人参PR13基因克隆及其蛋白的生物信息学分析

目的:预测分析PR13的结构及功能,方法:使用MEGA X,Expasy-ProtParam,ExPASy-ProtScale,SignaIP-5.0,TMHMM Servery 2.0,InterPro,STRING,SOPMA,Cell-PLoc 2.0及Discovery Studio 2019 Client软件进行分析。结果:结果表明:PR13分子量是8213.73 Da,且为含有信号肽的亲水性蛋白,无跨膜结构;在结构上,以α-螺旋(约38.67%)和不规则卷曲(约44.00%)为主,少量的β-折叠(6.67%)和延长链(10.67%),在系统进化树上与非人参的PR13不在同一分支上。经GO注释后,PR13是其他有机体细胞的清除器,能防御真菌及其他的生物的一种外泌体。结论:该生物信息学分析结果可为人参PR13蛋白与病原菌的互作及非生物胁迫的抗性机理和人参抗胁迫品种的选育和改良提供理论依据。