HLA高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族髓系白血病的关联性研究

目的:探讨HLA-A,-B,-DRB1高分辨等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(AML)和慢性髓系白血病(CML)的相关性。方法:以1241例健康非亲缘造血干细胞捐献者为对照,采用PCR-SBT、-SSO和-SSP方法对259例髓系白血病患者进行HLA-A,B,DRB1高分辨分型,运用Arleguin 3.5.2软件计算基因频率及单体型频率,病例对照研究计算疾病比值比(ocld ratio,OR);用Swiss-Model对差异HLA分子进行同源建模,Swiss-Pdb Viewer v4.1软件对分子间三维结构进行差异比对。结果:经χ~2检验、连续校正显示,AML组(n=189)的A*02:07(8.47%vs 5.28%,P=0.013)、A*29:01(1.85%vs 0.68%,P=0.044)、B*07:02(5.29%vs 3.10%,P=0.029)、B*07:05:01G(1.85%vs 0.68%,P=0.044)、B*35:02(1.06%vs 0.20%,P=0.023)的基因频率高于对照组,而AML组的A*02:03频率则低于对照组(0.79%vs 3.10%,P=0.011)。CML组(n=70)的B*46:01频率低于对照组(2.86%vs 7.82%,P=0.031),但上述等位基因经Bonferroni校正后,均显示无统计学差异。经Fisher精确概率检验和Bonferroni校正,DRB1*11:28及其单体型A*24:02-B*15:01-DRB1*11:28频率在陕西籍CML患者中显著升高(1.43%vs 0.00%,Pc'=0.015;1.43%vs 0.00%,P=0.003)。Swiss-Pdb Viewer v 4.1软件计算DRB1*11:28和DRB1*11:01分子肽结合区主链间均方根偏差(RMSD)为0.09 nm。经Bonferroni校正单体型A*03:01-B*50:01-DRB1*07:01和A*11:01-B*40:06-DRB1*09:01分别在AML和CML患者中频率显著升高(1.06%vs 0.00%,Pc=0.000;2.86%vs 0.07%,Pc=0.000),与白血病呈正相关(OR=59.66,95%CI=3.21-1110.39;OR=42.91,95%CI=7.07-260.32)。结论:北方汉族AML和CML患者携带有特定的易感单体型,DRB1*11:28与CML发病呈正相关,可能不能有效结合并提呈bcr-abl肽段给CD4^+T细胞,是北方汉族尤其陕西籍发生CML的易感基因(OR=89.62,95%CI=4.28-1875.87),并与其特定单体型关联。

HLA新等位基因HLA-A*11∶230序列分析及确认

目的对人类白细胞抗原(HLA)-A*11新等位基因核苷酸序列分析及确认。方法采用多聚酶链反应-测序(PCR-SBT)在对2015年中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)入库数据进行HLA常规分型中,应用组序列特异性引物(GSSP)单链测序方法针对常规SBT检测中A位点无匹配结果的2例无亲缘关系陕西汉族供者样本进一步进行确证实验,并运用聚合酶链式反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)进行对照实验。结果经确证实验发现2例无亲缘关系供者携带同一HLA-A新等位基因序列,与同源基因HLA-A*11∶01序列相比,均在第2外显子98位置发生A>G突变,该突变造成氨基酸序列9位由酪氨酸(TAC)变成半胱氨酸(TGC);而2例样本的PCR-SSO结果均显示为HLA-A的常见等位基因组合,未见异常反应格局。结论经WHO HLA因子命名委员会正式命名的新等位基因HLA-A*11:230的发现和鉴定表明,对于常规测序无匹配结果的样本应进一步深入分析,即使以常见等位基因组合为分型结果的SSO方法仍存在HLA新等位基因漏检的可能,需引起注意。

人类白细胞抗原高分辨等位基因及单倍型与北方汉族急性淋巴细胞白血病的关联性

目的探讨人类白细胞抗原（human leukocyte antigen，HLA）-A，-B，-DRB1高分辨等位基因及单倍型多态性与北方汉族急性淋巴细胞白血病（acutelymphoblastic leukemia，ALL）的相关性。方法以1241名正常非亲缘造血干细胞捐献者为对照，应用聚合酶链反应一测序分型（polymerase chain reaction-sequence-basedtyping，PCR-SBT）、序列特异寡核苷酸探针技术（sequence specific oligonucleotide probes，SSO）和组特异性引物扩增（sequence specificprimer，SSP）方法对170例ALL患者进行HLA-A、-B、-DRB1高分辨分型，用Arlequin3．5．2软件计算HLA基因频率和单倍型频率，计算疾病比值比（oddratio，OR）进行病例对照研究。结果经X2检验、连续校正显示，与对照组相比ALL患者的B＊13：01和B＊40：02频率升高（7．35％弧4．63％，P=0．030；2．94％vs．1．45％，P=0．042），而B＊35：03和B＊46：01频率降低（O．29％强1．69％，P=0．048；4．41％7iS．7．82％，P=0．025），但经Bonferroni校正后显示差异均无统计学意义。在ALL患者中频率增加的DRB1＊15组尽管经Bonferroni校正后差异无统计学意义，但其组内的DRB1＊15：01基因频率经Bonferroni校正后仍显著高于对照组（16．18％邯．10．19％，Pc’=0．041），与ALL呈正相关（OR=1．70，95％CI：1．24～2．33）。19种单倍型在ALL中的频率显著高于对照组，其中11种单倍型在对照组中未出现过，与白血病呈正相关。结论本研究获得了HLAA、-B、-DRB1高分辨等位基因及单倍型与北方汉族ALL相关性的资料，DRB1＊15：01与北方汉族ALL患者正相关，可能是北方汉族发生ALL的易感基因，并与其特定单倍型关联。