结核分枝杆菌PPE家族蛋白CD4^+ T细胞泛宿主表位的计算机预测及其γ干扰素释放实验研究

目的利用计算机预测结核分枝杆菌PPE家族蛋白MHC-II类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位,并利用γ干扰素释放实验进行体外验证。方法利用网上数据库提取PPE家族全部蛋白序列。使用生物信息学软件包括Signal P4.1,Secretome P 2.0,DAS和Net MHCII2.2等分析工具预测、筛选出MHC-II类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位。最后利用γ干扰素释放实验进行合成肽段的体外实验验证其刺激激活CD4+T细胞的能力。结果发现了34个泛宿主表位多肽,其中21个来自于PPE8蛋白,其余来自于PPE12、PPE21和PPE62蛋白。γ干扰素释放实验并未发现预测出的泛宿主表位多肽可刺激大量的CD4+T淋巴细胞产生IFN-γ的分泌,但来自于PPE8蛋白的两个泛宿主表位多肽可刺激少量的CD4+T淋巴细胞产生反应。结论这些计算机预测出来的泛宿主表位多肽,尤其是来自PPE8蛋白的泛宿主表位多肽,可能是下一步亚单位疫苗或诊断性标志物的重要候选抗原。但仍需进一步扩大样本量进行验证。