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甘蓝型油菜种子和角果皮中硫苷含量的动态变化及转录组关联分析 被引量:3
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作者 田志涛 赵永国 +6 位作者 Lenka Havlickova He Zhesi Andrea L Harper Ian Bancroft 邹锡玲 张学昆 陆光远 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期635-651,共17页
【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的... 【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的硫苷含量。提取油菜幼嫩叶片m RNA并进行m RNA-Seq测序,开发了355 536个单核苷酸多态性标记(SNP)和116 098个基因表达量标记(GEM)。将开发的SNPs和GEMs分别导入到混合线性模型(MLM)和回归分析模型中进行关联分析,获得与油菜硫苷表型变异显著相关的遗传位点,进一步通过序列比对和功能预测筛选确定候选基因。【结果】授粉后15 d(15 DAP),油菜种子和角果皮的硫苷含量变异范围分别是1.69—20.45和1.47—25.23μmol·g^(-1)。25 DAP种子、25 DAP角果皮以及成熟种子的硫苷变异范围分别是2.17—147.21、0.73—130.77和8.87—111.83μmol·g^(-1)。后两个时期(即25 DAP和成熟期)的硫苷含量表现出较大变异,适合进行转录组关联分析。基于m RNA-Seq测序数据,经质量控制后获得256 397个高质量的SNP标记(MAF>0.01)和53 889个GEM标记(平均基因表达量>0.4)。利用SNP标记对成熟种子、25 DAP种子和25 DAP角果皮硫苷含量进行关联分析,分别检测到167、158和3个显著关联位点(-log10P>6.71)。其中,与成熟种子显著关联的SNP标记形成5个明显的关联峰,分别位于A2、A9、C2、C7和C9染色体上。同时,利用GEM标记进行的关联分析中,分别检测到127、16和24个与成熟种子、25 DAP种子、25 DAP角果皮硫苷含量显著关联的位点(-log10P>6.03),这些位点主要分布在A2、A8、A9、C2和C9染色体上并形成明显的关联峰。其中,成熟种子和25 DAP角果皮在A9、C2和C9染色体上形成共同的关联峰。通过与公共数据库的基因组序列比对和功能注释,共筛选到295个功能基因,其中25个基因涉及硫苷代谢网路途径,直接参与硫苷的调控。其余基因虽然没有直接参与硫苷代谢过程,但是它们大多属于转录因子基因、刺激响应因子基因,涉及细胞过程或是具有催化活性,因而推测在硫苷积累中同样起到重要作用。【结论】油菜角果皮中的硫苷含量较高,而且与种子硫苷含量显著正相关,是硫苷合成或转运的重要器官。共检测到328个SNP显著标记和144个GEM显著标记,筛选到25个与硫苷合成或者转运有关的功能基因以及73个功能未知的新基因。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 硫代葡萄糖苷 动态变化 转录组关联分析 单核苷酸多态性标记 基因表达量标记
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图像泛滥的时代里,绘画何以可能——读方向“人间山水”展览有感
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作者 徐涟 《美术》 CSSCI 北大核心 2023年第10期46-49,2,共5页
方向作品中的“人间烟火”味儿,是方向探索城市山水的新方向。从传统山水、田园转向现代都市,既是艺术家跟随生活进程而在题材上的自然选择,也是应对绘画当代性的一个重要策略。方向以一种相对冷静、客观的心情体味都市的一切,不再停留... 方向作品中的“人间烟火”味儿,是方向探索城市山水的新方向。从传统山水、田园转向现代都市,既是艺术家跟随生活进程而在题材上的自然选择,也是应对绘画当代性的一个重要策略。方向以一种相对冷静、客观的心情体味都市的一切,不再停留于城市灰暗、冰冷、疏离以及巨大的压迫感,他表达的是自己这一代人对于现代城市的情感与认同。充溢画面的沉静、镇定、从容,描摹出都市生活中的“人间烟火”,寻找在城市山水中安住的精神归宿,呈现出当代人尤其是当代中国人追求“此心安处是吾乡”的精神境界,也让他的都市题材创作有了自己全新的面貌,开拓出一个崭新的方向,并由此呈现出鲜明的当代性。在图像化数字化时代,他的艺术以心手相应的方式,探寻生命的终极意义,朝向艺术的未来方向。 展开更多
关键词 方向 城市山水 图像时代 当代性
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Arabinan Metabolism during Seed Development and Germination in Arabidopsis 被引量:2
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作者 Leonardo D. Gomez Clare G. Steele-King Louise Jones Jonathan M. Foster Supachai Vuttipongchaikij Simon J. McQueen-Mason 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2009年第5期966-976,共11页
Arabinans are found in the pectic network of many cell walls, where, along with galactan, they are present as side chains of Rhamnogalacturonan I. Whilst arabinans have been reported to be abundant polymers in the cel... Arabinans are found in the pectic network of many cell walls, where, along with galactan, they are present as side chains of Rhamnogalacturonan I. Whilst arabinans have been reported to be abundant polymers in the cell walls of seeds from a range of plant species, their proposed role as a storage reserve has not been thoroughly investigated. In the cell walls of Arabidopsis seeds, arabinose accounts for approximately 40% of the monosaccharide composition of non- cellulosic polysaccharides of embryos. Arabinose levels decline to -15% during seedling establishment, indicating that cell wall arabinans may be mobilized during germination. Immunolocalization of arabinan in embryos, seeds, and seedlings reveals that arabinans accumulate in developing and mature embryos, but disappear during germination and seedling establishment. Experiments using 14C-arabinose show that it is readily incorporated and metabolized in growing seedlings, indicating an active catabolic pathway for this sugar. We found that depleting arabinans in seeds using a fungal arabinanase causes delayed seedling growth, lending support to the hypothesis that these polymers may help fuel early seedling growth. 展开更多
关键词 Cell walls development embryogenesis and seed development ARABIDOPSIS arabinan arabinose carbohydrate metabolism physiology of plant growth.
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