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基于网络药理学探讨复方积雪草抗肾纤维化的分子机制
被引量:
3
1
作者
万凤
唐玥雯
+1 位作者
邵雯晨
杨汝春
《浙江中西医结合杂志》
2021年第8期712-720,共9页
目的通过网络药理学方法研究复方积雪草主要活性成分治疗肾纤维化的作用机制。方法在TCMSP数据库中筛选与复方积雪草主要组分相关的活性成分和靶点,利用GeneCards数据库检索与肾纤维化相关靶点并与活性成分靶点取交集。采用Cytoscape软...
目的通过网络药理学方法研究复方积雪草主要活性成分治疗肾纤维化的作用机制。方法在TCMSP数据库中筛选与复方积雪草主要组分相关的活性成分和靶点,利用GeneCards数据库检索与肾纤维化相关靶点并与活性成分靶点取交集。采用Cytoscape软件构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络、化合物-靶点网络图、中药-化合物-靶点网络图,筛选核心靶点,分子对接验证化合物与靶点的结合能力;将获得的核心靶点利用STRING进行基因通路的富集分析,进而分析网络和作用机制。结果得到复方积雪草活性成分靶点203个,获得肾纤维化靶点5219个,共同靶点177个。筛选出核心靶点36个。分子对接验证结果化合物与靶点具有较好的结合能力。GO富集分析分别获得可靠性排名TOP10的主要分子功能(MF)、主要细胞组分(CC)和主要生物学过程(BP)。得到核心靶点之间的PPI网络图、化合物-核心靶点网络图和草药-化合物-核心靶点网络图。肿瘤相关通路显著性最高。结论初步系统分析了复方积雪草治疗肾纤维化的科学性及分子机制。
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关键词
网络药理学
复方积雪草
肾纤维化
分子机制
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学探讨复方积雪草抗肾纤维化的分子机制
被引量:
3
1
作者
万凤
唐玥雯
邵雯晨
杨汝春
机构
杭州市中医院肾病实验室
麦吉尔大学生命科学学院
出处
《浙江中西医结合杂志》
2021年第8期712-720,共9页
文摘
目的通过网络药理学方法研究复方积雪草主要活性成分治疗肾纤维化的作用机制。方法在TCMSP数据库中筛选与复方积雪草主要组分相关的活性成分和靶点,利用GeneCards数据库检索与肾纤维化相关靶点并与活性成分靶点取交集。采用Cytoscape软件构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络、化合物-靶点网络图、中药-化合物-靶点网络图,筛选核心靶点,分子对接验证化合物与靶点的结合能力;将获得的核心靶点利用STRING进行基因通路的富集分析,进而分析网络和作用机制。结果得到复方积雪草活性成分靶点203个,获得肾纤维化靶点5219个,共同靶点177个。筛选出核心靶点36个。分子对接验证结果化合物与靶点具有较好的结合能力。GO富集分析分别获得可靠性排名TOP10的主要分子功能(MF)、主要细胞组分(CC)和主要生物学过程(BP)。得到核心靶点之间的PPI网络图、化合物-核心靶点网络图和草药-化合物-核心靶点网络图。肿瘤相关通路显著性最高。结论初步系统分析了复方积雪草治疗肾纤维化的科学性及分子机制。
关键词
网络药理学
复方积雪草
肾纤维化
分子机制
Keywords
Network pharmacology
Centellaasiatica Compound
Renal fibrosis
Molecular mechanism
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学探讨复方积雪草抗肾纤维化的分子机制
万凤
唐玥雯
邵雯晨
杨汝春
《浙江中西医结合杂志》
2021
3
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