基于基因芯片的前列腺癌生物信息学分析

目的利用生物信息学方法分析前列腺癌(PCa)患者与健康男性血清差异表达基因。方法将该院收治的PCa病例组和对照组血清进行微小核糖核酸(miRNA)和表达谱芯片检测,每组做3个独立生物学重复。对差异表达的基因进行生物信息学分析,并构建miRNA-mRNA互相作用调控网络图。采用Western blot及qRT-PCR方法检测锌指蛋白转录因子编码基因多形性腺瘤基因2(PLAGL2)、miR-135b-3p表达水平。结果与对照组相比,病例组有11个miRNA、825个mRNA的表达发生显著变化。KEGG富集的通路有Hippo信号通路、氨基酸生物合成通路等。与对照组相比,病例组PLAGL2水平降低,miR-135b-3p水平升高(P<0.05)。PCa血清中PLAGL2表达与PCa患者初诊血清前列腺特异性抗原(PSA)、肿瘤临床分级、Gleason评分显著相关(P<0.05)。结论 miR-135b-3p靶向PLAGL2调控Hippo信号通路可能是导致PCa发生、发展的重要原因之一。