基于非标记定量技术的继发性肺结核患者血浆蛋白质组学研究

目的研究继发性肺结核患者特异蛋白标志物的血浆蛋白质组学,寻找继发性肺结核特异性蛋白标志物。方法应用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术检测30例继发性肺结核患者(结核组)和30名健康对照者(对照组)血浆蛋白质谱,结核组某蛋白丰度较对照组差异倍数>2(上调)或<0.5(下调)及两组某蛋白丰度经t检验P<0.05的蛋白被认为是差异蛋白。应用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)等分析软件对差异蛋白进行生物信息学分析。两组间蛋白平均丰度的差异分析采用t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果结核组与对照组比较共发现518个差异表达蛋白,其中有256个差异蛋白表达上调,262个差异蛋白表达下调。生物信息学分析发现差异蛋白的分子功能主要集中在结合(29.79%,406/1363)和蛋白质结合(24.80%,338/1363);参与生物学过程主要为参与细胞过程(14.75%,467/3167)和代谢过程(11.11%,352/3167);差异蛋白的细胞定位分析发现,大部分蛋白定位在细胞内(22.07%,389/1763)及细胞(22.01%,388/1763)。KEGG分析发现背腹轴形成通路及黏着斑形成通路等17个上调通路与1个下调通路在结核组与对照组间具有差异性。结论结核组患者的血浆蛋白发生了明显的改变,这为探索继发性肺结核发生发展的机制提供了有价值的线索。

基于非标记定量技术的继发性肺结核患者血浆蛋白质组学研究

目的研究继发性肺结核患者特异蛋白标志物的血浆蛋白质组学,寻找继发性肺结核特异性蛋白标志物。方法应用非标记(label-free)定量蛋白质组学技术检测30例继发性肺结核患者(结核组)和30名健康对照者(对照组)血浆蛋白质谱,结核组某蛋白丰度较对照组差异倍数>2(上调)或<0.5(下调)及两组某蛋白丰度经t检验P<0.05的蛋白被认为是差异蛋白。应用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)等分析软件对差异蛋白进行生物信息学分析。两组间蛋白平均丰度的差异分析采用t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果结核组与对照组比较共发现518个差异表达蛋白,其中有256个差异蛋白表达上调,262个差异蛋白表达下调。生物信息学分析发现差异蛋白的分子功能主要集中在结合(29.79%,406/1363)和蛋白质结合(24.80%,338/1363);参与生物学过程主要为参与细胞过程(14.75%,467/3167)和代谢过程(11.11%,352/3167);差异蛋白的细胞定位分析发现,大部分蛋白定位在细胞内(22.07%,389/1763)及细胞(22.01%,388/1763)。KEGG分析发现背腹轴形成通路及黏着斑形成通路等17个上调通路与1个下调通路在结核组与对照组间具有差异性。结论结核组患者的血浆蛋白发生了明显的改变,这为探索继发性肺结核发生发展的机制提供了有价值的线索。

长链非编码RNA在结核分枝杆菌感染的巨噬细胞中的作用机制及研究进展

结核病是由结核分枝杆菌感染导致的一种传染病,是严重威胁人类健康的传染病之一。尽管结核病的诊断和治疗方法取得了重大进展,但目前仍没有适当的工具用于早期筛查和诊断。长链非编码RNA(longnon-coding RNA,lncRNA)可以通过染色质修饰、转录或转录后处理从而调控基因表达,在免疫反应中起重要作用,结核分枝杆菌感染后lncRNA的差异表达与巨噬细胞炎症、自噬及细胞凋亡等相关。随着研究的深入,lncRNA在调控宿主对结核分枝杆菌的抗菌反应中的作用逐渐被重视,而巨噬细胞作为先天免疫的重要组成部分,参与结核病的发生发展。因此,阐明巨噬细胞中lncRNA与结核分枝杆菌感染之间关联的调控机制,可能为结核病诊断、判断疾病进展及治疗提供新策略。

肺泡灌洗液白介素-6、白介素-36α及S100钙结合蛋白A9水平在继发性肺结核进展加重患者中的表达水平及评估价值

目的分析支气管肺泡灌洗液中白介素-6(IL-6)、白介素-36α(IL-36α)、S100钙结合蛋白A9(S100A9)在继发性肺结核进展加重患者中的表达水平及其临床评估价值。方法选择2020年1月至2022年12月首都医科大学附属北京胸科医院收治的继发性肺结核患者65例,根据病情严重程度分为重症组(34例)与轻症组(31例),收集两组患者外周支气管肺泡灌洗液,应用酶联免疫吸附法检测IL-6、IL-36α、S100A9水平并进行比较。应用ROC曲线下面积评价IL-6、IL-36α、S100A9对继发性肺结核进展加重的评估价值。结果重症组患者支气管肺泡灌洗液IL-6、IL-36α、S100A9水平均高于轻症组,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,IL-6、IL-36α、S100A9评估继发性肺结核进展加重的AUC分别为0.707(95%CI 0.580~0.835)、0.676(95%CI 0.542~0.811)、0.740(95%CI 0.617~0.863)。结论肺泡灌洗液IL-6、IL-36α、S100A9在继发性肺结核进展加重期患者中的表达水平升高,IL-6与S100A9对于临床评估继发性肺结核进展加重具有一定价值。