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日本鳗鲡γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因的克隆鉴定与表达分析
1
作者
陈姗
张芳芳
+1 位作者
黄贝
黄文树
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期484-493,共10页
在日本鳗鲡(Anguilla japonica)中克隆获得2个γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因AjGILT-1和AjGILT-2,并对其序列进行生物信息学分析,进而利用实时荧光定量PCR分别检测2个基因在不同组织器官中的表达水平,及其在脂多糖(LPS)、...
在日本鳗鲡(Anguilla japonica)中克隆获得2个γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因AjGILT-1和AjGILT-2,并对其序列进行生物信息学分析,进而利用实时荧光定量PCR分别检测2个基因在不同组织器官中的表达水平,及其在脂多糖(LPS)、聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激和迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感染后的表达变化.结果显示:2个基因编码的蛋白序列中均含有GILT家族的特征序列CQHGX2ECX2NX4C、活性位点CXXC、2个糖基化位点和11个保守的半胱氨酸残基,基因组序列均含7个外显子和6个内含子.2个基因启动子中都存在多个转录因子结合位点,如γ-干扰素活化位点以及特化蛋白1结合位点;不同的是AjGILT-1启动子区存在多个核因子-1、激活蛋白-1结合位点及干扰素刺激反应元件,而在AjGILT-2启动子区未发现.AjGILT-1在鳃和肠中表达量最高,而AjGILT-2在性腺、头肾和脾脏中表达量最高;除肠道外,同一组织中AjGILT-2的表达量均高于AjGILT-1.LPS、PolyI:C刺激和E.tarda感染后,AjGILT-1与AjGILT-2的表达在鳃中仅有少数变化,而在头肾和中肾中则变化较明显.综上所述,AjGILT-1和AjGILT-2基因可能参与了日本鳗鲡受病毒和细菌感染后的免疫应答.
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关键词
日本鳗鲡
γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶
基因表达
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职称材料
斜带石斑鱼干扰素调节因子8基因的鉴定与表达模式分析
2
作者
贾芹芹
黄贝
+4 位作者
熊静
段利朋
徐继松
聂品
黄文树
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期178-187,共10页
干扰素调节因子8(IRF8)是IRF家族转录因子中的一个成员.利用简并PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技术获得了斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)IRF8基因(EcIRF8)全长cDNA序列,其编码422个氨基酸残基的蛋白质,含有脊椎动物IRF家族的特征性结...
干扰素调节因子8(IRF8)是IRF家族转录因子中的一个成员.利用简并PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技术获得了斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)IRF8基因(EcIRF8)全长cDNA序列,其编码422个氨基酸残基的蛋白质,含有脊椎动物IRF家族的特征性结构域,即N端保守的DNA结合结构域(DBD)和C端多样化的干扰素调控因子结合结构域(IAD),其中DBD中包含5个特征性的色氨酸残基和1个核定位信号.与绝大多数脊椎动物的IRF8基因相似,EcIRF8基因组序列也是9个外显子和8个内含子的结构.EcIRF8在斜带石斑鱼肝脏中高水平表达.活体聚肌胞苷酸刺激后6h,EcIRF8在头肾、中肾、胸腺、肝脏和肠中的表达量显著上调(p<0.05),其中在中肾中上调幅度最大,是对照组的106倍;副溶血弧菌(Vibrio paraheamolyticus)刺激后24h,EcIRF8在肝脏中的表达量也显著上调(p<0.05),但上调倍数仅为对照组的9.37倍.结果表明,EcIRF8基因可能主要参与斜带石斑鱼的抗病毒免疫反应.
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关键词
干扰素调节因子8
斜带石斑鱼
活体聚肌胞苷酸
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职称材料
题名
日本鳗鲡γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因的克隆鉴定与表达分析
1
作者
陈姗
张芳芳
黄贝
黄文树
机构
集美大学
水产学院
鳗鲡
现代
产业
技术
教育部
工程
研究
中心
(
集美大学
)
福建省海洋生物资源开发利用协同创新
中心
出处
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期484-493,共10页
基金
福建省自然科学基金(2016J06008
2018J01452)
文摘
在日本鳗鲡(Anguilla japonica)中克隆获得2个γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因AjGILT-1和AjGILT-2,并对其序列进行生物信息学分析,进而利用实时荧光定量PCR分别检测2个基因在不同组织器官中的表达水平,及其在脂多糖(LPS)、聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激和迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)感染后的表达变化.结果显示:2个基因编码的蛋白序列中均含有GILT家族的特征序列CQHGX2ECX2NX4C、活性位点CXXC、2个糖基化位点和11个保守的半胱氨酸残基,基因组序列均含7个外显子和6个内含子.2个基因启动子中都存在多个转录因子结合位点,如γ-干扰素活化位点以及特化蛋白1结合位点;不同的是AjGILT-1启动子区存在多个核因子-1、激活蛋白-1结合位点及干扰素刺激反应元件,而在AjGILT-2启动子区未发现.AjGILT-1在鳃和肠中表达量最高,而AjGILT-2在性腺、头肾和脾脏中表达量最高;除肠道外,同一组织中AjGILT-2的表达量均高于AjGILT-1.LPS、PolyI:C刺激和E.tarda感染后,AjGILT-1与AjGILT-2的表达在鳃中仅有少数变化,而在头肾和中肾中则变化较明显.综上所述,AjGILT-1和AjGILT-2基因可能参与了日本鳗鲡受病毒和细菌感染后的免疫应答.
关键词
日本鳗鲡
γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶
基因表达
Keywords
Anguilla japonica
interferon-γ-inducible lysosomal thiol reductase
gene expression
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
斜带石斑鱼干扰素调节因子8基因的鉴定与表达模式分析
2
作者
贾芹芹
黄贝
熊静
段利朋
徐继松
聂品
黄文树
机构
集美大学
水产学院
鳗鲡
现代
产业
技术
教育部
工程
研究
中心
(
集美大学
)
福建省海洋生物资源开发利用协同创新
中心
出处
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期178-187,共10页
基金
国家自然科学基金(U205123
31172438
+4 种基金
31402329)
国家高技术研究发展计划(2012AA092201)
福建省自然科学基金(2012J06008
2014J05042)
厦门南方海洋研究中心科技项目(14PYY050SF03)
文摘
干扰素调节因子8(IRF8)是IRF家族转录因子中的一个成员.利用简并PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技术获得了斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)IRF8基因(EcIRF8)全长cDNA序列,其编码422个氨基酸残基的蛋白质,含有脊椎动物IRF家族的特征性结构域,即N端保守的DNA结合结构域(DBD)和C端多样化的干扰素调控因子结合结构域(IAD),其中DBD中包含5个特征性的色氨酸残基和1个核定位信号.与绝大多数脊椎动物的IRF8基因相似,EcIRF8基因组序列也是9个外显子和8个内含子的结构.EcIRF8在斜带石斑鱼肝脏中高水平表达.活体聚肌胞苷酸刺激后6h,EcIRF8在头肾、中肾、胸腺、肝脏和肠中的表达量显著上调(p<0.05),其中在中肾中上调幅度最大,是对照组的106倍;副溶血弧菌(Vibrio paraheamolyticus)刺激后24h,EcIRF8在肝脏中的表达量也显著上调(p<0.05),但上调倍数仅为对照组的9.37倍.结果表明,EcIRF8基因可能主要参与斜带石斑鱼的抗病毒免疫反应.
关键词
干扰素调节因子8
斜带石斑鱼
活体聚肌胞苷酸
Keywords
interferon regulatory factor 8
Epinephelus coioides
Poly I: C
分类号
Q17 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
日本鳗鲡γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)基因的克隆鉴定与表达分析
陈姗
张芳芳
黄贝
黄文树
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
下载PDF
职称材料
2
斜带石斑鱼干扰素调节因子8基因的鉴定与表达模式分析
贾芹芹
黄贝
熊静
段利朋
徐继松
聂品
黄文树
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
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