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渗透胁迫诱导转Cu/ZnSOD和APX基因甘薯根系差异蛋白质组学研究
被引量:
4
1
作者
康乐
李红兵
+2 位作者
陈显让
郭尚洙
邓西平
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2013年第10期88-96,共9页
【目的】利用蛋白质组学手段,研究短期渗透胁迫条件下,转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系蛋白质的表达差异。【方法】以水培转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系为材料,用100g/L PEG6000渗透胁迫处理2...
【目的】利用蛋白质组学手段,研究短期渗透胁迫条件下,转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系蛋白质的表达差异。【方法】以水培转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系为材料,用100g/L PEG6000渗透胁迫处理24h,以未胁迫的NT为对照,提取根总蛋白,进行双向电泳分离,考染法凝胶染色,扫描凝胶图像用于软件检测。【结果】在T、NT和对照中分别检测到836,812,881个蛋白点;t测验发现,与对照相比,T和NT有34个蛋白点丰度发生1.5倍以上显著变化(P<0.05,Fold>1.5,Quality>80)。经基质辅助激光解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析,34个差异表达蛋白点中23个得到了有效鉴定。在鉴定的23个蛋白中,有10个蛋白在T和NT中共同上调或下调表达,包括ATP合酶F1β亚基、烯醇酶、26S蛋白酶体调节亚基6、ACC合成酶2等;另外13个蛋白在T和NT中表达各异,包括核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶结合蛋白β亚基和蔗糖合成酶等。【结论】10个在T和NT中共同上调或下调表达的蛋白,是甘薯应答渗透胁迫的普遍应答蛋白,反映了T和NT根系对短期渗透胁迫共同的响应机制;另外13个在T和NT中表达各异的蛋白,表明转基因使甘薯根系蛋白质在短期渗透胁迫下表现出特异的响应机制。
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关键词
转基因甘薯
蛋白质组学
双向电泳
基质辅助激光解吸飞行时间质谱
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职称材料
题名
渗透胁迫诱导转Cu/ZnSOD和APX基因甘薯根系差异蛋白质组学研究
被引量:
4
1
作者
康乐
李红兵
陈显让
郭尚洙
邓西平
机构
西北农林科技大学林
学院
西北农林科技大学资源
环境
学院
中国科
学院
水利部水土保持
研究
所/黄土高原土壤侵蚀与旱地农业国家重点实验室
韩国生命工学院环境生物技术研究中心
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2013年第10期88-96,共9页
基金
国际科技合作项目(2010DFA91930)
文摘
【目的】利用蛋白质组学手段,研究短期渗透胁迫条件下,转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系蛋白质的表达差异。【方法】以水培转Cu/Zn SOD和APX基因甘薯(T)及非转基因甘薯(NT)根系为材料,用100g/L PEG6000渗透胁迫处理24h,以未胁迫的NT为对照,提取根总蛋白,进行双向电泳分离,考染法凝胶染色,扫描凝胶图像用于软件检测。【结果】在T、NT和对照中分别检测到836,812,881个蛋白点;t测验发现,与对照相比,T和NT有34个蛋白点丰度发生1.5倍以上显著变化(P<0.05,Fold>1.5,Quality>80)。经基质辅助激光解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析,34个差异表达蛋白点中23个得到了有效鉴定。在鉴定的23个蛋白中,有10个蛋白在T和NT中共同上调或下调表达,包括ATP合酶F1β亚基、烯醇酶、26S蛋白酶体调节亚基6、ACC合成酶2等;另外13个蛋白在T和NT中表达各异,包括核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶结合蛋白β亚基和蔗糖合成酶等。【结论】10个在T和NT中共同上调或下调表达的蛋白,是甘薯应答渗透胁迫的普遍应答蛋白,反映了T和NT根系对短期渗透胁迫共同的响应机制;另外13个在T和NT中表达各异的蛋白,表明转基因使甘薯根系蛋白质在短期渗透胁迫下表现出特异的响应机制。
关键词
转基因甘薯
蛋白质组学
双向电泳
基质辅助激光解吸飞行时间质谱
Keywords
transgenic sweetpotato
proteomics
two-dimension electrophoresis
MALDI-TOF-MS
分类号
S531.01 [农业科学—作物学]
Q945.78 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
渗透胁迫诱导转Cu/ZnSOD和APX基因甘薯根系差异蛋白质组学研究
康乐
李红兵
陈显让
郭尚洙
邓西平
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2013
4
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