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2017年中国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征
被引量:
26
1
作者
李薇薇
郭云昌
+14 位作者
占利
马国柱
杨祖顺
刘成伟
申志新
王迪
张晓嫒
宋晓红
余波
贾华云
李秀桂
张秀丽
杨小蓉
杨大进
裴晓燕
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期175-180,共6页
目的分析我国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征。方法将2017年食品安全风险监测即食食品中分离的单核细胞增生李斯特菌作为研究菌株,共239株,分离自27个省份。对菌株进行全基因组测序,分析其谱系、克隆群(CC)、序列分...
目的分析我国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征。方法将2017年食品安全风险监测即食食品中分离的单核细胞增生李斯特菌作为研究菌株,共239株,分离自27个省份。对菌株进行全基因组测序,分析其谱系、克隆群(CC)、序列分型(ST)和血清群;通过VFDB和BIGSdb‐Lm数据库获得其毒力基因分布;采用微量肉汤稀释法检测菌株对8种抗生素的敏感性;采用核心基因组多位点序列分型方法(cgMLST)进行分子分型。结果实验菌株分属在3个谱系,以谱系Ⅱ为主,共155株(64.9%);血清群以Ⅱa为主,共133株(55.6%);分为23个CC型,以及1个未分CC型的ST619,其中CC8、CC101和CC87为优势CC型,共占49.4%(118株);仅4.6%(11株)的菌株携带耐药基因,主要为甲氧苄啶耐药基因(7株,2.9%)。所有菌株均携带单核细胞增生李斯特菌毒力岛(LIPI)1,携带LIPI‐3和LIPI‐4的菌株分别占13.8%(33株)和14.2%(34株),ST619同时携带LIPI‐3和LIPI‐4。51.5%(123株)的菌株携带应激生存岛(SSI)1,10株CC121菌株均携带SSI‐2。核心基因组多位点序列分型方法能将不同谱系、血清群和CC型的菌株明显分开,共分为24个亚群,与CC型基本保持一致。结论我国即食食品中菌株以Ⅱa型血清群为主,CC8、CC101和CC87为优势CC型,其中,CC87为流行性高毒菌株。基于全基因组测序的分型方法cgMLST分辨力高,可用于我国食源性疾病的监测和暴发识别。
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关键词
利斯特菌
单核细胞增生
分子流行病学
全基因组测序
核心基因组多位点序列分型
即食食品
原文传递
题名
2017年中国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征
被引量:
26
1
作者
李薇薇
郭云昌
占利
马国柱
杨祖顺
刘成伟
申志新
王迪
张晓嫒
宋晓红
余波
贾华云
李秀桂
张秀丽
杨小蓉
杨大进
裴晓燕
机构
国家食品安全风险评估
中心
风险监测部
浙江省
疾病
预防
控制
中心
微生物
检验所
陕西省疾病控制中心病原微生物与生物检验所
云南省
疾病
预防
控制
中心
卫生
检验
中心
江西省
疾病
预防
控制
中心
营养与食品安全所
河北省
疾病
预防
控制
中心
微生物
检验所
北京市
疾病
预防
控制
中心
营养与食品卫生所
山西省
疾病
预防
控制
中心
消毒监测科
湖北省
疾病
预防
控制
中心
卫生
检验
检测研究所
湖南省
疾病
预防
控制
中心
微生物
检验
科
广西壮族自治区
疾病
预防
控制
中心
微生物
检验所
河南省
疾病
预防
控制
中心
卫生检测
检验
中心
四川省
疾病
预防
控制
中心
微生物
检验所
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期175-180,共6页
基金
国家重点研发计划(2017YFC1601503)
北京市优秀人才培养资助-青年骨干个人项目(2015000021469G186)。
文摘
目的分析我国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征。方法将2017年食品安全风险监测即食食品中分离的单核细胞增生李斯特菌作为研究菌株,共239株,分离自27个省份。对菌株进行全基因组测序,分析其谱系、克隆群(CC)、序列分型(ST)和血清群;通过VFDB和BIGSdb‐Lm数据库获得其毒力基因分布;采用微量肉汤稀释法检测菌株对8种抗生素的敏感性;采用核心基因组多位点序列分型方法(cgMLST)进行分子分型。结果实验菌株分属在3个谱系,以谱系Ⅱ为主,共155株(64.9%);血清群以Ⅱa为主,共133株(55.6%);分为23个CC型,以及1个未分CC型的ST619,其中CC8、CC101和CC87为优势CC型,共占49.4%(118株);仅4.6%(11株)的菌株携带耐药基因,主要为甲氧苄啶耐药基因(7株,2.9%)。所有菌株均携带单核细胞增生李斯特菌毒力岛(LIPI)1,携带LIPI‐3和LIPI‐4的菌株分别占13.8%(33株)和14.2%(34株),ST619同时携带LIPI‐3和LIPI‐4。51.5%(123株)的菌株携带应激生存岛(SSI)1,10株CC121菌株均携带SSI‐2。核心基因组多位点序列分型方法能将不同谱系、血清群和CC型的菌株明显分开,共分为24个亚群,与CC型基本保持一致。结论我国即食食品中菌株以Ⅱa型血清群为主,CC8、CC101和CC87为优势CC型,其中,CC87为流行性高毒菌株。基于全基因组测序的分型方法cgMLST分辨力高,可用于我国食源性疾病的监测和暴发识别。
关键词
利斯特菌
单核细胞增生
分子流行病学
全基因组测序
核心基因组多位点序列分型
即食食品
Keywords
Listeria monocytogenes
Molecular epidemiology
Genome-wide sequencing
Core genome multilocus sequence typing
Ready-to-eat food
分类号
R15 [医药卫生—营养与食品卫生学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2017年中国即食食品中单核细胞增生李斯特菌的分子流行病学特征
李薇薇
郭云昌
占利
马国柱
杨祖顺
刘成伟
申志新
王迪
张晓嫒
宋晓红
余波
贾华云
李秀桂
张秀丽
杨小蓉
杨大进
裴晓燕
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
26
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