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基于TCGA数据库肺腺癌衰老相关基因预后模型的建立与验证
1
作者
邢龙
吴双丽
+4 位作者
吴铁成
徐敬宣
李保健
田平
李醒亚
《海南医学》
CAS
2024年第10期1374-1379,共6页
目的探究肺腺癌(LUAD)差异表达的衰老相关基因(ARGs),并构建LUAD衰老相关基因的预后模型。方法LUAD的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,AgingAtlas数据库获取ARGs,并基于LUAD中衰老相关差异表达基因构建LUAD预后模...
目的探究肺腺癌(LUAD)差异表达的衰老相关基因(ARGs),并构建LUAD衰老相关基因的预后模型。方法LUAD的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,AgingAtlas数据库获取ARGs,并基于LUAD中衰老相关差异表达基因构建LUAD预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值。结果通过韦恩图去交集共获得80个衰老相关差异表达基因。通过单因素、多因素Cox回归分析筛选得到7个具有独立预后意义的差异表达ARGs,对筛选出的7个基因进行LASSO回归分析并构建LUAD预后模型。构建Kaplan-Meier生存曲线显示,与低风险组相比,高风险组与较差的OS显著相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。1、3和5年受试者操作特性(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.706、0.725、0.642,提示风险模型有较高的灵敏度和特异度。单因素及多因素Cox回归显示,风险评分为LUAD独立预后因素。进一步基于风险评分构建列线图及校准曲线,校准曲线列线图全局的一致性为0.729,说明该模型预测结果与实际情况有较高的准确度。结论基于差异表达的ARGs构建的风险模型可作为LUAD的一种预后特征,为LUAD患者个体化治疗提供参考。
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关键词
衰老基因
肺腺癌
预后模型
TCGA数据库
生物信息学
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职称材料
题名
基于TCGA数据库肺腺癌衰老相关基因预后模型的建立与验证
1
作者
邢龙
吴双丽
吴铁成
徐敬宣
李保健
田平
李醒亚
机构
青岛
滨海学院
附属
医院
肿瘤
科
郑州大学第一
附属
医院
肿瘤
科
青岛滨海学院附属医院特检科
出处
《海南医学》
CAS
2024年第10期1374-1379,共6页
基金
山东省医药卫生科技发展计划项目(编号:202203100054)
青岛西海岸新区2020年度科技惠民项目(编号:2020-44)。
文摘
目的探究肺腺癌(LUAD)差异表达的衰老相关基因(ARGs),并构建LUAD衰老相关基因的预后模型。方法LUAD的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,AgingAtlas数据库获取ARGs,并基于LUAD中衰老相关差异表达基因构建LUAD预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值。结果通过韦恩图去交集共获得80个衰老相关差异表达基因。通过单因素、多因素Cox回归分析筛选得到7个具有独立预后意义的差异表达ARGs,对筛选出的7个基因进行LASSO回归分析并构建LUAD预后模型。构建Kaplan-Meier生存曲线显示,与低风险组相比,高风险组与较差的OS显著相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。1、3和5年受试者操作特性(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.706、0.725、0.642,提示风险模型有较高的灵敏度和特异度。单因素及多因素Cox回归显示,风险评分为LUAD独立预后因素。进一步基于风险评分构建列线图及校准曲线,校准曲线列线图全局的一致性为0.729,说明该模型预测结果与实际情况有较高的准确度。结论基于差异表达的ARGs构建的风险模型可作为LUAD的一种预后特征,为LUAD患者个体化治疗提供参考。
关键词
衰老基因
肺腺癌
预后模型
TCGA数据库
生物信息学
Keywords
Aging-related genes
Lung adenocarcinoma
Prognostic model
TCGA database
Bioinformatics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TCGA数据库肺腺癌衰老相关基因预后模型的建立与验证
邢龙
吴双丽
吴铁成
徐敬宣
李保健
田平
李醒亚
《海南医学》
CAS
2024
0
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职称材料
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参考文献
引证文献
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