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Diet and epigenetics in colon cancer 被引量:8
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作者 Minna Nystrm Marja Mutanen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第3期257-263,共7页
Over the past few years, evidence has accumulated indicating that apart from genetic alterations, epigenetic alterations, through e.g. aberrant promoter methylation, play a major role in the initiation and progression... Over the past few years, evidence has accumulated indicating that apart from genetic alterations, epigenetic alterations, through e.g. aberrant promoter methylation, play a major role in the initiation and progression of colorectal cancer (CRC). Even in the hereditary colon cancer syndromes, in which the susceptibility is inherited dominantly, cancer develops only as the result of the progressive accumulation of genetic and epigenetic alterations. Diet can both prevent and induce colon carcinogenesis, for instance, through epigenetic changes, which regulate the homeostasis of the intestinal mucosa. Food-derived compounds are constantly present in the intestine and may shift cellular balance toward harmful outcomes, such as increased susceptibility to mutations. There is strong evidence that a major component of cancer risk may involve epigenetic changes in normal cells that increase the probability of cancer after genetic mutation. The recognition of epigenetic changes as a driving force in colorectal neoplasia would open new areas of research in disease epidemiology, risk assessment, and treatment, especially in mutation carriers who already have an inherited predisposition to cancer. 展开更多
关键词 结肠癌 食物 DNA 实验胚胎学 营养学
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Strain Mesorhizobium sp.CCNWGX035:A Stress-Tolerant Isolate from Glycyrrhiza glabra Displaying a Wide Host Range of Nodulation
2
作者 WEI Ge-Hong YANG Xue-Ying +2 位作者 ZHANG Zhi-Xin YANG Ya-Zhen K. LINDSROM 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2008年第1期102-112,共11页
39 rhizobial 孤立从 Glycyrrhiza uralensis 和 Glycyrrhiza glabra 的根瘤被孤立,在西北的中国的干旱、半干旱的区域成长,测试他们的分类位置和压力忍耐并且为进一步的研究选择一有希望的通常认为的种体紧张。根据 113 生理、生物... 39 rhizobial 孤立从 Glycyrrhiza uralensis 和 Glycyrrhiza glabra 的根瘤被孤立,在西北的中国的干旱、半干旱的区域成长,测试他们的分类位置和压力忍耐并且为进一步的研究选择一有希望的通常认为的种体紧张。根据 113 生理、生物化学的特征, isolates 被聚类进三个组。一个孤立 CCNWGX035 被发现有高忍耐到 NaCl, pH,和温度。由定序 16S rDNA,孤立 CCNWGX035 被放在类 Mesorhizobium。生节测试证明 isolate 它的原来的寄植物 Glycyrrhiza glabra 上,而且在 Sophora viciifolia,莲花 corniculatus, Trifolium 钢笔, Melilotus suaveolens,和 Sophora alopecuroides 上的不仅形成的修理氮的小瘤。根据点头的顺序分析基因,孤立 CCNWGX035 仔细与类 Mesorhizobium 的紧张有关,展出根瘤菌的一些新奇特征。 展开更多
关键词 宿主范围 甘草 结核作用 土壤学
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省葛藤属根瘤菌的遗传多样性研究 被引量:17
3
作者 陈强 陈文新 +2 位作者 张小平 李登煜 K.Lindstrom 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1641-1646,共6页
用AFLP、REP-PCR、23SrDNAPCR-RFLP等方法对分离自四川的23株葛藤属的根瘤菌的遗传特性进行了研究。结果表明,供试的葛藤根瘤菌遗传特性存在明显差异。AFLP分析结果显示,23个菌株分为7个AFLP遗传群;在BOXAIR-PCR分析中,23株根瘤菌则被分... 用AFLP、REP-PCR、23SrDNAPCR-RFLP等方法对分离自四川的23株葛藤属的根瘤菌的遗传特性进行了研究。结果表明,供试的葛藤根瘤菌遗传特性存在明显差异。AFLP分析结果显示,23个菌株分为7个AFLP遗传群;在BOXAIR-PCR分析中,23株根瘤菌则被分为5个遗传群;对23SrDNAPCR-RFLP分析表明,葛藤根瘤菌分属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)2个属,聚类分析结果将其划分为5个遗传群。分离自四川省的葛藤根瘤菌存在较大的遗传多样性。 展开更多
关键词 四川 葛藤 根瘤菌 遗传多样性 系统发育 共生固氮 生物固氮 AFLP REP-PCR PCR-RFLP
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金沙江干热河谷区胡枝子(Lespedeza Michx)根瘤菌多样性及其系统发育 被引量:9
4
作者 彭贤超 张小平 +2 位作者 徐开未 黄昌学 K.Lindstrom 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期5469-5481,共13页
研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值... 研究利用数值分类、BOXAIR-PCR指纹图谱、16SrDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60℃)和低pH(4.0),在低温(10℃)或者高pH(9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16S rDNA遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。BOXAIR-PCR的分群结果分散,很多在16S rDNA PCR-RFLP中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于Rhizobium、Sinorhizobium、Mesorhizobium、Bradyrhizobium4个属,16S rDNA序列与GSⅡ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16S rDNA序列的同源性比GSⅡ高,6株代表菌株间16S rDNA序列的同源性在87.5%~99.5%之间,GSⅡ序列的同源性在79.4%~89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16S rDNA序列的同源性为99.9%~100%,GSⅡ的同源性为88.9%~99.6%。 展开更多
关键词 数值分类 BOXAIR-PCR 16S RDNA PCR-RFLP GSⅡ基因 序列分析
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“根瘤菌+Mo”菌剂和AM菌剂对花生生长和产量的影响 被引量:12
5
作者 徐开未 张小平 +1 位作者 陈远学 Kristina Lindstrm 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期228-232,共5页
针对四川花生主产区酸性紫色土缺氮、磷、钼的现状,并依据"高效花生根瘤菌+Mo"显著的增产效果和丛枝菌根(AM)真菌高效吸磷特性,分别将R(高效花生根瘤菌)+Mo、AM菌剂(Glomus mosseae)、AM+R+Mo对盆栽花生进行处理。试验结果如... 针对四川花生主产区酸性紫色土缺氮、磷、钼的现状,并依据"高效花生根瘤菌+Mo"显著的增产效果和丛枝菌根(AM)真菌高效吸磷特性,分别将R(高效花生根瘤菌)+Mo、AM菌剂(Glomus mosseae)、AM+R+Mo对盆栽花生进行处理。试验结果如下:(1)单接种G.mosseae能显著提高土著根瘤菌的结瘤能力,极显著提高盛花期植株含磷量。植株盛花期干重、叶绿素、总氮、总钾量高于单接种花生根瘤菌Spr 4-5(R)和CK,且与CK达到显著或极显著水平。单接种根瘤菌Spr 4-5比单接种G.mosseae增产10.1%,差异不显著;分别比CK增产52.5%、38.5%,差异均达极显著水平。Spr 4-5和G.mosseae均是高效菌株。(2)Spr 4-5和G.mosseae双接种比单接种Spr4-5或G.mosseae分别增产3.8%、14.3%,差异不显著;比CK增产58.3%,达极显著水平。(3)"AM+Spr 4-5+钼酸铵"菌剂处理比等钼量的"Spr 4-5+钼酸铵"菌剂的产量低,且达到极显著水平;G.mosseae对钼敏感;与供试根瘤菌正协同效果最佳的钼酸铵浓度为2‰。 展开更多
关键词 花生根瘤菌 丛枝菌根真菌 菌剂 酸性紫色土 生长 产量
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金沙江干热河谷区田菁根瘤菌多样性与系统发育 被引量:4
6
作者 黄昌学 张小平 +1 位作者 彭贤超 K. Lindstrom 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期725-732,共8页
【目的】揭示金沙江干热河谷区这一特殊地理环境下田菁根瘤菌的多样性和系统发育地位。【方法】采用了数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析方法。【结果】数值分类结果表明:在93%的水平上,待测菌株分布于6个群,其中4... 【目的】揭示金沙江干热河谷区这一特殊地理环境下田菁根瘤菌的多样性和系统发育地位。【方法】采用了数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析方法。【结果】数值分类结果表明:在93%的水平上,待测菌株分布于6个群,其中4个群分别与R.tropici、R.etli、S.saheli、A.rubi的参比菌株聚在一起,两个群没有参比菌株与之聚群。16S rDNAPCR-RFLP结果与数值分类基本一致,只有两个独立群有所差异。16S rDNA序列分析表明:两独立群中心菌株SCAU176和SCAU144与R.huautlense聚在一起,与该种同源性分别为100%和98.9%。GSⅡ序列分析中SCAU176和SCAU144单独聚在一起,与最近的参比菌株R.tropici的同源性系数在90%以下。【结论】金沙江干热河谷区田菁根瘤菌具有较为丰富的多样性,在系统发育地位上分布于Sinorhizobium、Agrobacterium和Rhizobium三个属。 展开更多
关键词 田菁 根瘤菌 多样性 系统发育 数值分类 16S RDNA GSⅡ 序列分析
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GUS基因标记法对慢生花生根瘤菌竞争结瘤和接种效果的研究 被引量:4
7
作者 徐开未 张小平 +4 位作者 陈远学 李登煜 陈强 Kristina Lindstrm 雍严莲 《中国土壤与肥料》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期51-53,共3页
应用GUS基因标记技术,可简便、快速、准确、原位、直观地确定标记花生根瘤菌株形成的根瘤,从而方便地研究标记菌株与土著根瘤菌的竞争结瘤能力。无氮水培试验表明,标记菌株gusA4-5、gusA2-9分别与土著菌混和接种占瘤率为71.4%、77.0%。... 应用GUS基因标记技术,可简便、快速、准确、原位、直观地确定标记花生根瘤菌株形成的根瘤,从而方便地研究标记菌株与土著根瘤菌的竞争结瘤能力。无氮水培试验表明,标记菌株gusA4-5、gusA2-9分别与土著菌混和接种占瘤率为71.4%、77.0%。盆栽试验表明,接种供试菌株Spr4-5、Spr2-9占瘤率分别为57.9%、63.0%,比对照极显著增产52.5%、22.7%;接种Spr4-5比Spr2-9极显著增产24.2%。初步说明两个供试菌株的竞争结瘤力比土著根瘤菌强,菌株Spr2-9强于Spr4-5;Spr4-5比Spr2-9有效性高,是结瘤适量,竞争结瘤能力强的高效菌株。 展开更多
关键词 GUS基因标记 慢生花生根瘤菌 竞争结瘤
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药用植物内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究 被引量:10
8
作者 陈兰 张小平 Kristina Lindstrom 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期432-438,共7页
【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】... 【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中在84%的相似水平上产生13个表观群。16S rDNA PCR-RFLP分析表明供试菌株表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明药用植物的内生芽孢杆菌的基因组也具有多样性,聚群的结果与数值分类有较好一致性。用软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索,并构建系统发育树。由16S rDNA序列分析可知,供试的代表菌株SCAU11与球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)亲缘关系最近,SCAU78和SCAU25为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)的亲缘关系最近。【结论】研究结果表明药用植物内生芽孢杆菌具有明显的表型和遗传多样性。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 多样性 数值分类 16S DNA PCR-RFLP BOX-PCR指纹图谱 系统发育
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四川主要农用土壤中丛枝菌根真菌数量和种类的初步研究 被引量:2
9
作者 王元元 张小平 +1 位作者 Mauritz Vestberg Kristina Lindstrom 《四川林业科技》 2006年第6期61-64,共4页
用形态学分类法测土壤样品中丛枝菌根真菌的数量和种类分布特点,结果表明,丛枝菌根真菌广泛分布于四川农业土壤中,但其数量和种类较少,种群结构单一。共计分离鉴定出3个属18种丛枝菌根真菌,球囊霉属(Glomus)13种,无梗囊霉属(Acaulospor... 用形态学分类法测土壤样品中丛枝菌根真菌的数量和种类分布特点,结果表明,丛枝菌根真菌广泛分布于四川农业土壤中,但其数量和种类较少,种群结构单一。共计分离鉴定出3个属18种丛枝菌根真菌,球囊霉属(Glomus)13种,无梗囊霉属(Acaulospora)2种,盾巨孢囊霉属(Scutellospora)3种,其中只有Gl.mosseae,Gl.cale-donium,Gl.constrictum的出现频率大于10%,是主要四川省农用土壤中的优势种。研究还发现,地域因素、土壤类型和土壤的理化性质以及人为因素对丛枝菌根真菌的数量和种类有显著影响(P<0.05)。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 农用土 物种丰度 紫色土 四川
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Lignin Biosynthesis Studies in Plant Tissue Cultures 被引量:9
10
作者 Anna Krknen Sanna Koutaniemi 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期176-185,共10页
Lignin, a phenolic polymer abundant in cell walls of certain cell types, has given challenges to scientists studying its structure or biosynthesis. In plants lignified tissues are distributed between other, non-lignif... Lignin, a phenolic polymer abundant in cell walls of certain cell types, has given challenges to scientists studying its structure or biosynthesis. In plants lignified tissues are distributed between other, non-lignified tissues, Characterization of native lignin in the cell wall has been difficult due to the highly cross-linked nature of the wall components. Model systems, like plant tissue cultures with tracheary element differentiation or extracellular lignin formation, have provided useful information related to lignin structure and several aspects of lignin formation. For example, many enzyme activities in the phenylpropanoid pathway have been first identified in tissue cultures. This review focuses on studies where the use of plant tissue cultures has been advantageous in structural and biosynthesis studies of lignin, and discusses the validity of tissue cultures as models for lignin biosynthesis. 展开更多
关键词 CELL Lignin Biosynthesis Studies in Plant Tissue Cultures
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