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某基层医院与三甲儿童医院儿童呼吸道感染病原谱比较
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作者 黄宇轩 贾立平 +2 位作者 德日 赵林清 李晓惠 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第7期1200-1203,共4页
目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛... 目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛细电泳联用技术检测13种呼吸道病原,统计学方法分析两家医院急性呼吸道感染儿童病原谱差异。结果 基层医院纳入患儿112例,男女比例为1∶1,呼吸道病原总阳性检出率为71.43%(80/112),单种病原感染72例(64.29%,72/112),混合感染8例(7.14%,8/112,均为2种病原);三甲儿童医院纳入患儿115例,男女比例1.02∶1,呼吸道病原总阳性检出率为70.43%(81/115),单种病原感染66例(57.39%,66/115),混合感染15例(包括2种病原感染12例,10.43%,12/115;3种病原感染3例,2.61%,3/115)。0~3岁婴幼儿中,基层医院与三甲儿童医院HMPV阳性检出率(52.9%,9/17;5.3%,4/75)差异有统计学意义(χ^(2)=38.10,P<0.05);三甲儿童医院儿童RSV阳性检出率(44.0%,33/75)高于基层医院(23.5%,4/17),但差异无统计学意义(χ^(2)=2.415,P>0.05)。4~15岁儿童中,基层医院Flu B阳性检出率为31.58%(30/95),三甲儿童医院为20.0%(8/40),差异有统计学意义(χ^(2)=6.96,P<0.05);三甲儿童医院MP阳性检出率为37.5%(15/40),基层医院未检出,差异有统计学意义(χ^(2)=40.08,P<0.05)。结论 2021-2022年冬春季节北京某基层医院与三甲儿童医院的儿童呼吸道感染病原谱构成存在差异,各年龄段病原谱分布也不同,提示分级诊疗以及基层医院开展核酸检测的必要性。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原谱 分级诊疗 基层医院 三甲儿童医院
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致敬经典:回顾我国儿童中呼吸道合胞病毒感染的早期开拓性研究
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作者 钱渊 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期90-92,共3页
呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)是世界各地婴幼儿下呼吸道感染最重要的病原。我国儿童中RSV感染的研究始于20世纪70年代初。回顾这段历史,可以看到科研紧密结合儿科临床需求,严格按照经典的病毒病原学方法,得到了翔... 呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)是世界各地婴幼儿下呼吸道感染最重要的病原。我国儿童中RSV感染的研究始于20世纪70年代初。回顾这段历史,可以看到科研紧密结合儿科临床需求,严格按照经典的病毒病原学方法,得到了翔实可靠的结果,为我国的RSV研究奠定了基础。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 回顾性研究
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2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒感染特征分析
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作者 贾立平 赵林清 +5 位作者 邓莉 刘立颖 董慧瑾 黄辉 金凤华 钱渊 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期508-513,共6页
目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus,NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-poly... 目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus,NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)筛查NoV;阳性标本进行NoV VP1基因及RdRp基因扩增及序列测定,所测得的序列应用在线分型工具Norovirus Genotyping Tool 2.0进行基因分型。结果本研究共收集2577例急性腹泻儿童粪便标本,NoV核酸检测阳性的484例(18.78%,484/2577);NoV感染全年均可发生,具有明显的季节分布,流行高峰在秋冬季节。NoV的检出无性别差异(χ^(2)=1.77,P=0.183)。其中有399例得到了VP1区分型,结果显示有11个基因型,主要为GII基因群(98.25%,392/399),GII.4 Sydney型为主(52.13%,208/399),其次为GII.3型(19.8%,79/399)、GII.2型(18.5%,74/399)。267例完成了RdRp区分型,结果显示有10个基因型,以GII.P31型为主(57.3%,153/267),其次为GII.P12型(15.36%,41/267)及GII.P16型(14.98%,40/267)。双基因分型结果显示存在16种组合方式,主要为GII.4 Sydney[P31](53.18%,142/267),GII.3[P12]检出率呈下降趋势,而GII.4 Sydney[P16]检出率逐渐增高。结论NoV是北京市2014—2019年儿童急性腹泻的重要病原,流行的基因型别多样。 展开更多
关键词 儿童 诺如病毒 急性腹泻 基因分型
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柯萨奇病毒A10型对利巴韦林耐药性的初步研究
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作者 孙甜甜 宗彦君 +8 位作者 王蕊 李冀琛 刘莹 李晓亮 韩振志 于力恒 刘志军 孙强 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期337-345,共9页
近年来,全国范围内手足口病(Hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CV... 近年来,全国范围内手足口病(Hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CVA10的抑制效果,本研究中,我们随机选取了19条2009-2021年的不同地区和不同年代的有代表性的中国内地优势流行基因型C基因型的CVA10毒株,通过细胞毒性实验(Cell counting kit-8,CCK8)来检测利巴韦林在RD细胞上对CVA10的抑制率。将抑制率大于85%的CVA10定义为对利巴韦林敏感组,抑制率小于15%的CVA10定义为对利巴韦林耐药组。结果显示利巴韦林在0.78mmol/L浓度下可以对CVA10产生较好的抑制作用并且对细胞的毒性较低。19株CVA10中有4株表现出对利巴韦林耐药性,2株表现出对利巴韦林敏感性,剩余13株的敏感性在85%~15%之间。通过7日龄ICR乳鼠感染实验比较对利巴韦林敏感组和耐药组毒株的致病力差异,通过观察乳鼠临床评分、生存率、体重及组织取材的滴度测定结果均表明对利巴韦林敏感组CVA10在小鼠上的致病力比耐药组强。进一步使用MEGA 7.0软件对影响CVA10复制和翻译的2C区氨基酸序列进行差异性分析,以分析可能的耐药位点。结果显示对利巴韦林耐药组和敏感组CVA10的2C区的327位和328位氨基酸位点存在差异。本研究发现当前国内流行的CVA10存在广泛对利巴韦林耐药现象,其中部分CVA10对利巴韦林完全耐药。因此,有必要加强对CVA10耐药株的监测,以便更好地指导临床医生正确地选择抗病毒药物,为个体化的治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A10型 利巴韦林 耐药性 2C区 差异位点
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CDHR3及其基因单核苷酸多态性与C组鼻病毒致哮喘的相关性研究进展
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作者 傅涵浩钰 德日 赵林清 《国际病毒学杂志》 北大核心 2024年第2期170-173,共4页
支气管哮喘是严重的全球性健康问题。婴幼儿期呼吸道病毒感染是诱发儿童哮喘的主要危险因素之一,也是哮喘加重的最常见原因。近年来的研究表明,人鼻病毒(human rhinovirus,HRV),尤其是C组鼻病毒(HRV-C)在病毒诱导的哮喘发作及加重中发... 支气管哮喘是严重的全球性健康问题。婴幼儿期呼吸道病毒感染是诱发儿童哮喘的主要危险因素之一,也是哮喘加重的最常见原因。近年来的研究表明,人鼻病毒(human rhinovirus,HRV),尤其是C组鼻病毒(HRV-C)在病毒诱导的哮喘发作及加重中发挥重要作用。CDHR3基因是儿童早期严重哮喘的易感基因,其单核苷酸多态性位点rs6967330上的A等位基因是儿童早期哮喘加重的易感基因位点。CDHR3基因编码的CDHR3受体是HRV-C目前唯一的已知受体。本文主要就CDHR3及其基因单核苷酸多态性与HRV-C致哮喘之间的相关性研究进展展开综述,以期为儿童哮喘防治提供理论依据。 展开更多
关键词 支气管哮喘 C组鼻病毒 CDHR3基因 单核苷酸多态性
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2023年春季北京地区儿童急性呼吸道感染病原谱分析 被引量:4
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作者 孙宇 朱汝南 +6 位作者 王芳 陈冬梅 郭琪 周禹彤 姚尧 贾立平 赵林清 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期159-164,共6页
目的探讨北京地区儿童急性呼吸道感染(ARI)的病原谱。方法采用横断面研究,收集2023年2月6日(第6周)至5月28日(第21周)首都儿科研究所附属儿童医院因ARI就诊的9284例患儿呼吸道标本。根据标本来源,分为急诊就诊的流感样病例组、门诊ARI... 目的探讨北京地区儿童急性呼吸道感染(ARI)的病原谱。方法采用横断面研究,收集2023年2月6日(第6周)至5月28日(第21周)首都儿科研究所附属儿童医院因ARI就诊的9284例患儿呼吸道标本。根据标本来源,分为急诊就诊的流感样病例组、门诊ARI组及住院ARI组。流感样病例组进行流感病毒(Flu)及人偏肺病毒(HMPV)核酸检测;门诊ARI组进行Flu、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒、副流感病毒(PIV)核酸检测;住院ARI组进行Flu、RSV、HMPV、腺病毒、人博卡病毒(HBoV)、鼻病毒、PIV、冠状病毒、肺炎支原体(Mp)及衣原体核酸检测。结果流感样病例组320例患儿中男192例、女128例,就诊年龄4.7(3.6,6.9)岁,Flu A阳性117例(36.6%),其中甲型流感病毒H1N1亚型(H1N1)55例(47.0%),甲型流感病毒H3N2亚型(H3N2)62例(53.0%),第6~9周以H1N1为主(10.0%~50.0%),第10~16周以H3N2为主(15.0%~90.0%);HMPV阳性13例(4.1%),第15周检出率为5.0%(1/20),第20周达30.0%(6/20)。门诊ARI组7573例患儿中男4131例、女3442例,就诊年龄4.0(2.1,5.3)岁,阳性检出率RSV为32.9%(2491/7573),Flu A为12.1%(915/7573);第6~14周以Flu A为主(23.2%~74.7%),第15周开始以RSV为主,阳性检出率为24.8%(36/145)。住院ARI组1391例患儿中男804例、女587例,就诊年龄3.3(0.4,5.8)岁,阳性检出率鼻病毒为18.7%(260/1391)、RSV为12.4%(173/1391)、Flu A为10.2%(142/1391)[H1N1116例(81.7%)、H3N226例(18.3%)]及HMPV为3.1%(43/1391)。第7周开始检出H1N1[10%(6/60)],第11周达高峰[31.8%(21/66)],第8周开始检出H3N2[1.5%(1/68)]。住院ARI组Flu阳性患儿H1N1阳性检出率为81.7%(116/142)。第12周开始检出RSV,阳性检出率为1.3%(1/80),第19周达30.4%(35/115);第21周HMPV阳性检出率为12.1%(14/116)。结论北京地区2023年春季(2至5月)ARI患儿中首先出现Flu流行,前期以H1N1为主,后期以H3N2为主,RSV出现滞后流行,同时需密切关注HMPV。应加强对门诊监测,提前发出流行预警。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原
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人呼吸道合胞病毒北京地区A亚型ON1基因型地方株感染A549细胞转录组学分析
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作者 王凤杰 江明礼 +4 位作者 郭琪 李晓芸 孙宇 朱汝南 赵林清 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期128-133,共6页
目的应用转录组测序方法,分析北京地区人呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)A亚型优势流行基因型ON1地方株感染A549细胞后差异表达基因,为RSV防治提供潜在靶点。方法选用已经过全基因组测序确定为RSV A亚型ON1基因型的地... 目的应用转录组测序方法,分析北京地区人呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)A亚型优势流行基因型ON1地方株感染A549细胞后差异表达基因,为RSV防治提供潜在靶点。方法选用已经过全基因组测序确定为RSV A亚型ON1基因型的地方株(61397-ON1)感染A549细胞,提取总mRNA,通过转录组测序筛选出与未感染的A549细胞为对照的差异表达基因,对其进行GO分析、KEGG通路分析,同时随机选择6个差异表达倍数大于2倍的基因进行qRT-PCR验证。结果以未感染的A549细胞为对照,筛选出1632个差异表达基因,其中807个基因表达上调,825个基因表达下调。差异基因主要参与细胞因子反应以及MAPK级联反应正向调控等免疫应答相关生物过程,并在MAPK信号通路、NOD样受体信号通路、p53信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路及NF-κB信号通路发生了富集。选择的6个差异表达基因qRT-PCR验证结果与转录组数据趋势一致。结论RSV A亚型ON1基因型毒株感染A549细胞后的差异表达基因主要参与细胞因子应答及免疫相关信号通路,为RSV致病的分子机制及防治策略研究提供基础资料。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 地方株 ON1基因型 转录组学分析 差异表达基因
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正确分析儿童急性呼吸道感染病毒病原检测结果 被引量:6
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作者 孙宇 赵林清 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第24期1856-1860,共5页
急性呼吸道病毒感染给世界各地的儿童造成了巨大的疾病负担,早期、快速、准确的病毒病原诊断对于选择适当的治疗、拯救生命、阻止暴发流行及避免不必要的抗生素使用具有重要意义。面对日益增多且多样化的实验室诊断方法,需要正确分析儿... 急性呼吸道病毒感染给世界各地的儿童造成了巨大的疾病负担,早期、快速、准确的病毒病原诊断对于选择适当的治疗、拯救生命、阻止暴发流行及避免不必要的抗生素使用具有重要意义。面对日益增多且多样化的实验室诊断方法,需要正确分析儿童急性呼吸道感染病毒病原检测结果。现对目前在用或即将应用于临床的诊断方法进行概述,并对临床报告的正确解读加以详细阐述,以便为临床医师更好地分析呼吸道病毒病原结果提供帮助。 展开更多
关键词 病毒病原 急性呼吸道感染 诊断方法 儿童
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呼吸道合胞病毒黏附糖蛋白基因新变异形式的发现及其感染患儿临床特征分析
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作者 江明礼 王凤杰 +7 位作者 韩振志 徐炎鹏 孙宇 朱汝南 陈冬梅 郭琪 周禹彤 赵林清 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期120-127,共8页
目的分析北京地区呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)流行特征,监测黏附糖蛋白(G)基因序列变异及感染患儿临床特征。方法收集2023年1月1日—2023年12月31日首都儿科研究所附属儿童医院急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,对经... 目的分析北京地区呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)流行特征,监测黏附糖蛋白(G)基因序列变异及感染患儿临床特征。方法收集2023年1月1日—2023年12月31日首都儿科研究所附属儿童医院急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,对经呼吸道病原体多重核酸检测确定为RSV阳性的样本,进一步通过PCR方法扩增得到RSV G蛋白基因全长,测序后建立系统发育进化树确定RSV分型及G蛋白序列变异,通过电子病历系统获得临床资料,分析北京地区RSV感染患儿临床特征。结果共收集5489份急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,其中男3046例,女2443例,平均年龄4.36岁。核酸检测确定为RSV阳性的589例(10.7%,589/5489),其中男349例,女240例,平均年龄(2.51±2.78)岁,中位年龄0.48岁。2023年3月开始RSV呈现持续流行趋势,存在两个流行高峰,分别为5月(24.6%,122/496)和12月(18.2%,126/693)。2023年7月前以A亚型为优势亚型,8—10月为两个亚型博弈阶段,11月转变为B亚型。通过序列分析发现一种长度为954 bp的RSV B亚型新序列(RSV-B-BA9-954bp),在进化树中独立成一簇。存在新变异的RSV B亚型感染患儿收入重症监护病房(ICU)的比例(44.1%,15/34)高于未变异的RSV B亚型感染患儿(25.2%,31/123)(χ^(2)=4.600,P=0.032),但白细胞计数和C-反应蛋白低于未变异的RSV B亚型感染患儿(P<0.05)。结论2023年北京地区儿童中RSV自3月份开始持续流行,出现两个流行高峰,优势流行亚型由A转换为B,监测到一种新的RSV B亚型G蛋白基因变异(RSV-B-BA9-954bp)。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 G蛋白 新突变 临床特征
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rViRAL:几种常见呼吸道病毒感染宿主应答的基因表达交互查询系统
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作者 李洋 尤翀 +3 位作者 梁米芳 郭琪 张益 周晓华 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期991-998,共8页
建立操作便捷、用户友好的在线系统可以实现对海量病毒感染宿主应答数据的深度挖掘,促进对病毒与宿主相互作用的深入了解。通过收录整合1483份批量转录组和超30000个细胞的单细胞转录组数据,以R语言为核心,整合多种先进生物信息工具,设... 建立操作便捷、用户友好的在线系统可以实现对海量病毒感染宿主应答数据的深度挖掘,促进对病毒与宿主相互作用的深入了解。通过收录整合1483份批量转录组和超30000个细胞的单细胞转录组数据,以R语言为核心,整合多种先进生物信息工具,设计开发用户友好的在线平台rViRAL(Respiratory Virus Response interActive anaLysis)。在rViRAL上,研究人员通过用户友好的交互界面即可实现对感染后宿主应答的系列分析,包括:差异表达分析、诊断性能评价以及单细胞层面上的分子变化等。此外,rViRAL还提供跨多种常见呼吸道病毒感染类型,对感兴趣的基因进行泛感染比较分析的功能。借助rViRAL,生物学家可以无需任何计算编程技能就可以对感兴趣的基因进行假设探索与验证,这将极大地促进呼吸道病毒感染免疫的数据挖掘、科学讨论和治疗及诊断靶点的发现。 展开更多
关键词 病毒感染宿主应答 转录组 单细胞转录组 在线平台
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儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识 被引量:39
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作者 谢正德 邓继岿 +23 位作者 任丽丽 张燕 陈祥鹏 张海邻 赵林清 徐保平 钟礼立 秦强 卢根 郑跃杰 赵德育 尚云晓 曹玲 陈志敏 殷勇 刘瀚旻 申阿东 应斌武 符州 李昌崇 钱渊 许文波 王健伟 申昆玲 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期321-332,共12页
急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病,严重威胁儿童生命健康。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性,得以快速地在临床推广应用,成为呼吸道感染病原体诊断的主... 急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病,严重威胁儿童生命健康。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性,得以快速地在临床推广应用,成为呼吸道感染病原体诊断的主要方法。为规范儿童呼吸道感染病原体核酸检测的临床应用,提升病原体的诊断水平,特组织相关领域专家,撰写《儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识》,以指导儿童呼吸道感染病原体的核酸检测,整体提升儿童呼吸道感染病原体的诊断能力。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原体 核酸检测 共识
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