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基于电子病历的预训练模型在急性呼吸道感染识别中的应用
被引量:
2
1
作者
贾萌萌
刘晞照
+14 位作者
漆莉
戴佩希
李勤
姜明月
唐文革
谭明伟
李婷婷
姜玢杉
任钰华
饶俊莉
颜朝阳
曹琰琳
杨维中
冉华
冯录召
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1543-1548,共6页
目的评价基于电子病历的预训练模型对急性呼吸道感染(ARI)的识别效果。方法收集重庆大学附属三峡医院2021年12月1至31日就诊于呼吸与危重症科、发热门诊、急诊门诊、儿科、感染科的所有患者的病历资料。使用基于Transformer的双向编码...
目的评价基于电子病历的预训练模型对急性呼吸道感染(ARI)的识别效果。方法收集重庆大学附属三峡医院2021年12月1至31日就诊于呼吸与危重症科、发热门诊、急诊门诊、儿科、感染科的所有患者的病历资料。使用基于Transformer的双向编码器表征(BERT)预训练模型对病历进行ARI病例识别与判断,以医学专业人员根据ARI病例定义判断的结果作为“金标准”,计算模型识别ARI的灵敏度、特异度、与“金标准”的一致性及受试者工作特征曲线下面积(AUC),评价模型对ARI病例识别的准确性。结果含有3817条电子医疗记录的测试集中,共有1200条经人工判定的ARI病历。模型判定ARI共计1205例,灵敏度为92.67%(1112/1200),特异度96.45%(2524/2617),与“金标准”的一致性Kappa值为0.89,AUC为0.95。模型在男性和女性中识别ARI的准确性相近(AUC分别为0.95和0.94),且对未成年ARI病例识别较18~59岁及≥60岁(AUC分别为0.94,0.89和0.89)更准确。相较于住院患者,目前模型对门诊患者的ARI识别更好,AUC分别为0.74和0.95。结论使用基于电子病历的预训练模型对ARI病例判定具有良好的效果,特别是针对门诊患者及未成年患者。该模型在利用电子病历进行医疗机构ARI病例监测方面表现出良好的潜力。
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关键词
急性呼吸道感染
电子病历
预训练模型
应用
原文传递
题名
基于电子病历的预训练模型在急性呼吸道感染识别中的应用
被引量:
2
1
作者
贾萌萌
刘晞照
漆莉
戴佩希
李勤
姜明月
唐文革
谭明伟
李婷婷
姜玢杉
任钰华
饶俊莉
颜朝阳
曹琰琳
杨维中
冉华
冯录召
机构
中国医学
科
学院北京协和医学院群医学及公共卫生学院
重庆
大学附属三峡医院感染管理部
重庆市
疾病预防控制中心
传染病
预防
控制
科
重庆市万州区疾病预防控制中心传染病预防控制科
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期1543-1548,共6页
基金
中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2021-I2M-1-044,2020-I2M-1-001)
群医学学科建设经费(WH10022021145)。
文摘
目的评价基于电子病历的预训练模型对急性呼吸道感染(ARI)的识别效果。方法收集重庆大学附属三峡医院2021年12月1至31日就诊于呼吸与危重症科、发热门诊、急诊门诊、儿科、感染科的所有患者的病历资料。使用基于Transformer的双向编码器表征(BERT)预训练模型对病历进行ARI病例识别与判断,以医学专业人员根据ARI病例定义判断的结果作为“金标准”,计算模型识别ARI的灵敏度、特异度、与“金标准”的一致性及受试者工作特征曲线下面积(AUC),评价模型对ARI病例识别的准确性。结果含有3817条电子医疗记录的测试集中,共有1200条经人工判定的ARI病历。模型判定ARI共计1205例,灵敏度为92.67%(1112/1200),特异度96.45%(2524/2617),与“金标准”的一致性Kappa值为0.89,AUC为0.95。模型在男性和女性中识别ARI的准确性相近(AUC分别为0.95和0.94),且对未成年ARI病例识别较18~59岁及≥60岁(AUC分别为0.94,0.89和0.89)更准确。相较于住院患者,目前模型对门诊患者的ARI识别更好,AUC分别为0.74和0.95。结论使用基于电子病历的预训练模型对ARI病例判定具有良好的效果,特别是针对门诊患者及未成年患者。该模型在利用电子病历进行医疗机构ARI病例监测方面表现出良好的潜力。
关键词
急性呼吸道感染
电子病历
预训练模型
应用
Keywords
Acute respiratory infection
Electronic medical record
Pretrained model
Application
分类号
R56 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于电子病历的预训练模型在急性呼吸道感染识别中的应用
贾萌萌
刘晞照
漆莉
戴佩希
李勤
姜明月
唐文革
谭明伟
李婷婷
姜玢杉
任钰华
饶俊莉
颜朝阳
曹琰琳
杨维中
冉华
冯录召
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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