基于转录组学筛选特发性肺纤维化的枢纽基因和信号通路

目的基于转录组学数据筛选特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)致病的枢纽基因和相关信号通路。方法从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中下载GSE17978数据集,应用GEO2R筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),采用R软件ggplot2包和Heatmap包分别绘制DEGs的火山图和热图。采用R软件的clusterProfiler包进行DEGs基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。采用R软件中的ggplot2包绘制气泡图。运用STRING和Cytoscape软件构建DEGs的蛋白质互作网络,应用Cytoscape的Cytohubba插件筛选参与IPF发病的枢纽基因。采用GSE10667数据集验证DEGs的差异表达。结果共获得92个DEGs,其中上调基因49个,下调基因43个;GO分析和KEGG通路富集结果显示,DEGs主要在细胞外基质组织、胶原蛋白结合、PI3K-Akt信号通路及TGF-β信号通路等显著富集。运用STRING和cytoscape构建了DEGs的蛋白质互作网络,与IPF相关10个枢纽基因为FN1、CXCL12、DCN、COL1A1、MMP2、SPARC、SPP1、POSTN、COL1A2和COL3A1,其中9个枢纽基因在验证数据集GSE10667中有显著差异表达。结论获得的92个DEGs和9个枢纽基因可能是IPF潜在的生物标志物。

中医中药联合情志关怀治疗慢性阻塞性肺疾病急性发作期的临床分析

慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是呼吸系统常见疾病[1]。COPD急性发作期(acute exacebation chronic obstructive pulmonary disease,AECOPD)病情发展快,甚至影响到患者的生命[2]。常规西医治疗AECOPD疗效不甚满意[3]。中医学将COPD纳入“咳嗽”、“喘症”等范畴,遵循内病外治理论,因经络“内属脏腑,外络肢节,沟通表里,贯穿上下”功效,穴位贴敷作用穴位经络,起到治病的目的[4]。其次COPD患者持续不佳的心理状态,可诱发患者显著的焦虑、抑郁等,致交感神经张力增加、心率加快、血压升高,使不良反应出现叠加效应[5⁃6]。因此重视COPD患者不良的心理诉求,以达到身心舒适的目的。本文对AECOPD患者采用中医中药穴位敷贴联合情志关怀,取得一定效果,报道如下。