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江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析
1
作者
袁晔
刘睿
+5 位作者
王凌云
沈盟
叶雪莲
权新华
王瑞森
姚祥坦
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第8期1773-1781,共9页
利用SLAF-seq技术对江浙地区17个主要的栽培菱品种和1个野生菱种质进行高通量测序,获得445594个SLAF标签,鉴定到多态性SLAF标签95931个。通过序列分析,获得269338个SNP标记,并基于这些SNP构建18份菱样品的遗传发育树及进行群体结构分析...
利用SLAF-seq技术对江浙地区17个主要的栽培菱品种和1个野生菱种质进行高通量测序,获得445594个SLAF标签,鉴定到多态性SLAF标签95931个。通过序列分析,获得269338个SNP标记,并基于这些SNP构建18份菱样品的遗传发育树及进行群体结构分析。结果表明,SLAF-seq技术能高效地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记,基于SNP标记构建的进化树能较好地区分不同类型的菱品种。该结果对开展菱种质资源鉴定和菱种质遗传演化研究具有重要参考价值。
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关键词
菱
遗传多样性
特异性位点扩增片段测序
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析
1
作者
袁晔
刘睿
王凌云
沈盟
叶雪莲
权新华
王瑞森
姚祥坦
机构
嘉兴市
农业
科学研究院
浙江
大学
蔬菜
研究
所
金华市
农业
科学研究院
(
浙江省
农业机械
研究院
)
浙江省
特色
水生
蔬菜
育种与
栽培
重点
实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第8期1773-1781,共9页
基金
浙江省农业(蔬菜)新品种选育重大科技专项(2016C02051-8-1)
嘉兴市科技计划项目(2021AZ10013)。
文摘
利用SLAF-seq技术对江浙地区17个主要的栽培菱品种和1个野生菱种质进行高通量测序,获得445594个SLAF标签,鉴定到多态性SLAF标签95931个。通过序列分析,获得269338个SNP标记,并基于这些SNP构建18份菱样品的遗传发育树及进行群体结构分析。结果表明,SLAF-seq技术能高效地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记,基于SNP标记构建的进化树能较好地区分不同类型的菱品种。该结果对开展菱种质资源鉴定和菱种质遗传演化研究具有重要参考价值。
关键词
菱
遗传多样性
特异性位点扩增片段测序
单核苷酸多态性
Keywords
Trapa L.
genetic diversity
specific-locus amplified fragment sequencing
single nucleotide polymorphism
分类号
S645.4 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析
袁晔
刘睿
王凌云
沈盟
叶雪莲
权新华
王瑞森
姚祥坦
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
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