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酿酒葡萄LOX基因家族成员鉴定及冷胁迫下的表达分析
1
作者
李洋
胡焕平
+4 位作者
王岩峰
李茂峰
张井刚
刘凯
王红霞
《中外葡萄与葡萄酒》
北大核心
2024年第6期10-18,共9页
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员...
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员,分析其理化性质、基因结构、保守基序、启动子结合元件、蛋白互作等结构特征,进一步分析其表达。结果表明,酿酒葡萄LOX家族共10个成员,开放阅读框540~2763 bp,编码10条蛋白质序列,编码氨基酸179~920个,等电点在5.60~8.25;对酿酒葡萄、拟南芥、番茄和水稻LOX家族蛋白进行了系统发育分析,结果发现,酿酒葡萄分为13-LOX和9-LOX两个亚组;qPCR分析结果显示,10个基因均可以被冷胁迫诱导表达,在不同组织出现特异性表达。本研究结果将为阐明LOX家族生物学功能提供理论依据。
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关键词
酿酒葡萄
脂氧合酶
生物信息分析
逆境胁迫
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题名
酿酒葡萄LOX基因家族成员鉴定及冷胁迫下的表达分析
1
作者
李洋
胡焕平
王岩峰
李茂峰
张井刚
刘凯
王红霞
机构
滨州职业学院
滨州市滨城区林业技术服务
中
心
阳信县中润农发集团
滨州无棣谭阳林场
河北
农
业大学
出处
《中外葡萄与葡萄酒》
北大核心
2024年第6期10-18,共9页
基金
滨州职业学院博士基金(2022bzbs01)
“十四五”国家重点研发计划课题(2022YFD2200402)
+1 种基金
河北省重点研发计划项目(21326352D)
滨州市农社领域科技创新政策引导计划项目(2023KTPY013)。
文摘
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员,分析其理化性质、基因结构、保守基序、启动子结合元件、蛋白互作等结构特征,进一步分析其表达。结果表明,酿酒葡萄LOX家族共10个成员,开放阅读框540~2763 bp,编码10条蛋白质序列,编码氨基酸179~920个,等电点在5.60~8.25;对酿酒葡萄、拟南芥、番茄和水稻LOX家族蛋白进行了系统发育分析,结果发现,酿酒葡萄分为13-LOX和9-LOX两个亚组;qPCR分析结果显示,10个基因均可以被冷胁迫诱导表达,在不同组织出现特异性表达。本研究结果将为阐明LOX家族生物学功能提供理论依据。
关键词
酿酒葡萄
脂氧合酶
生物信息分析
逆境胁迫
Keywords
wine grape
lipoxygenase
bioinformatics analysis
abiotic stress
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
S426 [农业科学—植物保护]
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作者
出处
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被引量
操作
1
酿酒葡萄LOX基因家族成员鉴定及冷胁迫下的表达分析
李洋
胡焕平
王岩峰
李茂峰
张井刚
刘凯
王红霞
《中外葡萄与葡萄酒》
北大核心
2024
0
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