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Haplotype-resolved and chromosome-scale genomes provide insights into co-adaptation between the Amur tiger and Amur leopard
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作者 Hai-Meng Li Bo-Yang Liu +16 位作者 Min-Hui Shi Le Zhang Shang-Chen Yang Sunil Kumar Sahu Liang-Yu Cui Shan-Lin Liu Nicolas Dussex Yue Ma Dan Liu Wei-Yao Kong Hao-Rong Lu Yue Zhao Love Dalén Huan Liu Tian-Ming Lan Guang-Shun Jiang Yan-Chun Xu 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2024年第3期464-467,共4页
DEAR EDITOR,Big cats,such as Amur tigers(Panthera tigris altaica)and Amur leopards(P.pardus orientalis),are apex predator and have evolved specialized traits for hunting and carnivory(Moya et al.,2022),thus playing a ... DEAR EDITOR,Big cats,such as Amur tigers(Panthera tigris altaica)and Amur leopards(P.pardus orientalis),are apex predator and have evolved specialized traits for hunting and carnivory(Moya et al.,2022),thus playing a crucial role in maintaining biodiversity and ecosystem integrity by regulating prey-predator dynamics.However,human-induced pressures,habitat fragmentation,and environmental alterations have restricted these species in small and isolated populations.Currently,all extant big cats are categorized as endangered or threatened according to their conservation status.Amur tigers and Amur leopards share overlapping geographic ranges,habitats,and certain prey species in the forests of Northeast Asia(Jiang et al.,2015).To reduce interspecies conflict,these carnivores exhibit differentiated dietary and temporal niches.Amur tigers predominantly prey on large ungulates,while Amur leopards hunt small to medium-sized animals(Sugimoto et al.,2016).Additionally,they occupy different temporal niches,with tigers being active at night and leopards more active during the day.Despite spatial and temporal niche partitioning,interspecific competition between these two species is inevitable.Tigers,benefiting from their greater size,have a competitive advantage over leopards,which can manifest in occasional leopard predation by tigers and declines in leopard populations with increasing tiger density(Jiang et al.,2015).Tigers also displace leopards from marginal habitats in nature reserves where they coexist. 展开更多
关键词 habitat PANTHERA RESOLVED
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基于Transformer的东北虎体侧条纹个体识别
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作者 马光凯 张静 +3 位作者 戴文锐 刘梦雨 刘丹 姜广顺 《野生动物学报》 北大核心 2024年第4期734-743,共10页
东北虎(Panthera tigris altaica)作为世界上最大的猫科(Felidae)动物,同时也是濒危物种,其个体识别是回答进化生物学中许多重大问题的关键步骤。尽管目前已提出虹膜和DNA分析等传统方法用于东北虎个体识别,但这些方法在远程获取和样本... 东北虎(Panthera tigris altaica)作为世界上最大的猫科(Felidae)动物,同时也是濒危物种,其个体识别是回答进化生物学中许多重大问题的关键步骤。尽管目前已提出虹膜和DNA分析等传统方法用于东北虎个体识别,但这些方法在远程获取和样本收集方面面临挑战,且在很大程度上依赖人工识别。随着计算机视觉技术的发展,深度学习成为动物个体识别的强大工具。因此,提出使用基于深度学习的方法进行东北虎个体识别。首先收集黑龙江东北虎林园20只东北虎个体的监控视频图像,然后采用Mask R-CNN算法对每张图像中的特征区域进行自动检测与分割,以构建东北虎条纹数据集(Amur tiger stripe dataset,ATSD),最后在该数据集的基础上分别应用基于CNN和Transformer的多个分类网络独立地对东北虎个体进行识别。结果表明:基于Transformer的分类网络对东北虎条纹的识别准确率达到91.49%,取得了更好的识别性能。该方法在降低拍摄条件下,对复杂环境具有良好的适用性,具有扩展生态学调查和非侵入性抽样设计的潜力,为野生动物的保护和管理提供技术支持。 展开更多
关键词 东北虎 个体识别 条纹识别 深度学习 TRANSFORMER
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圈养东北虎猫冠状病毒的巢氏PCR检测
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作者 刘亚男 谢薇 +4 位作者 徐海涛 王阳平 舒怡 梁美玉 王亚君 《野生动物学报》 北大核心 2024年第4期896-900,共5页
东北虎(Panthera tigris altaica)是全球生物多样性保护的旗舰物种,在维持生态系统功能中占据不可替代的重要地位。东北虎对于可感染家猫的病毒均易感,但目前关于东北虎病毒病的流行病学资料仍然十分有限。猫冠状病毒(Feline coronavi‐... 东北虎(Panthera tigris altaica)是全球生物多样性保护的旗舰物种,在维持生态系统功能中占据不可替代的重要地位。东北虎对于可感染家猫的病毒均易感,但目前关于东北虎病毒病的流行病学资料仍然十分有限。猫冠状病毒(Feline coronavi‐rus,FCoV)感染,轻可导致猫科(Felidae)动物腹泻,重则呈现高致病性、致死性的猫传染性腹膜炎(Feline infectious peritonitis,FIP)。因此,采用巢氏PCR方法对来自黑龙江省东北虎林园的6份东北虎全血样本进行FCoV检测,结果显示2份样本为阳性(H-11-1241、H-11-1310),阳性率为33.3%。所得PCR片段与其他参考株同源性为99.3%~100.0%。研究结果丰富了圈养东北虎中猫冠状病毒流行病学数据,为其他圈养猫科动物的FCoV监测提供了参考,对野生猫科动物的保护与繁育具有重要意义。 展开更多
关键词 东北虎 猫冠状病毒 巢氏PCR
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基于自动相机技术对西伯利亚狍(Capreolus pygargus)季节性换毛序的测定 被引量:1
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作者 华彦 赖俊宇 +2 位作者 刘丹 邢晓莹 姜广顺 《野生动物学报》 北大核心 2019年第4期840-847,共8页
换毛是动物的物候现象,是了解动物适应季节更迭和环境的重要手段,受制于技术手段,野生动物的换毛序一直是动物学研究的难点。随着自动相机在野生动物监测的应用和普及,使基于自动相机影像数据对动物季节性换毛序的研究成为可能。本文以... 换毛是动物的物候现象,是了解动物适应季节更迭和环境的重要手段,受制于技术手段,野生动物的换毛序一直是动物学研究的难点。随着自动相机在野生动物监测的应用和普及,使基于自动相机影像数据对动物季节性换毛序的研究成为可能。本文以东北林区常见的西伯利亚狍为研究对象,基于自动相机监测技术,对不同地区狍春季和秋季换毛过程进行研究,分析狍季节性换毛的启动时间、换毛过程、节律、结束时间等,得出以下结果:在不同纬度地区,狍的换毛序基本一致。与较低纬度地区相比,狍在高纬度地区秋季换毛启动早,换毛持续的时间短;春季换毛启动晚,持续的时间长。 展开更多
关键词 自动相机技术 西伯利亚狍 季节性 换毛序
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幼龄东北虎脐疝的麻醉监测及手术治疗
5
作者 苏景 马海鹍 +3 位作者 黄海涛 崔海林 刘涛 范宏刚 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第4期138-141,共4页
对幼龄东北虎相关手术的详细麻醉试验的研究资料较少,东北农业大学兽医外科团队在与东北虎林园开展科研和诊疗技术合作的过程中,遇到1例发生脐疝的幼龄东北虎的病例,治疗过程中采用舒泰50、右美托咪定和丁丙诺啡组成的复方麻醉方案,麻... 对幼龄东北虎相关手术的详细麻醉试验的研究资料较少,东北农业大学兽医外科团队在与东北虎林园开展科研和诊疗技术合作的过程中,遇到1例发生脐疝的幼龄东北虎的病例,治疗过程中采用舒泰50、右美托咪定和丁丙诺啡组成的复方麻醉方案,麻醉效果良好,手术全过程血氧饱和度均在97%以上,未发生明显的麻醉并发症和意外,并成功将疝内容物还纳回腹腔,预后良好。说明在该复合麻醉方案的保障下可顺利完成幼龄东北虎脐疝整复手术。 展开更多
关键词 东北虎 舒泰 右美托咪啶 丁丙诺啡 复合麻醉 脐疝整复术
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基于目标检测的东北虎个体自动识别 被引量:10
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作者 史春妹 谢佳君 +2 位作者 顾佳音 刘丹 姜广顺 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期4685-4693,共9页
东北虎个体的自动识别是种群数量评估和制定有效保护策略的重要基础。以东北虎林园和怪坡虎园38只虎为研究对象,将目标检测方法首次应用到东北虎个体识别研究中,采用多种深度卷积神经网络模型,以实现虎个体的自动识别。首先通过相机在... 东北虎个体的自动识别是种群数量评估和制定有效保护策略的重要基础。以东北虎林园和怪坡虎园38只虎为研究对象,将目标检测方法首次应用到东北虎个体识别研究中,采用多种深度卷积神经网络模型,以实现虎个体的自动识别。首先通过相机在不同角度对38只东北虎进行拍摄取样,建立包含13579张图像的虎样本数据集。由于虎的体侧条纹信息不具有对称性,所以运用单次多盒目标检测(Single Shot MultiBox Detector, SSD)方法,对虎的躯干左侧条纹、右侧条纹以及脸部等不同部位图像,进行自动检测并分割提取,极大节省手工截取时间。在检测分割出的左右侧及脸部不同部位图片基础上,运用上、下、左、右平移变换进行数据增强,使图片数目扩大为原来的5倍。采用LeNet、AlexNet、ZFNet、VGG16、ResNet34共5种卷积神经网络模型进行个体自动识别。为了提高识别准确率,运用平均值和最大值不同组合方式来优化池化操作,并在全连接层引入概率分别为0.1、0.2、0.3、0.4的丢弃(Dropout)操作防止过拟合。实验表明,目标检测模型耗时较少,截取分割老虎不同部位条纹能达到0.6 s/张,远快于人工截取速度,并且在测试集上准确率能达到97.4%。不同姿态下的目标部位都能正确识别并分割。ResNet34模型的准确率优于其他网络模型,左右侧条纹以及脸部图像识别准确率分别为93.75%、97.01%和86.28%,右侧条纹识别准确率优于左侧条纹和脸部图像。研究为野生虎自动相机影像的识别提供技术参考。在未来研究中,对东北虎个体影响数据进行扩充,选取更多影像数据进行训练,使网络具有更强的适应性,从而实现更准确的个体识别。 展开更多
关键词 东北虎 个体自动识别 目标检测
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舒泰、右美托咪定和丁丙诺啡复合麻醉幼龄东北虎的手术效果分析 被引量:4
7
作者 黄海涛 马海鹍 +7 位作者 唐雷 李大鹏 邱宏坤 林云兴 刘涛 周路遥 杨昊天 范宏刚 《野生动物学报》 北大核心 2020年第3期718-724,共7页
本研究总结了6例幼龄东北虎脐疝手术麻醉效果,药物选用舒泰、右美托咪定和丁丙诺啡复合麻醉。麻醉期及在给药后10、20、30、40、50、60 min时监测体温(T)、心率(HR)、呼吸频率(RR)、脉搏血氧饱和度(SPO2)、平均动脉压(MAP),以及镇痛、... 本研究总结了6例幼龄东北虎脐疝手术麻醉效果,药物选用舒泰、右美托咪定和丁丙诺啡复合麻醉。麻醉期及在给药后10、20、30、40、50、60 min时监测体温(T)、心率(HR)、呼吸频率(RR)、脉搏血氧饱和度(SPO2)、平均动脉压(MAP),以及镇痛、镇静和肌松效果等。试验结果显示:复合麻醉方案对6例幼年患虎麻醉效果良好,可保障脐疝修补手术顺利完成,对机体的生理机能主要影响表现在T、HR和MAP方面,RR和SPO2在整个监测过程中均未显著性变化(P>0.05),且SPO2在全过程不低于97%。综合试验结果:表明于幼龄东北虎颈部肌内注射舒泰、右美托咪定和丁丙诺啡,可顺利完成脐疝修补手术,有效抑制手术刺激。 展开更多
关键词 东北虎 复合麻醉 手术验证 舒泰 右美托咪定 丁丙诺啡
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东北虎源猫免疫缺陷病毒pol基因遗传进化分析 被引量:1
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作者 刘恩琪 马丽莹 +6 位作者 黄舒萍 尤丹 郭立君 刘丹 徐海涛 郜旭 王亚君 《动物医学进展》 北大核心 2022年第1期18-22,共5页
为了解中国东北虎源猫免疫缺陷病毒(FIV)的感染情况,采集海林市横道河子东北虎林园东北虎全血样本50份,通过套式PCR对样本进行FIV pol基因扩增,并对阳性样本进行测序,再运用生物信息学软件进行遗传进化分析。结果检测出1只虎为FIV阳性,... 为了解中国东北虎源猫免疫缺陷病毒(FIV)的感染情况,采集海林市横道河子东北虎林园东北虎全血样本50份,通过套式PCR对样本进行FIV pol基因扩增,并对阳性样本进行测序,再运用生物信息学软件进行遗传进化分析。结果检测出1只虎为FIV阳性,其pol基因与参考毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为70.0%~99.8%和75.0%~99.4%,且存在39个氨基酸突变位点,系统发育树显示其与A亚型猫源FIV CHN17毒株亲缘关系最近。这是中国首次从东北虎体内检测到FIV,表明对中国大型猫科动物进行FIV的监测的必要性,同时应该注意对圈养老虎栖息地周围流浪猫的管理。 展开更多
关键词 东北虎 猫免疫缺陷病毒 pol基因 套式PCR 遗传进化分析
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圈养东北虎幼崽群体活动的自动跟踪方法研究 被引量:2
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作者 马光凯 吴伟 +3 位作者 刘丹 崔永璐 邓雯心 姜广顺 《野生动物学报》 北大核心 2022年第3期605-613,共9页
东北虎(Panthera tigris altaica)是国家一级重点保护野生动物,在人工饲养环境下,对东北虎幼崽及其母虎活动的精准跟踪是研究东北虎幼崽成长过程中行为发育、观测东北虎个体健康状况的重要手段。本研究提出了一种轻量型的GhostNet-DeepS... 东北虎(Panthera tigris altaica)是国家一级重点保护野生动物,在人工饲养环境下,对东北虎幼崽及其母虎活动的精准跟踪是研究东北虎幼崽成长过程中行为发育、观测东北虎个体健康状况的重要手段。本研究提出了一种轻量型的GhostNet-DeepSORT算法来实现在监控视频下的东北虎幼崽群体活动的多目标跟踪。该算法的测试结果表明:东北虎幼崽个体目标检测的召回率和平均精度均值分别是94.9%和96.2%,东北虎幼崽多目标跟踪准确度(MOTA)和精确度(MOTP)分别是91.6%和88.2%。通过轻量化操作处理后的GhostNet-DeepSORT算法,在MOTA保持不变时,MOTP提升了1.25%,而且模型占用内存从45.4 MB减小到6.5 MB。因此,相对于DeepSORT算法而言,GhostNet-DeepSORT算法在保证跟踪精度的同时更适用于算力资源不足的小型设备,相比于由宽残差网络构成的重识别网络,采用GhostNet网络进行模型的轻量化替代,实现在视频中东北虎个体重识别。该跟踪算法的实现也为后续圈养东北虎幼崽个体行为识别和个体健康的便捷和快速评估研究提供必要的技术支撑。 展开更多
关键词 东北虎幼崽 目标检测 自动跟踪 GhostNet YOLOv5 DeepSORT
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圈养亚成体及成体东北虎体尺参数及体重 被引量:1
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作者 崔永璐 刘丹 +7 位作者 牟歌 宫明 徐海涛 李鑫 杨升帆 樊雪飞 刘艳华 姜广顺 《野生动物学报》 北大核心 2021年第4期965-972,共8页
为探究东北虎(Panthera tigris altaica)的生长发育特征,为东北虎的人工饲养以及野生东北虎的保护提供科学参考,测定了东北虎体重、胸围、腰围、肩高、臀高、体长、颈围和前后掌垫宽9个体尺参数,并对亚成体与成体东北虎体重及体尺参数... 为探究东北虎(Panthera tigris altaica)的生长发育特征,为东北虎的人工饲养以及野生东北虎的保护提供科学参考,测定了东北虎体重、胸围、腰围、肩高、臀高、体长、颈围和前后掌垫宽9个体尺参数,并对亚成体与成体东北虎体重及体尺参数的差异性及体重与体尺参数间的线性关系进行分析。结果表明:成体雄虎体重、体长、肩高、前掌垫宽及后掌垫宽均显著大于亚成体;成体雌虎臀高、胸围及腰围显著小于亚成体雌虎。4—5岁的东北虎,除体长、前掌垫宽和后掌垫宽以外,其他体尺参数均下降,5岁以后逐渐增长。在对体尺参数与体重的线性回归分析中,肩高与体重的拟合效果最好,并且肩高与体长也具有显著线性关系,因此肩高是评估东北虎体重和体长的重要参数。 展开更多
关键词 东北虎 体尺 体重 线性回归
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哈尔滨圈养东北虎FHV-1的巢式PCR检测及gD基因序列分析
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作者 石龙艳 黄舒萍 +9 位作者 郭琳 李祥 王贤 陆雨欣 苏雨晴 徐海涛 周晓禹 李大鹏 宫明 王亚君 《野生动物学报》 北大核心 2022年第3期810-815,共6页
东北虎(Panthera tigris altaica)是世界上体型较大的猫科(Felidae)动物,是我国一级保护动物。疾病防控对东北虎保护与繁育工作至关重要,目前关于东北虎重要病毒病的流行病学资料寥寥无几。传染性鼻气管炎是由猫疱疹病毒Ⅰ型(Feline her... 东北虎(Panthera tigris altaica)是世界上体型较大的猫科(Felidae)动物,是我国一级保护动物。疾病防控对东北虎保护与繁育工作至关重要,目前关于东北虎重要病毒病的流行病学资料寥寥无几。传染性鼻气管炎是由猫疱疹病毒Ⅰ型(Feline herpesvirus type 1,FHV-1)感染引起的一种上呼吸道疾病,且现有疫苗免疫后多出现再感染现象,对猫科动物健康造成一定危害。本研究采集50只东北虎全血样本,利用巢式PCR进行FHV-1检测,结果有10份样本扩增出明显目的条带,阳性率为20%;随机选取其中2株扩增FHV-1 gD基因全序列,获取的1125 bp序列与FHV-1参考株同源性为99.16%~99.56%,相比FHV-1参考株,获取序列有5个碱基位点发生了突变。研究结果丰富了圈养东北虎FHV-1流行病学数据,为圈养大型猫科动物的FHV-1监测提供了参考,有利于提高东北虎种群的保护成效。 展开更多
关键词 东北虎 FHV-1 GD基因 巢式PCR
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Amur tiger stripes:individual identification based on deep convolutional neural network 被引量:8
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作者 Chunmei SHI Dan LIU +3 位作者 Yonglu CUI Jiajun XIE Nathan James ROBERTS Guangshun JIANG 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2020年第6期461-470,共10页
The automatic individual identification of Amur tigers(Panthera tigris altaica)is important for population monitoring and making effective conservation strategies.Most existing research primarily relies on manual iden... The automatic individual identification of Amur tigers(Panthera tigris altaica)is important for population monitoring and making effective conservation strategies.Most existing research primarily relies on manual identifi-cation,which does not scale well to large datasets.In this paper,the deep convolution neural networks algorithm is constructed to implement the automatic individual identification for large numbers of Amur tiger images.The experimental data were obtained from 40 Amur tigers in Tieling Guaipo Tiger Park,China.The number of images collected from each tiger was approximately 200,and a total of 8277 images were obtained.The experiments were carried out on both the left and right side of body.Our results suggested that the recognition accuracy rate of left and right sides are 90.48%and 93.5%,respectively.The accuracy of our network has achieved the similar level compared to other state of the art networks like LeNet,ResNet34,and ZF_Net.The running time is much shorter than that of other networks.Consequently,this study can provide a new approach on automatic individual identification technology in the case of the Amur tiger. 展开更多
关键词 Amur tiger deep convolutional neural network individual identification stripe feature
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Simultaneous polyandry and heteropaternity in tiger(Panthera tigris altaica):Implications for conservation of genetic diversity in captive populations of felids 被引量:3
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作者 LIU Dan MA Yue +5 位作者 LI HuiYi XU YanChun ZHANG Yan DAHMER Thomas BAI SuYing WANG Jian 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2013年第17期2230-2236,共7页
Male tigers(Panthera tigris altaica) in captivity copulate alternatively with an estrous female,suggesting a potential for heteropaternity as an effective reproductive strategy to maximize genetic diversity of offspri... Male tigers(Panthera tigris altaica) in captivity copulate alternatively with an estrous female,suggesting a potential for heteropaternity as an effective reproductive strategy to maximize genetic diversity of offspring.We analyzed microsatellites to test and compare the genetic output of multiple male mating(simultaneous polyandry) and single male mating(monogamy) with a female in a captive population.Simultaneous polyandry resulted in heteropaternity in 66.7% observed litters.No significant differences between parental populations and between offspring populations were detected in the number of alleles(A),expected heterozygosity(H e),number of effective alleles(N e) per locus and standard individual heterozygosity(SH)(P>0.05 for all 4 indexes).Comparisons showed no significant reduction of A,H o,H e and SH from parental population to offspring population for the two mating modes(P>0.05) except for SH in polyandrous families(P=0.029).However,such reduction was equivalent to single mating families when the influence of relatedness was eliminated using effective SH(E SH)(P>0.05).These results highlight an alternative strategy for managing captive populations of tiger and other wild felids in which animals are combined at one location allowing for copulation by multiple males to encourage heteropaternity in favor of maintained genetic diversity among offspring. 展开更多
关键词 遗传多样性保护 圈养种群 猫科动物 东北虎 一夫一妻制 等位基因数 Pgt 杂合度
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Estimation of body weight in captive Amur tigers(Panthera tigris altaica)
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作者 Qi WANG Chunmei SHI +1 位作者 Dan LIU Guangshun JIANG 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2022年第6期1106-1120,共15页
So far,there has been no safe and convenient method to weigh the largefierce animals,like Amur tigers.To address this problem,we built models to predict the body weight of Amur tigers based on the fact that body weight... So far,there has been no safe and convenient method to weigh the largefierce animals,like Amur tigers.To address this problem,we built models to predict the body weight of Amur tigers based on the fact that body weight is proportional to body measurements or age.Using the method of body measurements,we extracted the body measurements from 4 different kinds of the lateral body image of tigers,that is,total lateral image,central lateral image,ellipsefitting image,and rectanglefitting image,and then we respectively used artificial neural network(ANN)and power regression model to analyze the predictive relationships between body weight and body measurements.Our results demonstrated that,among all ANN models,the model built with rectanglefitting image had the smallest mean square error.Comparatively,we screened power regression models which had the smallest Akakai information criteria(AIC).In addition,using the method of age,wefitted nonlinear regression models for the relationship between body weight and age and found that,for male tigers,logistic model had the smallest AIC.For female tigers,Gompertz model had the smallest AIC.Consequently,this study could be applied to estimate body weight of captive,or even wild,Amur tigers safely and conveniently,helping to monitor individual health and growth of the Amur tiger populations. 展开更多
关键词 Amur tiger body weight growth curve image analysis Panthera tigris altaica
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普通动物学野外实习“三立一体”模式的设计与实践 被引量:1
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作者 于东 刘鹏 邱宏坤 《林区教学》 2020年第3期89-91,共3页
动物学野外实习是高校动物学相关课程理论与实践相结合的重要实践教学环节。在多年的动物学野外实践教学中,突出的共性问题是单项分类内容多,系统交叉内容少;物种识别内容多,专题研究内容少;教学验证内容多,探究拓展内容少。本教学团队... 动物学野外实习是高校动物学相关课程理论与实践相结合的重要实践教学环节。在多年的动物学野外实践教学中,突出的共性问题是单项分类内容多,系统交叉内容少;物种识别内容多,专题研究内容少;教学验证内容多,探究拓展内容少。本教学团队在历年动物野外实习中,立足于理论课和教材规划体系、优化实验课教学体系、实习基地建设体系,充分体现新形势下新型人才培养目标要求,设计和尝试"三立一体"的动物学野外实习新模式。 展开更多
关键词 普通动物学 野外实习 实践模式
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Individual automatic detection and identification of big cats with the combination of different body parts 被引量:3
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作者 Chunmei SHI Jing XU +2 位作者 Nathan James ROBERTS Dan LIU Guangshun JIANG 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2023年第1期157-168,共12页
The development of facial recognition technology has become an increasingly powerful tool in wild animal indi-vidual recognition.In this paper,we develop an automatic detection and recognition method with the combinat... The development of facial recognition technology has become an increasingly powerful tool in wild animal indi-vidual recognition.In this paper,we develop an automatic detection and recognition method with the combinations of body features of big cats based on the deep convolutional neural network(CNN).We collected dataset including 12244 images from 47 individual Amur tigers(Panthera tigris altaica)at the Siberian Tiger Park by mobile phones and digital camera and 1940 images and videos of 12 individual wild Amur leopard(Panthera pardus orientalis)by infrared cameras.First,the single shot multibox detector algorithm is used to perform the automatic detection process of feature regions in each image.For the different feature regions of the image,like face stripe or spots,CNNs and multi-layer perceptron models were applied to automatically identify tiger and leopard individuals,in-dependently.Our results show that the identification accuracy of Amur tiger can reach up to 93.27%for face front,93.33%for right body stripe,and 93.46%for left body stripe.Furthermore,the combination of right face,left body stripe,and right body stripe achieves the highest accuracy rate,up to 95.55%.Consequently,the combination of different body parts can improve the individual identification accuracy.However,it is not the higher the number of body parts,the higher the accuracy rate.The combination model with 3 body parts has the highest accuracy.The identification accuracy of Amur leopard can reach up to 86.90%for face front,89.13%for left body spots,and 88.33%for right body spots.The accuracy of different body parts combination is lower than the independent part.For wild Amur leopard,the combination of face with body spot part is not helpful for the improvement of identification accuracy.The most effective identification part is still the independent left or right body spot part.It can be applied in long-term monitoring of big cats,including big data analysis for animal behavior,and be helpful for the individual identification of other wildlife species. 展开更多
关键词 combination of body parts individual automatic identification object detection Panthera pardus orientalis Panthera tigris altaica
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An initial coprological survey of parasitic fauna in the wild Amur leopard(Panthera pardus orientalis)
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作者 Zhijun HOU Zhiwei PENG +3 位作者 Yao NING Dan LIU Hongliang CHAI Guangshun JIANG 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2020年第5期375-384,共10页
The Amur leopard,one of nine recently recognized subspecies of leopard,is still the most threatened by a stochastic procession of extinction.Evaluation of the potential danger to the conservation of the Amur leopard o... The Amur leopard,one of nine recently recognized subspecies of leopard,is still the most threatened by a stochastic procession of extinction.Evaluation of the potential danger to the conservation of the Amur leopard originating from disease urgently needs to be studied.Unfortunately,research on the potential risk to Amur leopards caused by disease is rare.In terms of parasitic diseases that affect this species,even basic data for parasitic fauna are absent.The aim of this study is to acquire this knowledge to improve the general understanding of Amur leopard parasites.Seven parasite species,including 3 nematodes(Toxocara cati,a capillarid-type parasite,and a Metastrongyloideatype parasite),2 cestodes(Spirometra sp.and Taenia sp.),1 trematode(Paragonimus sp.),and 1 protozoan(Cystoisospora felis),were found in this research.Toxocara cati occurred most frequently,followed by Spirometra sp. 展开更多
关键词 Amur leopard Panthera pardus orientalis parasitic fauna
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