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秦川肉牛CGI-58基因SNP位点与肉质及其启动子活性的关系
1
作者
王晓宇
李安宁
+3 位作者
桂林生
Sayed Haidar Abbas Raza
吴森
昝林森
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第4期13-19,27,共8页
【目的】探究秦川肉牛CGI-58基因5′-调控区中1个新单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与肉品质的关联性,及其对该基因启动子活性的影响。【方法】选取18~24月龄的480头秦川肉牛为研究对象,测定其肌内脂肪含量、眼...
【目的】探究秦川肉牛CGI-58基因5′-调控区中1个新单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与肉品质的关联性,及其对该基因启动子活性的影响。【方法】选取18~24月龄的480头秦川肉牛为研究对象,测定其肌内脂肪含量、眼肌面积和背膘厚等肉品质性状指标。颈静脉采集试验牛血样,提取DNA样品,PCR扩增CGI-58基因5′-调控区,通过直接测序技术检测其单核苷酸多态性,并使用SAS(version 8.1)软件提供的一般线性模型(GLM)对单核苷酸多态位点与肉质性状进行关联分析。通过MatInspector和cMethPrimer软件分析CGI-58基因潜在的转录因子结合位点及其甲基化水平。构建含有SNP位点不同基因型的双荧光素酶报告载体,并转染小鼠3T3L-1、C2C12细胞系和牛前体脂肪细胞,测定其在3种细胞中的荧光素酶相对活性,并进行统计学分析。【结果】在秦川肉牛CGI-58基因5′-调控区发现1个新的SNP位点:g.14451079A>C。g.14451079A>C位点共有3种基因型:AA、CC和AC,其中AA基因型频率最高,A等位基因频率大于C等位基因频率,且AC基因型的启动子活性与眼肌面积显著高于其他基因型。g.14451079A>C由A到C的突变发生在CGI-58启动子区域中一个预测的转录因子结合位点v-myb的第2个碱基A上,该突变导致启动子活性发生了显著变化,且该转录因子结合位点位于软件分析的CpG岛上。【结论】秦川肉牛CGI-58基因启动子区g.14451079A>C位点的单核苷酸多态性与眼肌面积存在显著关联,且对该基因启动子活性有极显著影响。
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关键词
CGI-58基因
秦川肉牛
启动子活性
肉品质
v-myb
下载PDF
职称材料
秦川肉牛FABP3及FABP4基因SNP与肉质性状的关联性
被引量:
6
2
作者
余横伟
桂林生
+1 位作者
胡言
昝林森
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第3期1-7,15,共8页
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,...
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,提取血液DNA,PCR扩增FABP3及FABP4基因,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析SNP位点基因型和单倍型组合对肉牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量)的影响。【结果】测序发现,在FABP3基因第3个内含子上检测出1个SNP位点:g.60298C>T。在FABP4基因第1个内含子上检测出2个SNP位点:g.2686A>T和g.2834C>G;在第4外显子上检测出1个SNP位点:g.4220A>G。FABP3基因g.60298C>T位点不同基因型的肌内脂肪含量差异显著(P<0.05),TT基因型显著高于CT和CC基因型。对FABP4基因而言,g.2834C>G位点上的CC基因型肉用性状表现较优,其眼肌面积极显著高于GG和CT基因型(P<0.01),肌内脂肪含量显著高于GG和CG基因型(P<0.05);g.4220A>G位点上的TT基因型的肉用性状较优,其背膘厚显著高于CC和CT基因型(P<0.05)。H1H1是最优秀的单倍型组合,其眼肌面积和肌内脂肪含量分别极显著高于单倍型组合H3H3和H3H7(P<0.01)。【结论】FABP3及FABP4基因与秦川牛肉用新品系肉用性状关联紧密。
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关键词
秦川牛肉用新品系
FABP3基因
FABP4基因
多态性
关联分析
下载PDF
职称材料
题名
秦川肉牛CGI-58基因SNP位点与肉质及其启动子活性的关系
1
作者
王晓宇
李安宁
桂林生
Sayed Haidar Abbas Raza
吴森
昝林森
机构
西北农林科技大学动物科技学院
国家
肉牛
改良
中心
现代牛业生物
技术
与应用国家地方联合
工程
研究
中心
陕西省肉牛工程技术研究中心
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第4期13-19,27,共8页
基金
国家科技支撑计划项目(2015BAD03B04)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-38)
陕西省科技统筹创新工程计划项目(2014KTZB02-02-01)
文摘
【目的】探究秦川肉牛CGI-58基因5′-调控区中1个新单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与肉品质的关联性,及其对该基因启动子活性的影响。【方法】选取18~24月龄的480头秦川肉牛为研究对象,测定其肌内脂肪含量、眼肌面积和背膘厚等肉品质性状指标。颈静脉采集试验牛血样,提取DNA样品,PCR扩增CGI-58基因5′-调控区,通过直接测序技术检测其单核苷酸多态性,并使用SAS(version 8.1)软件提供的一般线性模型(GLM)对单核苷酸多态位点与肉质性状进行关联分析。通过MatInspector和cMethPrimer软件分析CGI-58基因潜在的转录因子结合位点及其甲基化水平。构建含有SNP位点不同基因型的双荧光素酶报告载体,并转染小鼠3T3L-1、C2C12细胞系和牛前体脂肪细胞,测定其在3种细胞中的荧光素酶相对活性,并进行统计学分析。【结果】在秦川肉牛CGI-58基因5′-调控区发现1个新的SNP位点:g.14451079A>C。g.14451079A>C位点共有3种基因型:AA、CC和AC,其中AA基因型频率最高,A等位基因频率大于C等位基因频率,且AC基因型的启动子活性与眼肌面积显著高于其他基因型。g.14451079A>C由A到C的突变发生在CGI-58启动子区域中一个预测的转录因子结合位点v-myb的第2个碱基A上,该突变导致启动子活性发生了显著变化,且该转录因子结合位点位于软件分析的CpG岛上。【结论】秦川肉牛CGI-58基因启动子区g.14451079A>C位点的单核苷酸多态性与眼肌面积存在显著关联,且对该基因启动子活性有极显著影响。
关键词
CGI-58基因
秦川肉牛
启动子活性
肉品质
v-myb
Keywords
CGI- 58 gene
Qinchuan beef cattle
promoter activity
meat quality
v-myb
分类号
S823.12 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
秦川肉牛FABP3及FABP4基因SNP与肉质性状的关联性
被引量:
6
2
作者
余横伟
桂林生
胡言
昝林森
机构
西北农林科技大学动物科技学院
国家
肉牛
改良
中心
陕西省肉牛工程技术研究中心
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018年第3期1-7,15,共8页
基金
国家科技支撑计划项目(2015BAD03B04)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-38)
陕西省科技统筹创新工程计划项目(2014KTZB02-02-01)
文摘
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,提取血液DNA,PCR扩增FABP3及FABP4基因,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析SNP位点基因型和单倍型组合对肉牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量)的影响。【结果】测序发现,在FABP3基因第3个内含子上检测出1个SNP位点:g.60298C>T。在FABP4基因第1个内含子上检测出2个SNP位点:g.2686A>T和g.2834C>G;在第4外显子上检测出1个SNP位点:g.4220A>G。FABP3基因g.60298C>T位点不同基因型的肌内脂肪含量差异显著(P<0.05),TT基因型显著高于CT和CC基因型。对FABP4基因而言,g.2834C>G位点上的CC基因型肉用性状表现较优,其眼肌面积极显著高于GG和CT基因型(P<0.01),肌内脂肪含量显著高于GG和CG基因型(P<0.05);g.4220A>G位点上的TT基因型的肉用性状较优,其背膘厚显著高于CC和CT基因型(P<0.05)。H1H1是最优秀的单倍型组合,其眼肌面积和肌内脂肪含量分别极显著高于单倍型组合H3H3和H3H7(P<0.01)。【结论】FABP3及FABP4基因与秦川牛肉用新品系肉用性状关联紧密。
关键词
秦川牛肉用新品系
FABP3基因
FABP4基因
多态性
关联分析
Keywords
Qinchuan beef cattle
FABP3 genes
FABP4 genes
polymorphism
association analysis
分类号
S823.92 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
秦川肉牛CGI-58基因SNP位点与肉质及其启动子活性的关系
王晓宇
李安宁
桂林生
Sayed Haidar Abbas Raza
吴森
昝林森
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018
0
下载PDF
职称材料
2
秦川肉牛FABP3及FABP4基因SNP与肉质性状的关联性
余横伟
桂林生
胡言
昝林森
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2018
6
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职称材料
已选择
0
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