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2019—2022年长春地区柯萨奇病毒A6的流行病学与分子特征分析
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作者 乔凤娟 孙炳欣 +3 位作者 张兴国 李晨光 阴媛 张舒峰 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2024年第10期1200-1205,1213,共7页
目的分析2019—2022年长春地区引起手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)的流行情况及其VP1区的基因特征,探讨其流行规律,为优化防控策略提供参考。方法收集2019—2022年长春临床诊断HFM... 目的分析2019—2022年长春地区引起手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)的流行情况及其VP1区的基因特征,探讨其流行规律,为优化防控策略提供参考。方法收集2019—2022年长春临床诊断HFMD病例样本878份,采用实时荧光RT-PCR方法进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测。对CV-A6阳性样本的VP1基因区进行RT-PCR扩增及测序。再利用MEGA 11构建系统发育树,并使用DNAstarV8.1.3软件分析核苷酸序列同源性和氨基酸变异。结果878份HFMD病例标本中,检出EV阳性588份,总检出率为66.97%(588/878);检出CV-A6阳性245份,CV-A6检出率为41.67%(245/588)。125份CV-A6阳性样本成功扩增并测序了VP1基因。系统发育分析表明,2019—2022年长春市测定的125株CV-A6毒株均属于D3a基因型,125株CV-A6毒株之间的核苷酸序列同源性为88.1%~100%,与原型株(Gdula)的同源性为81.2%~84.3%。其VP1区氨基酸序列出现了36个突变位点。结论2019—2022年长春地区引起HFMD的优势病原体是CV-A6,也是我国内地地区主流基因亚型D3a,但多条传播链共同循环进化。应进一步加强对CV-A6的监测。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6 VP1基因 基因型 分子流行病学
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