小鼠心肌肥厚枢纽基因的筛选与鉴定

目的通过生物信息学分析结合生物学实验,筛选和鉴定与心肌肥厚密切相关的枢纽基因。方法从基因表达数据库(GEO)下载小鼠心肌肥厚相关芯片数据,利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因;利用DAVID6.7、String 11.0和Cytoscape 3.7. 0软件对差异基因进行分析;昆明小鼠随机分为生理盐水组(n=6)和血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)组(n=6),建立心肌肥厚模型,通过Real-time PCR方法检测枢纽基因在AngⅡ诱导的昆明小鼠心肌肥厚模型中的表达。结果筛选出共有差异表达基因202个,枢纽基因12个;Real-time PCR结果显示核心蛋白聚糖(Dcn)、HADHA和热休克蛋白(HSP) 90αA1在AngⅡ组中表达明显下调。结论筛选出的枢纽基因可以通过细胞外基质和转化生长因子β(TGF-β)影响昆明小鼠心肌肥厚的发生发展。