目的探讨幽门螺杆菌(Hp)感染对慢性胃炎患者胃内菌群丰度和多样性的影响。方法选取2017年10月至2018年6月金华市中心医院收治行胃镜检查的慢性浅表性胃炎患者38例,胃黏膜组织病理学检查和细菌培养结果中任一项为Hp阳性,归为Hp阳性组(Hp-...目的探讨幽门螺杆菌(Hp)感染对慢性胃炎患者胃内菌群丰度和多样性的影响。方法选取2017年10月至2018年6月金华市中心医院收治行胃镜检查的慢性浅表性胃炎患者38例,胃黏膜组织病理学检查和细菌培养结果中任一项为Hp阳性,归为Hp阳性组(Hp-P组,14例);两者均为阴性,归为Hp阴性组(Hp-N组,24例)。将胃黏膜组织研磨后提取基因组DNA,对16S r RNA基因V3~V4可变区进行基因扩增,构建基因文库,基于Illumina Miseq测序平台进行测序。测序数据经生物信息处理后,将得到的有效序列按相似度0.97进行分类单位聚类。比较Hp-P组和Hp-N组菌群的丰度和多样性,以及物种相似性。结果Hp-P组患者胃内菌群的丰度和多样性均明显低于Hp-N组;Hp-P组和Hp-N组物种相似性比较,两组组内菌群结构相似性较高,而两组之间菌群结构存在明显差异。Hp-P组的优势菌群分别为Helicobacter(89.1%)、Prevotella(1.2%)、Methylobacterium(1.1%)、Sphingomonas(1.1%);Hp-N组优势菌群分别为Prevotella(14.5%)、Streptococcus(10.1%)、Neisseria(7.1%)、Haemophilus(6.5%)、Sphingomonas(4.6%)、Veillonella(4.6%)、Methylobacterium(4.6%)。Hp与胃内其他菌群呈负作用关系。结论Hp感染会明显降低慢性浅表性胃炎患者胃内菌群的丰度和多样性。展开更多
文摘目的探讨幽门螺杆菌(Hp)感染对慢性胃炎患者胃内菌群丰度和多样性的影响。方法选取2017年10月至2018年6月金华市中心医院收治行胃镜检查的慢性浅表性胃炎患者38例,胃黏膜组织病理学检查和细菌培养结果中任一项为Hp阳性,归为Hp阳性组(Hp-P组,14例);两者均为阴性,归为Hp阴性组(Hp-N组,24例)。将胃黏膜组织研磨后提取基因组DNA,对16S r RNA基因V3~V4可变区进行基因扩增,构建基因文库,基于Illumina Miseq测序平台进行测序。测序数据经生物信息处理后,将得到的有效序列按相似度0.97进行分类单位聚类。比较Hp-P组和Hp-N组菌群的丰度和多样性,以及物种相似性。结果Hp-P组患者胃内菌群的丰度和多样性均明显低于Hp-N组;Hp-P组和Hp-N组物种相似性比较,两组组内菌群结构相似性较高,而两组之间菌群结构存在明显差异。Hp-P组的优势菌群分别为Helicobacter(89.1%)、Prevotella(1.2%)、Methylobacterium(1.1%)、Sphingomonas(1.1%);Hp-N组优势菌群分别为Prevotella(14.5%)、Streptococcus(10.1%)、Neisseria(7.1%)、Haemophilus(6.5%)、Sphingomonas(4.6%)、Veillonella(4.6%)、Methylobacterium(4.6%)。Hp与胃内其他菌群呈负作用关系。结论Hp感染会明显降低慢性浅表性胃炎患者胃内菌群的丰度和多样性。
