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真核生物ITS2高级结构及其系统发育应用 被引量:2
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作者 宋忠魁 《钦州学院学报》 2008年第3期49-53,共5页
ITS2是真核生物rRNA基因的重要组成部分,在rRNA基因加工成熟过程中起到至关重要的作用.ITS2的高级结构相对保守,对其序列进化表现一定程度的限制作用.ITS2保守的结构域和二级结构为广范围遗传距离排序提供了重要的技术保障.正因为如此,I... ITS2是真核生物rRNA基因的重要组成部分,在rRNA基因加工成熟过程中起到至关重要的作用.ITS2的高级结构相对保守,对其序列进化表现一定程度的限制作用.ITS2保守的结构域和二级结构为广范围遗传距离排序提供了重要的技术保障.正因为如此,ITS2在高级阶元系统发育关系分析中展示出诱人的前景. 展开更多
关键词 ITS2 高级结构 系统发育
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吡啶、吡嗪和均三嗪的量子化学理论研究 被引量:1
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作者 甘雄 《常州工学院学报》 2006年第3期56-59,共4页
采用ab initio HF、M P2和B3LYP方法计算了吡啶、吡嗪和均三嗪的几何构型,用ZIN-DO/S法对分子的电子光谱进行了计算,运用GA IO-HF计算了分子的化学位移。结果表明:选用M P2对本文讨论的此类化合物键长键角更为适宜;吡啶的最大吸收波长... 采用ab initio HF、M P2和B3LYP方法计算了吡啶、吡嗪和均三嗪的几何构型,用ZIN-DO/S法对分子的电子光谱进行了计算,运用GA IO-HF计算了分子的化学位移。结果表明:选用M P2对本文讨论的此类化合物键长键角更为适宜;吡啶的最大吸收波长大于吡嗪的;分子的化学位移与反应活性有密切联系:杂环分子氢原子的δH值愈小,该位置的亲电取代反应活性愈高,杂环分子氢原子的δH值愈大,该位置的亲核取代反应活性愈高。 展开更多
关键词 量化计算 几何构型 电子光谱 化学位移
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拟穴青蟹(CA)_n微卫星DNA多态性引物筛选 被引量:2
3
作者 宋忠魁 聂振平 王芳宇 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期98-103,共6页
利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术建立拟穴青蟹Scylla paramamosain基因组文库,并与生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针杂交,联合磁珠富集法构建拟穴青蟹微卫星富集文库。测序194个阳性菌落,分析其中... 利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术建立拟穴青蟹Scylla paramamosain基因组文库,并与生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针杂交,联合磁珠富集法构建拟穴青蟹微卫星富集文库。测序194个阳性菌落,分析其中的150条序列,结果表明:两碱基重复类型占90%以上,其中重复拷贝数在30以上的占27.45%;含微卫星座位189个,其中完美型146个、非完美型28个和复合型15个。设计125对引物扩增一个拟穴青蟹野生群体(含20个个体),其中的19对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度。遗传变异分析表明,17个位点表现出高度多态性,16个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),4组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0026,经Bonferroni法校正),7个微卫星位点可能存在无效等位基因。若排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIC(polymorphism information content)值在0.5以下的引物对,则13对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 展开更多
关键词 FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术 磁珠富集法 拟穴青蟹Scylla paramamosain 微卫星
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拟穴青蟹(Scylla paramamosain)微卫星位点开发-基于(AG)12探针杂交 被引量:1
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作者 宋忠魁 聂振平 +1 位作者 谢达 王芳宇 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期171-176,共6页
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP sequences containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星... 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP sequences containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星的概率在增加。利用设计的28对引物扩增一个供试群体,其中12对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度,10个微卫星位点表现出高度多态性,9个微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),两组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0042,经Bonferroni法校正)。Micro-checker分析揭示其中的5个微卫星位点可能存在无效等位基因。排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIc值在0.5以下的引物对,8对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 展开更多
关键词 FIASCO技术 磁珠富集法 拟穴青蟹 微卫星
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广西茅尾海2种养殖牡蛎重金属含量评价 被引量:11
5
作者 宋忠魁 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第1期317-319,共3页
[目的]监测广西茅尾海2种养殖牡蛎重金属含量,评价其食用安全程度和养殖环境质量。[方法]以微波消解法消解样品,联合使用等离子体质谱仪和等离子体发射光谱仪测定广西茅尾海的有明巨牡蛎(Crassostrea ariakensis)和香港巨牡蛎(C.hongkon... [目的]监测广西茅尾海2种养殖牡蛎重金属含量,评价其食用安全程度和养殖环境质量。[方法]以微波消解法消解样品,联合使用等离子体质谱仪和等离子体发射光谱仪测定广西茅尾海的有明巨牡蛎(Crassostrea ariakensis)和香港巨牡蛎(C.hongkongensis)的Cu、Zn、Cd、Cr、Hg、As、Se和Pb共8种重金属的含量。使用5类评价标准并结合采用单项质量指数法和综合质量指数法进行评价。[结果]茅尾海2种牡蛎重金属污染严重,食用价值受到严重威胁。[结论]当前无公害海水养殖用水水质评估和海洋生物质量评估标准有待修订。 展开更多
关键词 茅尾海 牡蛎 重金属 评价
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7种不同物质标定EDTA标准滴定溶液的条件控制及误差分析 被引量:2
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作者 蔡成翔 甘雄 《冶金分析》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第4期65-71,共7页
本文通过CaCO3,MgO,FeNH4(SO4)2.12H2O、锌粒、铜粒、铅粒、铋粒等7种物质在不同条件下对EDTA标准滴定溶液的标定对比试验,研究了酸效应、水解效应、温度、光照、空气浮力、基准物质溶液的配制和酸度的初调、缓冲溶液、指示剂的种类和... 本文通过CaCO3,MgO,FeNH4(SO4)2.12H2O、锌粒、铜粒、铅粒、铋粒等7种物质在不同条件下对EDTA标准滴定溶液的标定对比试验,研究了酸效应、水解效应、温度、光照、空气浮力、基准物质溶液的配制和酸度的初调、缓冲溶液、指示剂的种类和用量等多种因素对标定误差的影响及其消除办法。实验结果表明,只要选择和控制好测定条件,标定方法之间的误差是可以减小或消除的。在本实验条件下,用上述7种物质标定0.020015mol/LEDTA标准滴定溶液,相对误差均小于0.20%。 展开更多
关键词 EDTA标准滴定溶液 标定 误差分析
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6种稠环芳烃有机功能材料电子光谱的理论计算
7
作者 甘雄 《高师理科学刊》 2006年第4期43-45,共3页
稠环有机物是应用较广泛的有机光电材料,为对稠环芳烃同分异构物质的电子光谱进行分析,用从头计算ab initio HF方法和密度泛函B3LYP研究了萘、蒽、菲、并四苯、屈、并五苯的几何构型,用ZINDO/S方法对分子的电子光谱进行了计算.结果表明... 稠环有机物是应用较广泛的有机光电材料,为对稠环芳烃同分异构物质的电子光谱进行分析,用从头计算ab initio HF方法和密度泛函B3LYP研究了萘、蒽、菲、并四苯、屈、并五苯的几何构型,用ZINDO/S方法对分子的电子光谱进行了计算.结果表明,分子主要键长和电子光谱的计算结果与实验数据比较接近,选用HF对此类化合物键长讨论更为适宜.6种稠环芳烃的最大吸收波长依次为Aλmax<Cλmax<Eλmax<Bλmax<Dλmax<Fλmax.线型稠环芳烃环数愈多,最大吸收波长λmax红移愈多,吸收强度也相应增强;同分异构的稠环芳烃,分子线性愈好,吸收波长愈长,吸收强度增强. 展开更多
关键词 量化计算 几何构型 电子光谱 分子轨道
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五员杂环化合物的量子化学理论研究 被引量:6
8
作者 甘雄 李道聪 +2 位作者 黄元乔 沈玉芳 彭正合 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1099-1101,共3页
五员杂环及衍生物是重要的工业原料,有些具有重要的生理作用。为了探讨此类化合物结构特点、化学位移与活性之间的关系,本文采用密度泛函B3LYP和从头计算ab initio HF、MP2方法研究了呋喃、吡咯、噻吩的几何构型,用TD-DFT方法对分子的... 五员杂环及衍生物是重要的工业原料,有些具有重要的生理作用。为了探讨此类化合物结构特点、化学位移与活性之间的关系,本文采用密度泛函B3LYP和从头计算ab initio HF、MP2方法研究了呋喃、吡咯、噻吩的几何构型,用TD-DFT方法对分子的电子光谱进行了计算,运用GAIO-HF计算了分子的化学位移,并将计算数据与实验值进行比较。结果表明:(1)选用MP2对此类化合物键长键角更为适宜;(2)三种化合物电子光谱的最大吸收波长很接近,溶液的计算值优于气相的;(3)分子的化学位移与反应活性有密切联系:化合物α位氢原子的δ_H值愈小,该化合物亲电取代反应活性愈高;同一杂环分子,氢原子的δ_H值愈小,该位置的亲电取代反应活性愈高。 展开更多
关键词 量化计算 几何构型 电子光谱 化学位移
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北部湾6个拟穴青蟹群体遗传多样性的ISSR分析 被引量:2
9
作者 宋忠魁 孙奉玉 +3 位作者 李梦芸 赵鹏 聂振平 苏琼 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2585-2590,共6页
应用ISSR标记技术分析来自北部湾的拟穴青蟹6个地理群体(清化、党江、钦州湾、流沙湾、珍珠湾、闸口)的遗传变异和遗传结构,8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,表明拟穴青蟹在物种水平上的多态位点百... 应用ISSR标记技术分析来自北部湾的拟穴青蟹6个地理群体(清化、党江、钦州湾、流沙湾、珍珠湾、闸口)的遗传变异和遗传结构,8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,表明拟穴青蟹在物种水平上的多态位点百分率是84.85%。拟穴青蟹6个群体的多态位点百分率为51.52%~63.64%,平均为57.58%。群体的遗传多样性按自高至低顺序排列为清化群体>党江群体>钦州湾群体>流沙湾群体>珍珠湾群体>闸口群体。拟穴青蟹在种水平或群体水平上的多态位点百分率和Shannon信息指数表明,拟穴青蟹遗传多样性在甲壳类动物中处于较高层次,但比甲壳类以外的几类经济海产动物遗传多样性低。总的遗传分化系数GST值为0.1841,表明,总遗传变异的绝大部分存在于群体内,群体间的遗传分化程度较大。但是,绝大部分两两群体间的遗传分化系数值在0.0689~0.1276,为中等程度的遗传分化。AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.97%,群体间遗传变异占12.03%,群体间遗传分化程度中等但分化显著。Manteltest结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,来自广西沿海的4个群体聚成一支。 展开更多
关键词 北部湾 拟穴青蟹 ISSR 遗传多样性 遗传分化
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