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西洋参中U6启动子的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
陈景鲜
卢超
+5 位作者
王国霞
李春阁
李玉华
苏芳谊
汪琛颖
张耀广
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2931-2939,共9页
U6启动子是CRISPR/Cas9基因编辑系统中驱动sgRNA转录的重要元件,该文从西洋参gDNA中克隆得到7条PqU6启动子序列,研究了这7个PqU6启动子的转录激活情况。以培养5周的西洋参不定根为出发材料,克隆7条长度为1300 bp左右的PqU6启动子序列。...
U6启动子是CRISPR/Cas9基因编辑系统中驱动sgRNA转录的重要元件,该文从西洋参gDNA中克隆得到7条PqU6启动子序列,研究了这7个PqU6启动子的转录激活情况。以培养5周的西洋参不定根为出发材料,克隆7条长度为1300 bp左右的PqU6启动子序列。利用生物信息学工具对PqU6启动子序列特点进行分析,并构建PqU6-P驱动GUS基因的融合表达载体,通过根瘤农杆菌介导法分转化烟草叶片进行活性检测。然后对这7条PqU6启动子分别从5′端截短处理到283、287、279、289、295、289、283 bp,以GUS为报告基因构建启动子活性检测载体并转化西洋参愈伤组织和烟草叶片。结果表明,从西洋参gDNA中克隆得到的7条PqU6启动子序列(PqU6-1P~PqU6-7P),核酸序列长度为1246~1308 bp。序列对比结果显示7条PqU6启动子序列和拟南芥AtU6-P启动子一样具有影响U6启动子转录活性的必要元件USE和TATA框。GUS染色和酶活鉴定结果显示7条PqU6启动子都具有转录活性,其中长度为1269 bp的PqU6-7P转录活性最高,是阳性对照P-35S的1.31倍。将7条PqU6启动子从5′端截短处理后(PqU6-1PA~PqU6-7PA),它们在烟草叶片和西洋参愈伤组织中的转录活性并不一致。当受体材料是西洋参愈伤组织时,长度为283 bp的PqU6-7PA启动子转录活性是AtU6-P启动子(长度为292 bp)转录活性的1.59倍。上述试验结果将为西洋参及人参属等药用植物的CRISPR/Cas9基因编辑技术提供更多理想的内源U6启动子。
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关键词
西洋参
U6启动子
烟草
愈伤组织
基因编辑
原文传递
西洋参中8个bHLH类转录因子的克隆及表达分析
被引量:
4
2
作者
陈景鲜
卢超
+4 位作者
郑钧屏
杨玉珍
张丽萌
李玉华
田云芳
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第14期3756-3764,共9页
从西洋参cDNA中克隆得到8个bHLH类转录因子,研究了这8个bHLH类转录因子响应茉莉酸甲酯信号的表达情况。该研究以培养3周的西洋参幼苗为材料,克隆得到了8个bHLH类转录因子。采用高效液相色谱和分光光度法测定了MeJA处理不同时间西洋参不...
从西洋参cDNA中克隆得到8个bHLH类转录因子,研究了这8个bHLH类转录因子响应茉莉酸甲酯信号的表达情况。该研究以培养3周的西洋参幼苗为材料,克隆得到了8个bHLH类转录因子。采用高效液相色谱和分光光度法测定了MeJA处理不同时间西洋参不定根中人参皂苷Rg、Re、Rb和总皂苷的含量。利用实时荧光定量PCR检测MeJA处理后8个转录因子的基因表达量。结果表明从西洋参cDNA中克隆得到的8条bHLH类转录因子序列(Pq-bHLH21~Pq-bHLH28)核酸序列长度为762~2 013 bp。8个转录因子的氨基酸序列一致性为24.90%,每个氨基酸序列都显示出了基本的bHLH保守结构域特征,属于bHLH超基因家族成员。Pq-bHLH22和Pq-bHLH24~Pq-bHLH27共5条氨基酸序列中含有bHLH-MYC N结构域,属于bHLH基因家族中的MYC类转录因子。MeJA处理48 h内,8个转录因子都存在应答响应。在MeJA处理72 h时,Pq-bHLH24的基因表达量达到了处理组最高的106.53倍。在相关性分析方面,Pq-bHLH25、Pq-bHLH27、Pq-bHLH28表现出较强的协同趋势,Pq-bHLH21可能参与调控人参皂苷Rb生物合成途径,而3个转录因子Pq-bHLH22、Pq-bHLH25、Pq-bHLH28与人参皂苷Re生物合成途径呈显著正相关。上述工作为进一步研究bHLH类转录因子对于人参皂苷生物合成调控的功能验证奠定基础。
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关键词
西洋参
BHLH
转录因子
人参皂苷
表达分析
原文传递
题名
西洋参中U6启动子的克隆及表达分析
被引量:
1
1
作者
陈景鲜
卢超
王国霞
李春阁
李玉华
苏芳谊
汪琛颖
张耀广
机构
郑州师范学院生命科学学院
central mindanao university college of arts and sciences
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2931-2939,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32000235)
河南省重点高校科研项目(23A360027,22B360019)
+1 种基金
郑州师范学院博士科研基金项目(501413)
郑州师范学院大学生科研创新基金项目(2021012)。
文摘
U6启动子是CRISPR/Cas9基因编辑系统中驱动sgRNA转录的重要元件,该文从西洋参gDNA中克隆得到7条PqU6启动子序列,研究了这7个PqU6启动子的转录激活情况。以培养5周的西洋参不定根为出发材料,克隆7条长度为1300 bp左右的PqU6启动子序列。利用生物信息学工具对PqU6启动子序列特点进行分析,并构建PqU6-P驱动GUS基因的融合表达载体,通过根瘤农杆菌介导法分转化烟草叶片进行活性检测。然后对这7条PqU6启动子分别从5′端截短处理到283、287、279、289、295、289、283 bp,以GUS为报告基因构建启动子活性检测载体并转化西洋参愈伤组织和烟草叶片。结果表明,从西洋参gDNA中克隆得到的7条PqU6启动子序列(PqU6-1P~PqU6-7P),核酸序列长度为1246~1308 bp。序列对比结果显示7条PqU6启动子序列和拟南芥AtU6-P启动子一样具有影响U6启动子转录活性的必要元件USE和TATA框。GUS染色和酶活鉴定结果显示7条PqU6启动子都具有转录活性,其中长度为1269 bp的PqU6-7P转录活性最高,是阳性对照P-35S的1.31倍。将7条PqU6启动子从5′端截短处理后(PqU6-1PA~PqU6-7PA),它们在烟草叶片和西洋参愈伤组织中的转录活性并不一致。当受体材料是西洋参愈伤组织时,长度为283 bp的PqU6-7PA启动子转录活性是AtU6-P启动子(长度为292 bp)转录活性的1.59倍。上述试验结果将为西洋参及人参属等药用植物的CRISPR/Cas9基因编辑技术提供更多理想的内源U6启动子。
关键词
西洋参
U6启动子
烟草
愈伤组织
基因编辑
Keywords
Panax quinquefolius
U6 promoter
tobacco
callus
gene editing
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
西洋参中8个bHLH类转录因子的克隆及表达分析
被引量:
4
2
作者
陈景鲜
卢超
郑钧屏
杨玉珍
张丽萌
李玉华
田云芳
机构
郑州师范学院生命科学学院
central mindanao university college of arts and sciences
郑州师范学院分子生物学实验室
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第14期3756-3764,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32000235)
郑州师范学院博士科研基金项目(501413)
郑州师范学院大学生科研创新基金项目(2021012)。
文摘
从西洋参cDNA中克隆得到8个bHLH类转录因子,研究了这8个bHLH类转录因子响应茉莉酸甲酯信号的表达情况。该研究以培养3周的西洋参幼苗为材料,克隆得到了8个bHLH类转录因子。采用高效液相色谱和分光光度法测定了MeJA处理不同时间西洋参不定根中人参皂苷Rg、Re、Rb和总皂苷的含量。利用实时荧光定量PCR检测MeJA处理后8个转录因子的基因表达量。结果表明从西洋参cDNA中克隆得到的8条bHLH类转录因子序列(Pq-bHLH21~Pq-bHLH28)核酸序列长度为762~2 013 bp。8个转录因子的氨基酸序列一致性为24.90%,每个氨基酸序列都显示出了基本的bHLH保守结构域特征,属于bHLH超基因家族成员。Pq-bHLH22和Pq-bHLH24~Pq-bHLH27共5条氨基酸序列中含有bHLH-MYC N结构域,属于bHLH基因家族中的MYC类转录因子。MeJA处理48 h内,8个转录因子都存在应答响应。在MeJA处理72 h时,Pq-bHLH24的基因表达量达到了处理组最高的106.53倍。在相关性分析方面,Pq-bHLH25、Pq-bHLH27、Pq-bHLH28表现出较强的协同趋势,Pq-bHLH21可能参与调控人参皂苷Rb生物合成途径,而3个转录因子Pq-bHLH22、Pq-bHLH25、Pq-bHLH28与人参皂苷Re生物合成途径呈显著正相关。上述工作为进一步研究bHLH类转录因子对于人参皂苷生物合成调控的功能验证奠定基础。
关键词
西洋参
BHLH
转录因子
人参皂苷
表达分析
Keywords
Panax quinquefolius
bHLH
transcription factor
ginsenoside
expression analysis
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西洋参中U6启动子的克隆及表达分析
陈景鲜
卢超
王国霞
李春阁
李玉华
苏芳谊
汪琛颖
张耀广
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
2
西洋参中8个bHLH类转录因子的克隆及表达分析
陈景鲜
卢超
郑钧屏
杨玉珍
张丽萌
李玉华
田云芳
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
原文传递
已选择
0
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导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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