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酿酒葡萄LOX基因家族成员鉴定及冷胁迫下的表达分析
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作者 李洋 胡焕平 +4 位作者 王岩峰 李茂峰 张井刚 刘凯 王红霞 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2024年第6期10-18,共9页
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员... 脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员,分析其理化性质、基因结构、保守基序、启动子结合元件、蛋白互作等结构特征,进一步分析其表达。结果表明,酿酒葡萄LOX家族共10个成员,开放阅读框540~2763 bp,编码10条蛋白质序列,编码氨基酸179~920个,等电点在5.60~8.25;对酿酒葡萄、拟南芥、番茄和水稻LOX家族蛋白进行了系统发育分析,结果发现,酿酒葡萄分为13-LOX和9-LOX两个亚组;qPCR分析结果显示,10个基因均可以被冷胁迫诱导表达,在不同组织出现特异性表达。本研究结果将为阐明LOX家族生物学功能提供理论依据。 展开更多
关键词 酿酒葡萄 脂氧合酶 生物信息分析 逆境胁迫
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