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DRSP:蛋白质单残基替换结构数据库(英文)
1
作者
刘继龙
苗智超
+2 位作者
李雷
肖智雄
曹洋
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期810-816,共7页
蛋白质残基替换是基因突变的产物之一,它可能改变蛋白质三维结构,对其生物学功能产生重大影响,因此研究蛋白质残基替换与结构改变的关系具有重要意义.随着实验解析蛋白质结构的数量迅猛增长,越来越多的野生型-突变体被应用于结构生物学...
蛋白质残基替换是基因突变的产物之一,它可能改变蛋白质三维结构,对其生物学功能产生重大影响,因此研究蛋白质残基替换与结构改变的关系具有重要意义.随着实验解析蛋白质结构的数量迅猛增长,越来越多的野生型-突变体被应用于结构生物学的比较研究中.本研究从蛋白质三维结构数据库(PDB)出发,收集和计算了大量结构特征数据,构建了一个目前已知最大的野生型-突变体(单残基差异)的结构对数据库DRSP,展示出氨基酸类型和主链偏好性对结构保守性的相关性.DRSP的开放使用可为高精度的蛋白质结构分析预测提供有用信息,它的数据库网址是http://www.labshare.cn/drsp/index.php.
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关键词
数据库
蛋白质残基替换
主链柔性
蛋白质结构预测
蛋白质设计
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职称材料
题名
DRSP:蛋白质单残基替换结构数据库(英文)
1
作者
刘继龙
苗智超
李雷
肖智雄
曹洋
机构
四川大学生命科学学院
architecture and reactivity of the rna
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期810-816,共7页
基金
supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(31401130)
National Laboratory of Biomacromolecules(2014kf 04)~~
文摘
蛋白质残基替换是基因突变的产物之一,它可能改变蛋白质三维结构,对其生物学功能产生重大影响,因此研究蛋白质残基替换与结构改变的关系具有重要意义.随着实验解析蛋白质结构的数量迅猛增长,越来越多的野生型-突变体被应用于结构生物学的比较研究中.本研究从蛋白质三维结构数据库(PDB)出发,收集和计算了大量结构特征数据,构建了一个目前已知最大的野生型-突变体(单残基差异)的结构对数据库DRSP,展示出氨基酸类型和主链偏好性对结构保守性的相关性.DRSP的开放使用可为高精度的蛋白质结构分析预测提供有用信息,它的数据库网址是http://www.labshare.cn/drsp/index.php.
关键词
数据库
蛋白质残基替换
主链柔性
蛋白质结构预测
蛋白质设计
Keywords
database
protein residue substitution
backbone flexibility
protein structure prediction
protein design
分类号
Q811 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DRSP:蛋白质单残基替换结构数据库(英文)
刘继龙
苗智超
李雷
肖智雄
曹洋
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
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