广西3个猪种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性及系统进化研究

本研究旨在了解广西石头猪、德保猪和隆林猪的起源、群体遗传结构和亲缘关系。通过PCR扩增和测序技术获得3个群体61个个体的线粒体D-loop序列,采用DNASP 5.0进行多态性分析,MEGA 6.0计算各品种间的遗传距离及构建系统发育树。结果显示,3个猪种mtDNA D-loop区全长1 124~1 325 bp,石头猪和德保猪的中间重复序列变异仅存在A型,隆林猪存在A型和B型;石头猪mtDNA D-loop区8个多态性位点归纳出10种单倍型,德保猪8个多态性位点归纳出5种单倍型,隆林猪11个多态性位点归纳出9种单倍型;3种猪单倍型多样度分别为0.857、0.81和0.917,核算多样度分别为0.002 29、0.002 9和0.002 83。石头猪和德保猪可能有相同的母源血统,隆林猪可能有2种母系起源;3个品种猪单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性匮乏,亟需进行科学保护。

广西3个品种猪的微卫星遗传多样性分析

本研究利用17个微卫星标记分析广西境内德保猪、隆林猪和石头猪3个品种的群体微卫星遗传多样性及亲缘关系。通过计算它们的微卫星遗传多样性参数，分析3个品种猪的遗传结构变异。结果显示：德保猪、隆林猪和石头猪3个品种的61个个体共检测到了199个等位基因，各位点的等位基因数为8—19个；平均多态信息含量为0．7175，期望杂合度分别为0．7152、0．8009、0．7942，表明其皆含有丰富的多态信息及较大范围的遗传变异程度；遗传距离分别为0．4616、0．3226、0．2782，遗传相似度系数分别为0．6303、0．7243、0．7572，表明3种猪之间存在着一定的基因交流，为广西地方猪种质资源的合理利用和保护提供理论依据。