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柑桔溃疡病菌实时荧光定量PCR检测与应用
被引量:
26
1
作者
殷幼平
黄冠军
+2 位作者
赵云
刘洪
王中康
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期607-613,共7页
根据地毯草黄单孢Xac306菌株(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac 306)已知全基因组中独有蛋白基因序列设计的特异性引物对和探针,建立并优化SYBR Green I(SGI)荧光染料和TaqMan探针实时荧光定量PCR检测体系,用于柑桔溃疡病早...
根据地毯草黄单孢Xac306菌株(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac 306)已知全基因组中独有蛋白基因序列设计的特异性引物对和探针,建立并优化SYBR Green I(SGI)荧光染料和TaqMan探针实时荧光定量PCR检测体系,用于柑桔溃疡病早期诊断鉴定。结果表明,建立的两种定量PCR体系均能特异地检出Xac的细胞和其基因组DNA,而对其它测试的植物病原菌和柑桔表面的腐生黄单孢菌都不能检出。SGI法和TaqMan探针法对Xac细菌悬浮液的检测灵敏度均可达到1~5个细菌/反应,对Xac靶标片段DNA的检测灵敏度可达1fg/μL。两种定量PCR检测方法比常规PCR灵敏度高2~3个数量级。对田间采集的328个柑桔显症、疑似症状和无症带菌材料富集培养样品进行了实际检测,结果表明,实时荧光PCR适合柑桔无症带菌样品的早期检测。
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关键词
柑桔溃疡病菌
定量PCR
荧光染料
TAQMAN探针
检测
原文传递
题名
柑桔溃疡病菌实时荧光定量PCR检测与应用
被引量:
26
1
作者
殷幼平
黄冠军
赵云
刘洪
王中康
机构
重庆市
基因功能及调控重点实验室
重庆
大学生物工程学院
重庆市农业技术推广总站植保植检站
出处
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期607-613,共7页
基金
农业部重点项目(2003-589-18)
科技部创新基金项目(05C26215111399)
文摘
根据地毯草黄单孢Xac306菌株(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac 306)已知全基因组中独有蛋白基因序列设计的特异性引物对和探针,建立并优化SYBR Green I(SGI)荧光染料和TaqMan探针实时荧光定量PCR检测体系,用于柑桔溃疡病早期诊断鉴定。结果表明,建立的两种定量PCR体系均能特异地检出Xac的细胞和其基因组DNA,而对其它测试的植物病原菌和柑桔表面的腐生黄单孢菌都不能检出。SGI法和TaqMan探针法对Xac细菌悬浮液的检测灵敏度均可达到1~5个细菌/反应,对Xac靶标片段DNA的检测灵敏度可达1fg/μL。两种定量PCR检测方法比常规PCR灵敏度高2~3个数量级。对田间采集的328个柑桔显症、疑似症状和无症带菌材料富集培养样品进行了实际检测,结果表明,实时荧光PCR适合柑桔无症带菌样品的早期检测。
关键词
柑桔溃疡病菌
定量PCR
荧光染料
TAQMAN探针
检测
Keywords
Xanthomonas axonopodis pv. cirri
RTi-PCR
SYBR Green I
TaqMan probe
detection
分类号
S436.66 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柑桔溃疡病菌实时荧光定量PCR检测与应用
殷幼平
黄冠军
赵云
刘洪
王中康
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
26
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