重庆市万州区重点人群布鲁氏菌病血清抗体监测结果分析

目的:对重庆市万州区2017—2020年重点人群布鲁氏菌病(简称布病)血清抗体监测结果进行分析,了解该人群感染状况,为布病防控提供科学依据。方法:选定畜牧业较发达的乡镇为监测点,调查牛、羊养殖户,屠宰户以及畜牧兽医人员等重点职业人群,并对其进行布病抗体监测,实验数据采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果:1 085份血清标本检出布病抗体阳性13份,阳性率约为1.20%,不同监测年度阳性率,差异无统计学意义(χ^(2)=1.097,P>0.05)。其中,羊饲养人群检出阳性3人、牛饲养人群7人、牛/羊混合养殖人群2人、畜牧兽医检出1人;不同性别、年龄组阳性率,差异无统计学意义(χ^(2)=0.029、1.333、P>0.05);不同职业阳性率,差异有统计学意义(χ^(2)=9.057,P<0.05),其中畜牧兽医人群最高,羊饲养人群最低。结论:加强重点职业人群布病防控知识宣传,做好个人防护,持续开展人群布病抗体监测及预警工作。

借鉴新版WHO指南,建立与完善三峡库区重庆段血吸虫病实验室检测体系专家共识

WHO在2022年发布的《控制和消除人体血吸虫病指南》中强调灵敏度、特异度和诊断效率高的诊断方法的重要性。根据国家疾病预防控制局等11个部门于2023年制定的《加快实现消除血吸虫病目标行动方案(2023-2030年)》,结合三峡库区重庆段血吸虫病潜在流行区防治工作实际,该文从建立和完善实验室检测体系、高灵敏度和高特异度检测新技术的推广和应用、成渝地区双城经济圈血吸虫病诊断网络实验室的建立、整合其他寄生虫病检测项目等方面对新时期三峡库区重庆段血吸虫病防治工作进行总结并提出建议,旨在提高三峡库区重庆段血吸虫病潜在流行区疾病预防控制机构和医疗机构关于血吸虫病检测、诊断和防控意识的能力,强化巩固防治成果,全力守护人民群众身体健康。

重庆市2009～2014年甲型H1N1流感病毒分离株HA基因变异分析

目的对2009-2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行血凝素（HA）基因测序分析,与世界卫生组织（WHO）推荐疫苗株A/California/07/2009（H1N1）比对,研究其基因变异情况。方法按分离时间及地点不同,选取47株2011-2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行测序,同时选取既往已有的25株2009年甲型H1N1流感病毒的序列结果,经分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析,并绘制系统进化树。结果 2009、2011-2014年的新型甲型H1N1流感病毒与疫苗株均位于一个大的分枝下,各病毒间的关系均较近。72株分离株的HA基因总的核苷酸差异在0-2.7%之间,氨基酸差异在0-3.1%之间;与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的核苷酸差异在0.4%-2.4%之间,氨基酸差异在0.9%-3.1%之间。氨基酸变异情况随着年份增加累积得更多,但在氨基酸序列上仍显示为低致病性流感病毒特征;2009年有9株病毒株丢失481位的糖基化位点,2013年有6株病毒株增加位于162位的糖基化位点。结论 WHO推荐的甲型H1N1疫苗总体上对重庆地区的人群仍有较好的保护作用,但随着时间推移,部分甲型H1N1流感病毒株可能已发生抗原漂移,需继续对其监测。

重庆市01群霍乱菌株耐药性研究

目的了解1984～2005年重庆市01群霍乱弧菌的耐药性和耐药性的变迁。方法采用K—B法检测72株01群霍乱弧菌(小川型26株,稻叶型46株)对16种抗菌药物的敏感性。结果重庆地区01群霍乱弧菌对复方新诺明耐药、痢特灵和链霉素的耐药严重,耐药率分别为20.83%(15/72)、56.94%(41/72)和30.56%(22/72),小川型和稻叶型的耐药性不同。人群分离株对丁胺卡那、庆大霉素、妥布霉素、氨苄西林、新霉素和强力霉素敏感,未发现耐药菌株。但05年分离的两株环境分离株具有较高的耐药性。结论未发现重庆市01群霍乱弧菌人群分离株的耐药性有明显改变,但与一些地区报道的耐药性有明显的不同,这种地区差别和重庆市01群不同血清型的耐药性的差别有待于进一步研究。

重庆市江北区COVID-19患者临床和实验室特征分析

目的:回顾性分析重庆市江北区42例新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 19,COVID-19)确诊患者和疑似患者的临床资料和实验室数据,为制定疫情防控策略和措施提供科学依据。方法:收集2020年1月24日至3月21日在重庆市红十字会医院(江北区人民医院)诊治的21例COVID-19确诊患者(核酸检测阳性)和21例疑似患者(临床症状、胸部CT高度怀疑)资料,对其基本信息、流行病学特征、实验室检查、CT结果、出院后随访情况等进行调查分析及比较。结果:42例病例中,湖北返回人员9人(21.4%),有确诊人员接触史19人(45.2%),无确诊人员接触史14人(33.3%),2组患者差异有统计学意义(P<0.001)。42例患者平均年龄(44.48±16.49)岁;男性59.5%,女性40.5%。主要临床症状有发热、咳嗽、乏力,其中5例无症状。确诊患者白细胞计数(white blood cell count,WBC)、淋巴细胞绝对值(lymphocyte count,LYM)、中性粒细胞绝对值(neutrophil count,NEU)、淋巴细胞百分比(lymphocyte percentage,LYM%)、中性粒细胞百分比(neutrophil percentage,NEU%)水平低于疑似患者,确诊组WBC下降<3.5×10^9个/L的患者所占比例高于疑似组(19.0%),疑似组NEU≥6.3×10^9个/L的患者所占比例高于确诊组(33.3%),差异有统计学意义(P<0.05)。42例患者中,41例有CT影像学改变(97.62%)。出院后随访发现,3例确诊患者出现核酸复阳,疑似患者无核酸检测阳性;2例确诊患者出现胸痛症状;共26例(61.9%)患者CT提示肺部病灶基本吸收,2组患者肺部病灶吸收情况无统计学差异。结论:2组患者流行病学史比较有显著差异,故对有接触史或可疑接触史的人群,建议及早筛查病毒核酸、血清IgG/IgM抗体及胸部影像学检查。COVID-19患者的临床表现无特异性,甚至还存在无症状患者。与疑似患者相比,确诊患者有外周血WBC、LYM%及LYM、NEU%和NEU的下降可作为确诊的依据。出院后随访发现确诊患者有核酸复阳和胸痛等症状,建议确诊和疑似患者出院后均应加强核酸复查和可能后遗症的防治。

重庆市学生餐微生物污染状况监测分析

目的了解重庆市大中小学及幼儿园统一供应学生餐的微生物污染状况,为进一步确保学生餐安全健康提供依据。方法依据《2014年国家食品污染物和有害因素风险监测工作手册》对样品进行卫生指标菌和食源性致病菌检测。结果卫生指标菌中的菌落总数和大肠埃希菌计数不合格率分别为19.57%,6.09%;食源性致病菌中的沙门菌检测全部合格,不合格率最高的是金黄色葡萄球菌计数,为1.74%。学校类型里中学和小学样品不合格率最高,达到34.88%和33.33%。不同食品类别学生餐中凉拌菜和焙烤油炸类不合格率最高,为54.55%和44.44%。炎热季节的学生餐不合格率为31.25%,凉爽季节为16.28%,差异有统计学意义(χ2=3.45,P<0.01)。城市学校学生餐样品不合格率为26.82%,稍高于农村学校。早餐和午餐不合格率分别是27.91%,23.67%,差异无统计学意义(χ2=1.08,P>0.05)。结论 2015年重庆市学校学生餐存在不同程度的微生物污染风险。应根据监测结果反映的食品安全风险进一步加强卫生监管。

2015年-2016年重庆市市售净水器微生物净化效果分析

目的了解重庆市市售家用净水器的微生物净化效果。方法对2015年-2016年在重庆市疾病预防控制中心进行卫生安全性检测的51台市售净水器的微生物指标检测结果进行分析。结果重庆市市售家用净水器微生物浸泡试验总体合格率为78.4%(40/51),其中重庆本土品牌合格率较低,仅为59.1%(13/22),且检出总大肠菌群;国外品牌全部合格,两者差异有统计学意义(P<0.05)。检测过程中,还检出现行有效国家标准要求检测项目之外的3株条件致病菌,包括2株铜绿假单胞菌,1株嗜麦芽窄食单胞菌,提示市售家用净水器质量不容乐观。结论重庆市市售家用净水器并不能达到理想的微生物净化效果,重庆市本土家用净水器生产厂家需提升产品质量,严格控制产品微生物污染。

重庆三峡库区2012年乙脑病毒分离株基因序列分析

目的通过分析2012年重庆三峡库区蚊虫中分离乙脑病毒株PrM及E基因序列，揭示毒株的遗传特性。方法对新分离乙脑病毒的PrM及E基因进行PCR扩增，将扩增产物测序。用分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析，并绘制系统进化树。结果新分离的8株乙脑病毒株均为基因I型，与我国其他省市的既往分离株进化关系较近；分离株与减毒活疫苗株SA14—14—2相比较，PrM区核苷酸同源性在85．1％～86．7％之间，氨基酸同源性在95．1％～96．3％之间；E基因区核苷酸同源性在87．6％～87．8％之间，氨基酸同源性在96．9％～97．1％之间。所有新分离株与疫苗株在E基因存在14个氨基酸差异位点。结论2012年8株重庆乙脑分离株为基因I型，在E基因区域与疫苗株相比有部分差异。

2016-2020年三峡库区重庆段鼠疫监测情况

目的分析2016-2020年三峡库区重庆段鼠疫监测情况。方法设立8个监测点,采用夜间笼捕法捕捉鼠形动物,计算捕获率、染蚤率;取心脏血,分离血清进行鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)F1抗体水平检测。结果2016-2020年共布笼285043个,捕获鼠形动物5018只,捕获率为1.76%,染蚤率为20.29%;包括14个种群,以黄胸鼠(69.57%)、褐家鼠(12.65%)为主。2016-2020年,各年捕获率差异有统计学意义(χ^(2)=27.947,P<0.001)。所检测标本的鼠疫菌F1抗体滴度均≤1∶16,鼠疫菌F1抗体滴度<1∶4的鼠形动物所占百分比逐年降低,而滴度为1∶16的鼠形动物所占百分比逐年升高,5年间各滴度所占百分比比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论血清学监测结果未发现鼠疫菌感染,但南方家鼠型鼠疫菌的主要宿主黄胸鼠、褐家鼠大量存在,有可能出现动物间鼠疫的发生,应加强主动监测,同时做好宣传工作。

2011—2019年重庆人间感染布鲁氏菌的AMOS-PCR检测的研究

鉴定2011-2019年重庆分离的布鲁氏菌,掌握重庆市感染人群的主要布鲁氏菌种 型。方法:采用自2011-2019年重庆市分离的人间布鲁氏菌病的菌株,采用AMOS-PCR方法进 行种型鉴定,并与传统生物特性鉴定方法进行比较。结果:从26株代表株中,有25株菌AMOS -PCR 均扩增出178bp和731bp的特异性条带,鉴定为羊种布鲁氏菌。结论:2011-2019年重庆 人群感染布鲁氏菌主要为羊种布鲁氏菌,AMOS-PCR可作为重庆市布鲁氏菌分离鉴定的方法推 广使用。

重庆市152栋高层建筑二次供水病原谱分析

目的了解重庆市高层建筑二次供水微生物污染状况、优势菌株及致病菌耐药状况、毒力基因及亲缘关系分析。方法2020—2021年采集重庆市152栋楼层超过18层、楼龄在5年以上的二次供水样本152份,进行细菌分离鉴定、药敏实验及全基因组测序以及病毒核酸检测。结果152份水样中56份无细菌生长,67份1种细菌生长,23份2种细菌生长,5份3种细菌生长,共分离获得菌株128株。检出率居于前3位的微生物是芽孢杆菌属(25.0%,32/128)、假单胞菌属(18.0%,23/128)、不动杆菌属(7.8%,10/128)。分离率较高的致病菌/条件致病菌有:蜡样芽孢杆菌10株,苏云金芽孢杆菌6株,琼氏不动杆菌6株,产碱假单胞菌6株,溶血葡萄球菌4株,藤黄微球菌、偶发分枝杆菌、铜绿假单胞菌各3株,少动鞘氨醇单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌等均有检出。铜绿假单胞菌对8种抗生素耐药、蜡样/苏云金芽孢杆菌对β–内酰胺类抗生素均耐药;诺如病毒、轮状病毒、新型冠状病毒3种病毒核酸检测均为阴性;全基因测序构建系统进化树显示,2株分离自二次供水的苏云金芽胞杆菌进化亲缘关系与致病株97-27等更接近。结论重庆市高层建筑二次供水存在芽孢杆菌属、假单胞菌属、不动杆菌属等致病菌污染,影响高层建筑居民健康。

2018-2021年渝东北地区HIV抗体确证试验结果分析

目的分析渝东北地区2018-2021年人类免疫缺陷病毒(HIV)抗体确证阳性样本分布特征,为艾滋病精准防控提供参考依据。方法依据《全国艾滋病检测技术规范》,对渝东北各HIV初筛实验室送检的样本进复检和确证试验,比较不同送检机构、性别、年龄送检人群的差异。结果4517份初筛阳性样本中,HIV-1抗体确证阳性3186份,占70.53%,阴性966份,占21.39%,不确定365份,占8.08%。送检机构以疾病预防控制中心阳性率最高,为86.64%;男性阳性占比为72.6%,女性占27.4%,男女比例约为2.65∶1;年龄主要集中在>40~60岁,阳性占比为44.70%;送检人群主要以医疗就诊人群的阳性占比最高,为52.66%。结论需重点关注中老年人群艾滋病防控,提倡自愿咨询检测,同时加大HIV筛查范围,全面覆盖重点人群和一般人群,有效防止艾滋病广泛传播。

芯片式数字PCR检测禽流感病毒方法的性能验证

目的 对芯片式数字PCR检测禽流感病毒的方法进行评估,并与荧光定量PCR方法进行比较。方法 分别用芯片式数字PCR(dPCR)和实时荧光定量PCR(qPCR)两种方法检测不同浓度梯度的质粒标准品,对两种方法检测结果的线性范围,一致性,批内精密度,最低检出限等方面进行比较评估。并对31份农贸市场禽流感环境标本分别用数字PCR和实时荧光定量PCR检测,利用配对卡方检验来评估两种方法阳性率的差异,并用Bland-Altman法分析与荧光定量PCR方法的一致性。结果 质粒标准品在3.05×10~2copies/mL~1.00×10~7copies/mL的浓度范围内,与dPCR检测值呈良好的线性关系,R~2=0.9969,dPCR和qPCR在线性范围内斜率之间的差异无统计学意义(F=0.996,P=0.321);dPCR在不同稀释度的批内精密度变异系数(CV)范围为2.36%~22.78%;dPCR的估计检测下限(LOD)为410(95%CI:344~570)copies/mL,qPCR的估计LOD为845(95%CI:749~1 004)copies/mL;用dPCR和qPCR检测31份农贸市场环境标本,dPCR的检出率96.8%,qPCR的检出率80.6%(Kappa=0.244,P=0.063)。结论 本研究验证了芯片式数字PCR系统的性能及其与荧光定量PCR系统的方法学比较。芯片式数字PCR在其动态范围内表现出良好的线性,R~2=0.996 9,能够准确且高精度(CV)范围为2.36%~22.78%的定量不同浓度(3.05×10~2~1.00×10~7copies/mL)的复杂样本。

重庆市不同大气污染水平地区学龄儿童呼吸系统症状及肺功能的比较

[目的]比较重庆市主城区不同大气污染水平地区的学龄儿童呼吸系统健康的差异。[方法]根据2010—2015年重庆市环保局网站的空气污染指数选取重庆市主城区污染区和清洁区。按照整群抽样的方法,随机选择分别位于清洁区、污染区的2所小学3~4年级的儿童,共487人为研究对象,进行肺功能检测,采用美国流行病学标准问卷(AST-DLD-78-C)对儿童呼吸系统疾病和症状发生情况进行调查。[结果]污染区环境大气污染物PM_(10)、PM_(2.5)在4个季节的平均浓度和年平均浓度均高于清洁区(P<0.05),污染区NOX在春、冬季和年平均浓度高于清洁区(P<0.05),污染区SO_2冬季浓度高于清洁区(P<0.05)。清洁区和污染区调查对象的男女比例分别为1.11∶1与1∶1.16。两区在家庭月收入、家庭采暖方式、厨房排烟系统、养猫/狗/鸟、房屋1年内装修等情况上的差异具有统计学意义(P<0.05)。运用单因素非条件logistic回归模型控制年龄、厨房排烟系统、家庭月收入等混杂因素后,污染区儿童感冒时咯痰(OR=2.54;95%CI:1.64~3.94)、支气管炎(OR=2.05;95%CI:1.18~3.55)的危险性仍高于清洁区儿童(P<0.05)。清洁区女童和男童的用力肺活量、1 s用力呼气容积均高于污染区(P<0.05)。多因素非条件logistic回归分析显示,污染区儿童感冒时咳痰(OR=2.63;95%CI:1.69~4.09),支气管炎(OR=2.19;95%CI:1.26~3.83)发生率高于清洁区(P<0.05)。[结论]重庆市污染区学龄儿童呼吸系统疾病及症状的发生率高于清洁区,肺功能水平有差异,证明大气污染对儿童呼吸系统健康可能带来了一定影响。

重庆市男男性行为者HIV抗体阳转率及其影响因素研究

目的了解男男性行为者(men who have sex with men,MSM)人群HIV抗体阳转率及其影响因素,为评估MSM人群艾滋病防治效果与开展针对性防治工作提供依据。方法对招募自愿参加随访研究的HIV与梅毒均阴性的MSM进行随访,6个月后再次进行问卷调查与采集血样检测HIV与梅毒,以HIV抗体阳转率为应变量,人口学特征、性行为情况等为自变量进行Logistic回归,分析鉴别HIV抗体阳转率的影响因素。结果 214例MSM参加随访,平均年龄(25.6±6.3)岁,88.3%的人最近6个月与男性有肛交史,最近6个月平均性伴数为2个,最近一次与男性发生肛交时安全套使用率为76.2%,最近6个月发生保护性肛交的比例为52.4%。HIV抗体阳转率及95%CI为12.5(9.1～15.7)/100人年,梅毒的发病率及95%CI为17.8(13.1～23.5)/100人年。多因素回归分析显示,文化程度(OR=0.27,95%CI:0.13～0.59)、梅毒感染(OR=9.23,95%CI:2.42～35.18)是HIV抗体阳转率的独立影响因素。结论重庆市MSM人群HIV抗体阳转率高,安全套使用率低,防治形势严峻。

重庆市2011-2016年甲型H1N1流感病毒分离株NA基因变异分析

目的 研究重庆市2011-2016年甲型H1N1流感病毒株神经氨酸酶（NA）基因特征,为甲型H1N1流感病毒感染的监测和预防提供试验依据.方法 按分离时间及地点的不同选取43株甲型H1N1流感病毒,经RT-PCR扩增病毒NA基因片段并进行序列测定,进行核苷酸及氨基酸序列分析.结果 基于NA基因的进化树显示,2011-2016年的甲型H1N1流感病毒与疫苗株关系均较近.43株病毒之间的NA基因同源性较高,与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的核苷酸同源性为97.9%~99.4%,氨基酸同源性为96.8%~98.9%.研究中大部分甲型H1N1病毒NA蛋白上都具有疫苗株NA蛋白具有的8个糖基化位点,但也有部分毒株增加42位（NQS）的糖基化位点,或者丢失386位的糖基化位点.结论 甲型H1N1病毒的NA序列变异情况逐年增加,但总体上来说,重庆地区大部分甲型H1N1病毒仍对达菲敏感;同时应加强耐药性监测,为制定应对甲型H1N1流感流行措施提供参考.

重庆市市售肉和肉制品食源性致病菌污染状况监测分析

目的 调查重庆市市售肉和肉制品中食源性致病菌污染情况,为有效开展食源性疾病防控提供科学依据。方法 采集各区(县)超市、农贸市场、零售店等场所肉和肉制品共740份,按照国家标准方法进行6种食源性致病菌检验。结果 740份样品中检出致病菌116株,致病菌总检出率为15.68%。样品类别中生畜肉的污染情况最为严重,检出率为30.00%;其次为生禽肉,检出率为28.13%。采样点类型中农贸市场的样品检出率最高,为21.14%;其次是超市,检出率为20.94%。沙门氏菌血清学鉴定,分属6个群17个血清型,排前3位的是鼠伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌及印地安纳沙门氏菌。单核细胞增生李斯特氏菌血清分型中,以1/2a型为主,占57.58%。致泻性大肠埃希菌氏中检出1个亚型,为肠黏附性大肠埃希氏菌(EAEC)。结论 重庆市市售肉和肉制品受到不同程度食源性致病菌污染,存在食源性疾病发生的潜在风险,需要加强管理和监测。

某国产人类免疫缺陷病毒1型核酸定量检测试剂的临床试验研究

目的评价某国产人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)核酸定量检测试剂(考核试剂)和对比试剂的相关性及一致性。方法采用国产HIV-1考核试剂和对比试剂,对197例标本进行平行检测。采用相关性分析、Bland-Altman模型等统计方法分析2种检测试剂之间的相关性和一致性。结果197例标本中该国产HIV-1考核试剂与对比试剂的阳性符合率为98.94%、阴性符合率为100.00%,总符合率为98.98%。线性回归方程为Y=0.98 X-0.04,相关系数r=0.968(R 2=0.937),二者具有较高的一致性。结论该国产HIV-1考核试剂与对比试剂的检测结果具有较好的相关性和一致性。

重庆市公共场所水环境嗜肺军团菌污染研究

目的了解重庆市公共场所水系统嗜肺军团菌污染现状,监测公共场所水系统清洗消毒效果,为卫生监督管理提供依据。方法依照卫生部《公共场所集中空调通风系统卫生规范》(2006年)附录A方法(2013-04-01前)和《公共场所集中空调通风系统卫生规范》WS 394-2012附录B方法(2013-04-01实施),采集本市多家公共场所冷却水、冷凝水、冷冻水、温泉水、淋浴水、游泳池水、生活用水等共399件水样品,进行嗜肺军团菌检测以及菌型分布检测。结果在399件样品中检出44件阳性,阳性率为11.0%;空调系统水嗜肺军团菌阳性检出率逐渐下降(29.0%/15.6%/9.0%),差异有统计学意义(χ~2=8.53,P<0.05);空调系统水嗜肺军团菌检出率高于生活水嗜肺军团菌检出率(13.9%/7.1%),差异有统计学意义(χ~2=4.608,P<0.05);检出44株嗜肺军团菌,其中LP1型有32株(72.7%);LP2-14型有12株(27.3%)。结论本市公共场所水系统中存在嗜肺军团菌污染,应加强公共场所水系统的清洗消毒,严格监管。