立了能精确定量hsa_circ_0004123拷贝数的绝对RT-qPCR方法,其线性范围为(9.63×10^3~9.63×10^9)拷贝/μl,灵敏度为(4528±516)拷贝/μl,批内变异系数(CV)为0.30%~1.86%,批间CV为1.40%~2.30%,且熔解曲线为单一峰值曲线。对4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中hsa_circ_0004123的拷贝数分别用本法进行检测,结果显示,hsa_circ_0004123在4种白血病细胞系中的表达差异有统计学意义(P<0.001)。结论建立的检测hsa_circ_0004123的绝对RT-qPCR方法具有线性范围广,灵敏度、特异性高,重复性好等特点,可为hsa_circ_0004123在白血病中的精确定量提供技术支持。
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关键词
hsa_circ_0004123
绝对荧光定量PCR
白血病
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职称材料
题名
hsa_circ_0004123绝对定量PCR方法的建立及验证
被引量:
2
1
作者
付立芳
张航
吕文琼
韩星
邹琳
机构
重庆医科大学附属儿童医院临床分子医学中心/儿童发育疾病研究教育部重点实验室/国家儿童健康与疾病临床医学研究中心/儿童发育重大疾病国家国际科技合作基地/重庆市干细胞治疗工程技术研究中心
四川省雅安市人民
医院
检验科
成都市第三人民
医院
实验
医学
科
临床
检验部
四川
大学
华西第二
医院
小儿血液肿瘤科
西安市
儿童
医院
检验科
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期906-911,共6页
基金
国家自然科学基金(81570142,81870126)~~
文摘
目的建立能精确定量hsa_circ_0004123的绝对反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)方法,并在白血病细胞系中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。方法提取B淋巴母细胞系HMy2.CIR总RNA,反转录合成cDNA。以cDNA为模板,扩增包含hsa_circ_0004123反向剪接位点的236 bp特征片段,克隆到pGM-T载体中,并对重组质粒进行测序鉴定。以梯度稀释的重组质粒为标准品,采用SYBR荧光染料法进行RT-qPCR并建立标准曲线,在4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中验证hsa_circ_0004123的拷贝数。结果建立了能精确定量hsa_circ_0004123拷贝数的绝对RT-qPCR方法,其线性范围为(9.63×10^3~9.63×10^9)拷贝/μl,灵敏度为(4528±516)拷贝/μl,批内变异系数(CV)为0.30%~1.86%,批间CV为1.40%~2.30%,且熔解曲线为单一峰值曲线。对4种白血病细胞系(HMy2.CIR、Jurkat、Raji、K562)中hsa_circ_0004123的拷贝数分别用本法进行检测,结果显示,hsa_circ_0004123在4种白血病细胞系中的表达差异有统计学意义(P<0.001)。结论建立的检测hsa_circ_0004123的绝对RT-qPCR方法具有线性范围广,灵敏度、特异性高,重复性好等特点,可为hsa_circ_0004123在白血病中的精确定量提供技术支持。
关键词
hsa_circ_0004123
绝对荧光定量PCR
白血病
Keywords
hsa_circ_0004123
absolute fluorescence quantitative PCR
leukemia
分类号
R733.7 [医药卫生—肿瘤]
R730.43 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
hsa_circ_0004123绝对定量PCR方法的建立及验证
付立芳
张航
吕文琼
韩星
邹琳
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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