上海某三甲医院2014—2021年血流感染病原菌的分布及耐药性分析

本研究对同济大学附属东方医院2014—2021年血培养标本分离的主要病原菌及其耐药性进行统计分析,旨在为临床合理使用抗菌药物提供参考。结果显示,剔除重复菌株后,该院8年间从血培养标本中共检出病原菌1396株,以革兰氏阴性菌为主,占56.3%,其次为革兰氏阳性菌(38.4%)和真菌(5.3%)。居前8位的菌株为大肠埃希菌(21.5%)、凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase-negative Staphylococcus,CNS)(17.4%),肺炎克雷伯菌(14.9%)、金黄色葡萄球菌(7.2%)、鲍曼不动杆菌(5.4%)、粪肠球菌(4.2%)、屎肠球菌(3.7%)和铜绿假单胞菌(3.5%)。大肠埃希菌对第3代头孢菌素的8年累积耐药率均超过50%,对碳青霉烯类药物的8年累积耐药率低至1%;肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类药物的8年累积耐药率均高于40%;鲍曼不动杆菌对头孢类、氨基糖苷类和碳青霉烯类药物的8年累计耐药率均大于45%。此外,44.6%的金黄色葡萄球菌和74.5%的CNS为耐甲氧西林菌珠。

“一健康基金”成立

本刊名誉主编闻玉梅院士及其丈夫宁寿葆教授以个人名义捐赠的“一健康基金”于2013年1月16日在复旦大学上海医学院正式成立。“一健康”,是英文“One Health”的中文缩写,意指“一体化健康”。它突出了人的健康是一个“系统工程”,需要整合基础医学、临床医学、公共卫生学、药学、生命科学和人文社会科学等诸多学科共同研究与实施保障。也就是说,人类健康问题不仅仅是医学的事、医生的事,而是涉及多个学科交叉的系统性科学领域,是“一体化”事业。

结核分枝杆菌外排泵研究进展

结核病是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)引起的一种传染病。随着多药耐药和广泛耐药结核分枝杆菌的出现,结核病的治疗变得更为艰难。近年来研究发现,结核分枝杆菌存在外排泵是其耐药的原因之一,现已发现结核分枝杆菌的主要易化子超家族(major facilitator superfamily,MFS)、三磷酸腺苷(adenosine-triphosphate,ATP)结合盒超家族(ATP-Binding Cassette,ABC)、耐受小节分裂区家族(resistance-nodulation-division,RND)和小耐多药性家族(small multidrug resistance,SMR)外排泵。但是人们对结核分枝杆菌外排泵介导的耐药现象认识不足,仍缺乏从新药发现角度研发外排泵抑制剂的研究。本文拟对结核分枝杆菌的ABC、MFS、RND和SMR外排泵的结构和功能,以及结核分枝杆菌外排泵抑制剂的研究进展进行综述。

耐碳青霉烯类肠杆菌的流行病学特点与治疗现状

耐碳青霉烯类肠杆菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)是近年来检出率不断升高的一种临床常见耐药菌,是导致患者死亡的独立危险因素。CRE的出现主要是由于细菌产碳青霉烯酶,包括肺炎克雷伯菌产生的碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase,KPC)、金属β-内酰胺酶(metallo-β-lactamase,MBL)和苯唑西林酶(oxacillinase,OXA),少数是由于细菌外膜蛋白改变以及外排泵高表达。临床上最常见的CRE是肺炎克雷伯菌,最常暴发CRE感染的科室是重症监护室(intensive care unit,ICU),感染高危因素包括接触医疗机构、各种侵入性操作以及抗菌药物使用史。由于缺乏前瞻性临床试验数据,目前在治疗CRE感染的高危患者时多采用多药联合的经验性治疗措施,一些经典药物如多黏菌素、替加环素、磷霉素等起到了意想不到的效果,一些新药如头孢他啶-阿维巴坦也投入使用并发挥了一定作用。本文就近年来CRE感染的流行病学特点以及目前临床上主要使用的药物进行综述。

“一健康基金”成立

本刊名誉主编闻玉梅院士及其丈夫宁寿葆教授以个人名义捐赠的“一健康基金”于2013年1月16日在复旦大学上海医学院正式成立。“一健康”,是英文“One Health”的中文缩写,意指“一体化健康”。它突出了人的健康是一个“系统工程”,需要整合基础医学、临床医学、公共卫生学、药学、生命科学和人文社会科学等诸多学科共同研究与实施保障。也就是说,人类健康问题不仅仅是医学的事、医生的事,而是涉及多个学科交叉的系统性科学领域,是“一体化”事业。

化脓性中耳炎病原菌感染的研究进展

化脓性中耳炎是耳鼻喉科临床常见疾病,可导致听力下降、鼓膜充血、鼓膜穿孔、耳鸣、耳痛及流脓等。化脓性中耳炎主要由微生物进入中耳引起感染,使中耳黏膜发生化脓性病变,且不同患者感染的病原菌不同。本文从化脓性中耳炎的发病机制、病原菌及其耐药性和治疗方法等几个方面进行综述,以期为临床化脓性中耳炎的诊断及合理用药提供参考。

上海口岸输入性传染性肺结核病患者中结核分枝杆菌北京型特征及耐药性分析

本研究旨在了解上海口岸输入性传染性肺结核病患者中结核分枝杆菌北京型特征及其对一线抗结核药物的耐药情况，从而正确评估输入性结核病给上海地区带来的公共卫生危害，同时为地区传染性结核病防治策略的制定提供依据。针对2009年1月-2013年5月上海口岸入境体检人员中胸部影像学诊断疑似活动性肺结核病的人群，采集其连续3d的晨痰分离培养结核分枝杆菌，用MGIT960培养法分析其对抗结核药物（链霉素、异烟肼、利福平、乙胺丁醇、吡嗪酰胺）的耐药情况，用目标缺失多重聚合酶链反应（DTM．PCR）进行结核分枝杆菌北京型分子分型，同时采集其人口学资料。期间共监测到入境外籍疑似活动性肺结核病者193例，其中50例痰液中分离培养到结核分枝杆菌，菌培阳率为25．9％，与我国结核病普查工作中活动性肺结核病菌培阳率（25．9％）相同。分离培养并成功传代、分型的40株结核分枝杆菌中，北京型占57．5％（23／40），显著低于同期上海口岸出境人群中的90．2％（37／41）。输入性结核分枝杆菌北京型主要来自东南亚地区（71．4％，5／7）和西太平洋地区（57．1％，16／28）。一线5种抗结核药物的耐药性检测结果显示，输入性结核分枝杆菌北京型的总耐药率为30．4％（7／23），接近上海口岸出境人群的34．1％。输入性耐多药菌株占2．4％（1／42），分子分型结果显示为非北京型。输入性传染性肺结核病对吡嗪酰胺的耐药率为16．7％，显著高于上海口岸出境人群的2．4％。结果提示，上海口岸输入性肺结核病患者中结核分枝杆菌北京型所占比例显著低于同期出境人群，未发现与性别和年龄相关，未发现输入性结核分枝杆菌北京型对抗结核药物耐药性的显著变化。输入性耐药性结核病带来的公共卫生危害不容忽视，在直接督导下的短程化疗（DOTS）方案中需考虑其高吡嗪酰胺耐药特征。在口岸公共卫生安全风险评估中，需重视输入性结核分枝杆菌北京型与本地流行株的差异。

立克次体与立克次体病的检测与鉴定

立克次体是一类严格细胞内寄生的原核细胞型微生物,已被列入生物战剂名录。立克次体病是一类严重威胁人类健康的人兽共患的自然疫源性疾病。立克次体严格的细胞寄生性决定了立克次体病的诊断不同于传统方法,需根据流行病学资料、临床症状和体征及实验室检测进行综合判断,通常实验室检测是明确诊断的主要依据。从病原体的分离和培养到目前的基因水平比对,立克次体的检测技术虽发展了100多年,但人类尚未实现早期快速诊断立克次体病的目标。本文主要综述了立克次体与立克次体病检测与鉴定的研究进展。

乙型肝炎病毒e抗原阳性慢性乙型肝炎患者白细胞介素28B附近的多态性与聚乙二醇干扰素血清学应答的关系

只有很少一部分乙型肝炎病毒e抗原（HBe-Ag）阳性的慢性乙型肝炎患者对聚乙二醇干扰素a（PEG-IFN）的治疗有应答。该报道研究了白细胞介素28B（IL-28B）基因型是否与该应答有关。作者研究了205例经PEG-IFN治疗（部分患者同时采用拉米夫定治疗）的来自欧洲和亚洲11个医院的HBeAg阳性患者。

手足口病的流行现状及挑战

手足口病是由肠道病毒所致的全球性传染病。自20世纪90年代后期由肠病道毒所致的手足口病在亚太地区频繁暴发流行,其严重的神经系统并发症以及神经源性肺水肿致患者残疾和死亡。我国自2008年起每年发生全国范围的手足口病暴发流行,其中肠道病毒71型(EV71)是引起暴发而致死亡的主要病原体。目前手足口病已成为我国各类传染病中发病数最高的丙类传染病,给公共卫生带来严峻挑战。虽然绝大多数手足口病为自限性疾病,但约0.05%的患儿病情变化迅速并死亡,目前尚缺乏有效的抗病毒药物和疫苗来防治。因此,早期识别危重病例、早期进行合理临床管理和诊疗干预,以及采取及时有效的防控措施是降低手足口病所致危害的最主要策略。我国已在积极研发EV71疫苗,这将给手足口病流行暴发及其重症疾病的预防带来希望,并有望有效降低社会经济负担。

重症单核细胞增多性李斯特菌脑膜脑炎1例

李斯特菌脑膜脑炎是单核细胞增多性李斯特菌(LM)引起的细菌性脑膜脑炎,通常发生于免疫功能低下者。LM是人畜共患致病菌,通过污染的食物传播。欧美国家报道较多,国内报道较少。李斯特菌脑膜脑炎病死率高,临床表现与其他细菌性脑膜炎类似。脑脊液检查与结核性脑膜炎亦难鉴别,确诊依赖于脑脊液涂片及培养。本文报道1例重症李斯特菌脑膜脑炎,患者为免疫力正常的菲律宾籍中年女性,急性起病,先后以病毒性脑膜脑炎及结核性脑膜炎治疗,病情进展快,发病3周出现呼吸衰竭,气管插管呼吸机辅助通气。脑脊液培养见LM后,予氨苄西林联合氨基糖苷类药物治疗3周,患者意识恢复,病情好转出院。本病例报道总结了李斯特菌脑膜脑炎的临床特点、危险因素及治疗转归。

72株非伤寒沙门菌药敏分析及其所致儿童肠炎的临床特点

为探讨非伤寒沙门菌的耐药性及其引起儿童肠炎的临床特点,收集2009年3月~2010年10月广东省中山市博爱医院儿科消化病区送检的1 665例肠道感染患儿粪便标本,将培养、分离所获的72株非伤寒沙门菌进行药敏试验,并回顾分析其感染后的临床特点。结果显示,非伤寒沙门菌对头孢哌酮-舒巴坦、泰能、左氧氟沙星、哌拉西林-他巴唑坦和头孢他啶的敏感率分别为100%、98.61%、95.83%、87.50%和77.78%;对第1、2代头孢菌素,氨基糖苷类,不含酶抑制剂青霉素类,头霉素类等多种抗生素耐药率均〉80%。非伤寒沙门菌肠道感染的患儿通常表现出黏液血便、呕吐和发热等侵袭性肠炎的临床特点,年龄较大儿童可诉腹痛、腹胀,个别病例可发展为非伤寒沙门菌脓毒血症。本研究显示,非伤寒沙门菌对碳青酶烯类、含酶抑制剂β-内酰胺类、氟喹诺酮类药物敏感率较高,治疗时应根据药敏试验合理、谨慎选用抗生素,有效控制感染,尽可能避免重症病例的出现。

1例L型支气管戈登菌肺部感染的报道

放线菌目戈登菌属支气管戈登菌存在于环境中,在机体免疫力下降时可感染致病。从1例肺部感染4年的78岁患者痰标本中分离出1株菌株,经聚合酶链反应(PCR)扩增16SrRNADNA,序列比对分析证实为支气管戈登菌。该菌株在含蔗糖的Middlebrook7H9(7H9-L)半固体培养基上呈煎蛋样嵌入性生长,在含氯化钠的92-3TB(92-3TB-L)液体培养基也生长,而在罗氏培养基、BACTECMGIT-960、不含氯化钠的92-3TB(92-3TB-B)液体培养基及不含蔗糖的Middlebrook7H9(7H9-B)半固体培养基不生长。涂片抗酸染色显微镜下可见大小不等的抗酸染色阴性球状或短杆状菌。传代培养2代后可见橘红色菌落,涂片抗酸染色可见少量抗酸染色弱阳性杆状菌,革兰染色及扫描电子显微镜观察菌体为杆状。结果表明,从患者痰液中分离的菌株为L型支气管戈登菌,提示肺部感染迁延不愈的免疫力低下患者需考虑感染L型支气管戈登菌的可能。

最新病毒研究国外信息（二）

近来在冷凝塔水中发现了一种“巨大”病毒，在电子显微镜下达50nm，被称为“Sputnik”。它们存在于一种APMV（Acanthamoeba polyphaga minivirus）中。Sputnik基因中既有APMV基因，也有来自一种病毒的基因，类似噬菌体。由于Sputnik可感染病毒，又被称为“噬毒体”（Nature，2008，455（7209）：100—104）。

30例流行性乙型脑炎流行病学及临床特征分析

回顾性分析我中心感染科确诊的30例流行性乙型脑炎住院患者临床资料,分析流行性乙型脑炎的流行病学特征和临床特点,提高临床医师对该病的诊疗水平。结果显示,各年龄组人群均可发病,但儿童发病率较高。夏、秋季多发,集中在7?9月份,占全年病例的90%以上。所有患者均有发热、颅内高压症状,21例(70.0%)有意识障碍,14例(46.7%)出现抽搐,8例(26.7%)出现呼吸衰竭。脑膜刺激征阳性20例(66.7%),病理征阳性18例(60.0%)。脑脊液检查蛋白增高,白细胞计数均在300×106/L以下,糖和氯化物基本正常。脑脊液乙型脑炎特异性IgM抗体阳性率为100%。23例治愈或好转出院(76.7%),4例(13.3%)病情加重而自愿出院,3例(10.0%)治疗无效死亡。乙型脑炎仍是夏、秋季常见的中枢神经系统感染性疾病,流行区的儿童和青少年是易感人群。血液和脑脊液乙型脑炎特异性IgM抗体检查可明确诊断,对症支持治疗是治疗的关键。

团结 奉献 诚信 卓越——上海市(复旦大学附属)公共卫生中心简介

上海市（复旦大学附属）公共卫生中心（简称“中心”）是复旦大学第9所附属医院，系三级甲等；它是全国传染病医师进修教育培训基地、中国疾病预防控制中心艾滋病临床进修教育基地、上海市疾病预防控制中心的临床基地，也是上海市产科肝病监护中心和上海市传染科临床质量控制中心挂靠单位，系上海市传染病重点学科建设单位之一。

美国微生物学会杂志摘要

1．Albert Einstein医学院的Casadevail提出了对人类的微生物毒力组学的概念，他认为土壤中的微生物通过相互作用可获得在动物宿主中致病的特性。每一种在土壤中栖身的微生物都有一套综合性特性，例如获得铁或产生分解蛋白的酶。当各种土壤微生物间互相传递基因后，这些微生物则可以获得在动物及人群中传播的特性，其中尤为重要的是能在37℃生长。作者认为微生物的毒力组学应包括所有能在宿主中致病的毒力基因，但每一种微生物具有独特的毒力基因（或基因簇），从而可具有独特的致病特性。

《微生物与感染》征订启事

《微生物与感染》重点介绍国内外微生物学基础研究与临床相结合的研究成果和新进展,内容涉及与人类、动物和植物感染有关的微生物,如病毒、细菌、真菌、立克次体、螺旋体、支原体等的生物学及分子生物学特性,抗感染免疫,实验室诊断技术以及临床感染等方面的研究。主要栏目有特约专稿、论著、病例分析、综述等。可供从事微生物与感染的教学、科研、医疗等工作者参考。欢迎广大读者到当地邮局订阅。

2019冠状病毒病对肺外系统的影响及可能机制探讨

2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)导致的感染性疾病。SARS-CoV-2感染人体后除作用于肺部的SARS-CoV-2功能受体外,还可以作用于心脏、消化道、肝脏、肾脏、中枢系统的SARS-CoV-2功能受体,引起肺外脏器的损伤,诱发多器官功能衰竭,增加COVID-19的病死率。但目前对SARS-CoV-2引起肺外各脏器损伤的具体作用机制还不是很清楚,需要更多临床和实验室数据支持。通过检索COVID-19相关的文献,对SARS-CoV-2导致的肺外系统影响及其可能作用机制作一综述。

肺炎克雷伯菌Hfq蛋白特性及对耐药的影响

Hfq(host factor for RNA phage QB replicase)蛋白是一个全局性调节因子,广泛参与细菌生长、趋化、毒力、耐药及应对外界选择压力等方面的调节,但在肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)中的功能尚不清楚。本研究从临床病例中分离到59株KP,将其hfq基因与11例常见临床感染菌株hfq基因〔从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库下载〕进行了比较。所有hfq基因经EMBOSS Transeq翻译成氨基酸序列,用MAFFT软件进行多序列比对,并通过NCBI数据库中的保守结构域预测Hfq蛋白结构域。分别采用ESPript3.0、Phyre2分析Hfq蛋白的二、三级结构。59株KP中仅3株hfq基因的5个密码子位点存在差异,而其蛋白质氨基酸序列完全一致。KP与大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、痢疾志贺菌之间,Hfq蛋白的氨基酸序列相似度较高,主要区别在C末端上;与金黄色葡萄球菌、产单核细胞李斯特菌相比,KP Hfq蛋白在N末端和C末端上差别较大;所有菌株C末端均呈酸性。三级结构预测提示68(66.67%)个氨基酸与模板序列一致,较为保守的功能结构为54-VYKHAI-59序列。采用CRISPR/Cas9同源重组技术敲除KP的hfq基因,并对其进行药物敏感性测试,结果显示,基因敲除菌株对抗生素的耐药性较野生株有显著下降(P<0.05),差异有统计学意义,提示KP的Hfq蛋白氨基酸序列非常保守,可能参与了KP的耐药调节。