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孟德尔随机化在胰腺癌研究中的应用现状与展望
1
作者
杜凯豪
侯立朝
+3 位作者
罗兰明慧
东小鸽
蒋威
王展
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024年第10期2127-2136,共10页
胰腺癌的发病隐匿性强,治疗困难,早期诊断和治疗存在诸多局限性。本文总结了孟德尔随机化(MR)在胰腺癌风险因素探索中的应用进展,特别分析了肠道微生态、生活方式、代谢性疾病等因素的因果关系。通过大规模基因组关联研究(GWAS)数据,MR...
胰腺癌的发病隐匿性强,治疗困难,早期诊断和治疗存在诸多局限性。本文总结了孟德尔随机化(MR)在胰腺癌风险因素探索中的应用进展,特别分析了肠道微生态、生活方式、代谢性疾病等因素的因果关系。通过大规模基因组关联研究(GWAS)数据,MR分析揭示了若干与胰腺癌风险相关的生物标志物。双样本MR是当前研究中的常用方法,包括逆方差加权法、加权中位数、MR-Egger法等,有助于从遗传角度解释疾病的因果网络。尽管MR策略可以为理解胰腺癌的病因学提供新视角,但其在数据合成、工具变量选择及多效性评估方面仍需谨慎。新兴分析模型如贝叶斯加权MR(BWMR)、CAUSE和多变量MR(MVMR)等,为综合评估多重风险因素及其相互关系带来新的可能。未来,结合上述方法及累积增多的遗传流行病学资料,MR分析预期能够为发现胰腺癌的潜在治疗靶点和制订预防策略提供更为坚实的证据基础。
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关键词
胰腺肿瘤
孟德尔随机化分析
因果律
下载PDF
职称材料
基于影像组学及临床特征的机器学习模型鉴别肝细粒棘球蚴病病灶活性的研究
2
作者
汪占金
陈志恒
+5 位作者
李富源
蔡俊杰
薛张佗
周瀛
曹云太
王展
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2024年第5期582-593,共12页
目的开发影像组学和临床特征的机器学习模型,以精准鉴别肝细粒棘球蚴病(HCE)病灶的生物活性。方法收集2018—2022年就诊于青海大学附属医院肝胆胰外科的521例HCE患者和就诊于果洛州人民医院普外科和玉树州人民医院普外科的236例HCE患者...
目的开发影像组学和临床特征的机器学习模型,以精准鉴别肝细粒棘球蚴病(HCE)病灶的生物活性。方法收集2018—2022年就诊于青海大学附属医院肝胆胰外科的521例HCE患者和就诊于果洛州人民医院普外科和玉树州人民医院普外科的236例HCE患者的CT图像及临床资料,提取影像特征并进行筛选。对临床资料采用单因素及多因素Logistic回归分析,筛选构建模型的特征。采用Logistic回归(LR)、支持向量机(SVM)、K-近邻算法(KNN)、随机森林(RandomForest)、极限梯度提升(XGBoost)、轻量级梯度提升机(LightGBM)、极端随机树(ExtraTrees)等7种机器学习算法构建影像组学模型和临床模型,结合影像组学模型和临床模型的预测结果,基于软投票法构建联合模型,采用Delong检验比较影像组学模型、临床模型和临床-影像联合模型的性能,并通过外部验证评估模型性能。结果共430例患者被纳入进行模型开发训练,171例患者作为外部验证,筛选出51个影像特征及5个临床特征用于构建模型。7种机器学习模型中,以XGBoost算法性能表现最佳,其构建的临床模型在训练集和外部验证集上的AUC值均最大,分别为0.977[95%置信区间(95%CI):0.964~0.990]和0.839(95%CI:0.776~0.901);其构建的影像组学模型AUC值均最大,分别为0.998(95%CI:0.997~1.000)和0.874(95%CI:0.822~0.927);其构建的联合模型AUC值均最大,分别为1.000(95%CI:0.999~1.000)和0.931(95%CI:0.894~0.968)。DeLong检验结果表明,联合模型在训练集上的性能优于临床模型(Z=2.154,P<0.05),与影像组学模型差异无统计学意义(Z=0.562,P>0.05);在外部验证集上的性能优于临床模型和影像组学模型(Z=3.338、3.331,P<0.05)。校准曲线和决策分析(DCA)曲线表明,联合模型在训练集和外部验证集的校准性能最佳、净收益最高,在不同数据集上性能稳定,在外部验证中展现了良好的泛化能力和可靠性。结论基于影像组学以及临床数据开发的机器学习模型能够精准鉴别肝细粒棘球蚴病病灶的生物活性,联合模型具更高的诊断精度和临床应用潜力,可为HCE患者的治疗方案提供参考。
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关键词
肝细粒棘球蚴病
病灶活性
机器学习模型
影像组学
临床特征
原文传递
题名
孟德尔随机化在胰腺癌研究中的应用现状与展望
1
作者
杜凯豪
侯立朝
罗兰明慧
东小鸽
蒋威
王展
机构
青海大学
临床医学院
青海大学
附属
医院
普通外科
青海大学附属医院医工结合与转化应用部
出处
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024年第10期2127-2136,共10页
基金
国家自然科学基金(82160131)
青海省科技厅项目(2021-ZJ-963Q)。
文摘
胰腺癌的发病隐匿性强,治疗困难,早期诊断和治疗存在诸多局限性。本文总结了孟德尔随机化(MR)在胰腺癌风险因素探索中的应用进展,特别分析了肠道微生态、生活方式、代谢性疾病等因素的因果关系。通过大规模基因组关联研究(GWAS)数据,MR分析揭示了若干与胰腺癌风险相关的生物标志物。双样本MR是当前研究中的常用方法,包括逆方差加权法、加权中位数、MR-Egger法等,有助于从遗传角度解释疾病的因果网络。尽管MR策略可以为理解胰腺癌的病因学提供新视角,但其在数据合成、工具变量选择及多效性评估方面仍需谨慎。新兴分析模型如贝叶斯加权MR(BWMR)、CAUSE和多变量MR(MVMR)等,为综合评估多重风险因素及其相互关系带来新的可能。未来,结合上述方法及累积增多的遗传流行病学资料,MR分析预期能够为发现胰腺癌的潜在治疗靶点和制订预防策略提供更为坚实的证据基础。
关键词
胰腺肿瘤
孟德尔随机化分析
因果律
Keywords
Pancreatic Neoplasms
Mendelian Randomization Analysis
Causality
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
基于影像组学及临床特征的机器学习模型鉴别肝细粒棘球蚴病病灶活性的研究
2
作者
汪占金
陈志恒
李富源
蔡俊杰
薛张佗
周瀛
曹云太
王展
机构
青海大学
临床医学院
青海大学
附属
医院
肝胆胰二科
青海大学
附属
医院
影像中心
青海大学附属医院医工结合与转化应用部
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2024年第5期582-593,共12页
基金
国家自然科学基金(82160131)
青海省科技厅青年基金(2021-ZJ-963Q)。
文摘
目的开发影像组学和临床特征的机器学习模型,以精准鉴别肝细粒棘球蚴病(HCE)病灶的生物活性。方法收集2018—2022年就诊于青海大学附属医院肝胆胰外科的521例HCE患者和就诊于果洛州人民医院普外科和玉树州人民医院普外科的236例HCE患者的CT图像及临床资料,提取影像特征并进行筛选。对临床资料采用单因素及多因素Logistic回归分析,筛选构建模型的特征。采用Logistic回归(LR)、支持向量机(SVM)、K-近邻算法(KNN)、随机森林(RandomForest)、极限梯度提升(XGBoost)、轻量级梯度提升机(LightGBM)、极端随机树(ExtraTrees)等7种机器学习算法构建影像组学模型和临床模型,结合影像组学模型和临床模型的预测结果,基于软投票法构建联合模型,采用Delong检验比较影像组学模型、临床模型和临床-影像联合模型的性能,并通过外部验证评估模型性能。结果共430例患者被纳入进行模型开发训练,171例患者作为外部验证,筛选出51个影像特征及5个临床特征用于构建模型。7种机器学习模型中,以XGBoost算法性能表现最佳,其构建的临床模型在训练集和外部验证集上的AUC值均最大,分别为0.977[95%置信区间(95%CI):0.964~0.990]和0.839(95%CI:0.776~0.901);其构建的影像组学模型AUC值均最大,分别为0.998(95%CI:0.997~1.000)和0.874(95%CI:0.822~0.927);其构建的联合模型AUC值均最大,分别为1.000(95%CI:0.999~1.000)和0.931(95%CI:0.894~0.968)。DeLong检验结果表明,联合模型在训练集上的性能优于临床模型(Z=2.154,P<0.05),与影像组学模型差异无统计学意义(Z=0.562,P>0.05);在外部验证集上的性能优于临床模型和影像组学模型(Z=3.338、3.331,P<0.05)。校准曲线和决策分析(DCA)曲线表明,联合模型在训练集和外部验证集的校准性能最佳、净收益最高,在不同数据集上性能稳定,在外部验证中展现了良好的泛化能力和可靠性。结论基于影像组学以及临床数据开发的机器学习模型能够精准鉴别肝细粒棘球蚴病病灶的生物活性,联合模型具更高的诊断精度和临床应用潜力,可为HCE患者的治疗方案提供参考。
关键词
肝细粒棘球蚴病
病灶活性
机器学习模型
影像组学
临床特征
Keywords
Haptic cystic echinococcosis
Lesion activity
Machine learning model
Radiomics
Clinical features
分类号
R532.32 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
孟德尔随机化在胰腺癌研究中的应用现状与展望
杜凯豪
侯立朝
罗兰明慧
东小鸽
蒋威
王展
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于影像组学及临床特征的机器学习模型鉴别肝细粒棘球蚴病病灶活性的研究
汪占金
陈志恒
李富源
蔡俊杰
薛张佗
周瀛
曹云太
王展
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CSCD
北大核心
2024
0
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